RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517680.5

HSF4-202, Transcript of heat shock transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene HSF4, Length 368 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF4-202ENST00000517680 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.28■■■□□ 2.76
HSF4-202ENST00000517680 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.74■■■□□ 2.19
HSF4-202ENST00000517680 ABCC9O60706 1549 aa28.19■■■□□ 2.1
HSF4-202ENST00000517680 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.1■■□□□ 1.93
HSF4-202ENST00000517680 NACADO15069 1562 aa27.07■■□□□ 1.92
HSF4-202ENST00000517680 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.93■■□□□ 1.9
HSF4-202ENST00000517680 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.91■■□□□ 1.9
HSF4-202ENST00000517680 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HSF4-202ENST00000517680 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.75■■□□□ 1.87
HSF4-202ENST00000517680 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.41■■□□□ 1.82
HSF4-202ENST00000517680 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
HSF4-202ENST00000517680 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.3■■□□□ 1.8
HSF4-202ENST00000517680 SCRIBQ14160 1630 aa26.17■■□□□ 1.78
HSF4-202ENST00000517680 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.08■■□□□ 1.77
HSF4-202ENST00000517680 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.01■■□□□ 1.75
HSF4-202ENST00000517680 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HSF4-202ENST00000517680 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.52■■□□□ 1.68
HSF4-202ENST00000517680 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.38■■□□□ 1.65
HSF4-202ENST00000517680 SMARCA4P51532 1647 aa25.04■■□□□ 1.6
HSF4-202ENST00000517680 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HSF4-202ENST00000517680 NCAPD3P42695 1498 aa25■■□□□ 1.59
HSF4-202ENST00000517680 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.97■■□□□ 1.59
HSF4-202ENST00000517680 SMARCA2P51531 1590 aa24.93■■□□□ 1.58
HSF4-202ENST00000517680 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.86■■□□□ 1.57
HSF4-202ENST00000517680 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.85■■□□□ 1.57
HSF4-202ENST00000517680 HMGXB3Q12766 1538 aa24.85■■□□□ 1.57
HSF4-202ENST00000517680 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HSF4-202ENST00000517680 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HSF4-202ENST00000517680 WIZO95785 1651 aa24.54■■□□□ 1.52
HSF4-202ENST00000517680 NESP48681 1621 aa24.36■■□□□ 1.49
HSF4-202ENST00000517680 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.33■■□□□ 1.48
HSF4-202ENST00000517680 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HSF4-202ENST00000517680 ERCC6Q03468 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
HSF4-202ENST00000517680 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.24■■□□□ 1.47
HSF4-202ENST00000517680 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.18■■□□□ 1.46
HSF4-202ENST00000517680 CUX2O14529 1486 aa24.16■■□□□ 1.46
HSF4-202ENST00000517680 CFTRP13569 1480 aa24.09■■□□□ 1.45
HSF4-202ENST00000517680 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HSF4-202ENST00000517680 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.05■■□□□ 1.44
HSF4-202ENST00000517680 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.03■■□□□ 1.44
HSF4-202ENST00000517680 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.94■■□□□ 1.42
HSF4-202ENST00000517680 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.93■■□□□ 1.42
HSF4-202ENST00000517680 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.93■■□□□ 1.42
HSF4-202ENST00000517680 WDR62O43379 1518 aa23.87■■□□□ 1.41
HSF4-202ENST00000517680 PRDM2Q13029 1718 aa23.8■■□□□ 1.4
HSF4-202ENST00000517680 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
HSF4-202ENST00000517680 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HSF4-202ENST00000517680 ABCC8Q09428 1581 aa23.57■■□□□ 1.36
HSF4-202ENST00000517680 TOPBP1Q92547 1522 aa23.54■■□□□ 1.36
HSF4-202ENST00000517680 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.54■■□□□ 1.36
HSF4-202ENST00000517680 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.52■■□□□ 1.36
HSF4-202ENST00000517680 IFT140Q96RY7 1462 aa23.45■■□□□ 1.34
HSF4-202ENST00000517680 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HSF4-202ENST00000517680 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
HSF4-202ENST00000517680 CUX1P39880 1505 aa23.32■■□□□ 1.32
HSF4-202ENST00000517680 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HSF4-202ENST00000517680 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.26■■□□□ 1.31
HSF4-202ENST00000517680 SOGA1O94964 1423 aa23.24■■□□□ 1.31
HSF4-202ENST00000517680 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HSF4-202ENST00000517680 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.22■■□□□ 1.31
HSF4-202ENST00000517680 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.32e-21■■□□□ 13
HSF4-202ENST00000517680 WDR97A6NE52 1622 aa23.15■■□□□ 1.3
HSF4-202ENST00000517680 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
HSF4-202ENST00000517680 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HSF4-202ENST00000517680 OSCARQ8IYS5 282 aa23.1■■□□□ 1.29
HSF4-202ENST00000517680 TOP2BQ02880 1626 aa23.1■■□□□ 1.29
HSF4-202ENST00000517680 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.08■■□□□ 1.29
HSF4-202ENST00000517680 SYNJ1O43426 1573 aa23.06■■□□□ 1.28
HSF4-202ENST00000517680 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.06■■□□□ 1.28
HSF4-202ENST00000517680 GRIN2BQ13224 1484 aa23■■□□□ 1.27
HSF4-202ENST00000517680 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.97■■□□□ 1.27
HSF4-202ENST00000517680 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.97■■□□□ 1.27
HSF4-202ENST00000517680 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.97■■□□□ 1.27
HSF4-202ENST00000517680 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HSF4-202ENST00000517680 CHD1O14646 1710 aa22.91■■□□□ 1.26
HSF4-202ENST00000517680 PBRM1Q86U86 1689 aa22.88■■□□□ 1.25
HSF4-202ENST00000517680 FBLN2P98095 1184 aa22.88■■□□□ 1.25
HSF4-202ENST00000517680 SYNJ2O15056 1496 aa22.86■■□□□ 1.25
HSF4-202ENST00000517680 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HSF4-202ENST00000517680 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
HSF4-202ENST00000517680 ADAMTS12P58397 1594 aa22.74■■□□□ 1.23
HSF4-202ENST00000517680 ARHGEF11O15085 1522 aa22.73■■□□□ 1.23
HSF4-202ENST00000517680 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.73■■□□□ 1.23
HSF4-202ENST00000517680 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
HSF4-202ENST00000517680 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
HSF4-202ENST00000517680 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
HSF4-202ENST00000517680 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.72■■□□□ 1.23
HSF4-202ENST00000517680 GRIN2AQ12879 1464 aa22.7■■□□□ 1.22
HSF4-202ENST00000517680 KIF27Q86VH2 1401 aa22.66■■□□□ 1.22
HSF4-202ENST00000517680 TRIM41Q8WV44 630 aa22.64■■□□□ 1.21
HSF4-202ENST00000517680 NUP160Q12769 1436 aa22.63■■□□□ 1.21
HSF4-202ENST00000517680 IGF1RP08069 1367 aa22.6■■□□□ 1.21
HSF4-202ENST00000517680 CEP170Q5SW79 1584 aa22.58■■□□□ 1.2
HSF4-202ENST00000517680 ARAP1Q96P48 1450 aa22.54■■□□□ 1.2
HSF4-202ENST00000517680 CUL7Q14999 1698 aa22.52■■□□□ 1.2
HSF4-202ENST00000517680 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.5■■□□□ 1.19
HSF4-202ENST00000517680 SHROOM2Q13796 1616 aa22.45■■□□□ 1.18
HSF4-202ENST00000517680 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.44■■□□□ 1.18
HSF4-202ENST00000517680 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.42■■□□□ 1.18
HSF4-202ENST00000517680 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms