RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515712.1

ACTBP2-201, Transcript of actin, beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene ACTBP2, Length 1,123 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP2-201ENST00000515712 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.1■■□□□ 1.93
ACTBP2-201ENST00000515712 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTBP2-201ENST00000515712 ABCC9O60706 1549 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTBP2-201ENST00000515712 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTBP2-201ENST00000515712 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTBP2-201ENST00000515712 NACADO15069 1562 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTBP2-201ENST00000515712 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTBP2-201ENST00000515712 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ACTBP2-201ENST00000515712 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTBP2-201ENST00000515712 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
ACTBP2-201ENST00000515712 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTBP2-201ENST00000515712 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTBP2-201ENST00000515712 SCRIBQ14160 1630 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTBP2-201ENST00000515712 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTBP2-201ENST00000515712 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTBP2-201ENST00000515712 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTBP2-201ENST00000515712 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTBP2-201ENST00000515712 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTBP2-201ENST00000515712 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTBP2-201ENST00000515712 SMARCA4P51532 1647 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTBP2-201ENST00000515712 SMARCA2P51531 1590 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTBP2-201ENST00000515712 NCAPD3P42695 1498 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTBP2-201ENST00000515712 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTBP2-201ENST00000515712 HMGXB3Q12766 1538 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTBP2-201ENST00000515712 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ACTBP2-201ENST00000515712 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTBP2-201ENST00000515712 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTBP2-201ENST00000515712 ERCC6Q03468 1493 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTBP2-201ENST00000515712 WIZO95785 1651 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTBP2-201ENST00000515712 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ACTBP2-201ENST00000515712 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTBP2-201ENST00000515712 NESP48681 1621 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTBP2-201ENST00000515712 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTBP2-201ENST00000515712 CUX2O14529 1486 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTBP2-201ENST00000515712 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTBP2-201ENST00000515712 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTBP2-201ENST00000515712 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTBP2-201ENST00000515712 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTBP2-201ENST00000515712 CFTRP13569 1480 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTBP2-201ENST00000515712 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTBP2-201ENST00000515712 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.21■□□□□ 0.83
ACTBP2-201ENST00000515712 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTBP2-201ENST00000515712 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTBP2-201ENST00000515712 WDR62O43379 1518 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTBP2-201ENST00000515712 PRDM2Q13029 1718 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTBP2-201ENST00000515712 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTBP2-201ENST00000515712 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTBP2-201ENST00000515712 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
ACTBP2-201ENST00000515712 ABCC8Q09428 1581 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTBP2-201ENST00000515712 TOPBP1Q92547 1522 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTBP2-201ENST00000515712 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTBP2-201ENST00000515712 IFT140Q96RY7 1462 aa19.79■□□□□ 0.76
ACTBP2-201ENST00000515712 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
ACTBP2-201ENST00000515712 SOGA1O94964 1423 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTBP2-201ENST00000515712 OSCARQ8IYS5 282 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTBP2-201ENST00000515712 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTBP2-201ENST00000515712 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTBP2-201ENST00000515712 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
ACTBP2-201ENST00000515712 CUX1P39880 1505 aa19.57■□□□□ 0.72
ACTBP2-201ENST00000515712 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTBP2-201ENST00000515712 WDR97A6NE52 1622 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTBP2-201ENST00000515712 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
ACTBP2-201ENST00000515712 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTBP2-201ENST00000515712 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
ACTBP2-201ENST00000515712 FBLN2P98095 1184 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTBP2-201ENST00000515712 GRIN2BQ13224 1484 aa19.41■□□□□ 0.7
ACTBP2-201ENST00000515712 TOP2BQ02880 1626 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTBP2-201ENST00000515712 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTBP2-201ENST00000515712 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.38■□□□□ 0.69
ACTBP2-201ENST00000515712 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
ACTBP2-201ENST00000515712 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP2-201ENST00000515712 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.37■□□□□ 0.69
ACTBP2-201ENST00000515712 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
ACTBP2-201ENST00000515712 CHD1O14646 1710 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTBP2-201ENST00000515712 SYNJ1O43426 1573 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTBP2-201ENST00000515712 TRIM41Q8WV44 630 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTBP2-201ENST00000515712 PBRM1Q86U86 1689 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTBP2-201ENST00000515712 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTBP2-201ENST00000515712 SYNJ2O15056 1496 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTBP2-201ENST00000515712 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTBP2-201ENST00000515712 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTBP2-201ENST00000515712 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTBP2-201ENST00000515712 ARHGEF11O15085 1522 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTBP2-201ENST00000515712 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTBP2-201ENST00000515712 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTBP2-201ENST00000515712 ADAMTS12P58397 1594 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTBP2-201ENST00000515712 GRIN2AQ12879 1464 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTBP2-201ENST00000515712 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTBP2-201ENST00000515712 KIF27Q86VH2 1401 aa19.12■□□□□ 0.65
ACTBP2-201ENST00000515712 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTBP2-201ENST00000515712 NUP160Q12769 1436 aa19.02■□□□□ 0.64
ACTBP2-201ENST00000515712 ARAP1Q96P48 1450 aa19.02■□□□□ 0.63
ACTBP2-201ENST00000515712 CUL7Q14999 1698 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTBP2-201ENST00000515712 CEP170Q5SW79 1584 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTBP2-201ENST00000515712 IGF1RP08069 1367 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTBP2-201ENST00000515712 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.91■□□□□ 0.62
ACTBP2-201ENST00000515712 SHROOM2Q13796 1616 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTBP2-201ENST00000515712 JPH4Q96JJ6 628 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTBP2-201ENST00000515712 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.86■□□□□ 0.61
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