RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515141.5

MTTP-211, Transcript of microsomal triglyceride transfer protein, humanhuman

TSL 4

Gene MTTP, Length 608 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTP-211ENST00000515141 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.43■■■■□ 3.9
MTTP-211ENST00000515141 ABCC9O60706 1549 aa35.66■■■■□ 3.3
MTTP-211ENST00000515141 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.52■■■■□ 3.28
MTTP-211ENST00000515141 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.85■■■■□ 3.01
MTTP-211ENST00000515141 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.71■■■□□ 2.99
MTTP-211ENST00000515141 NACADO15069 1562 aa33.58■■■□□ 2.97
MTTP-211ENST00000515141 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.22■■■□□ 2.91
MTTP-211ENST00000515141 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.1■■■□□ 2.89
MTTP-211ENST00000515141 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.1■■■□□ 2.89
MTTP-211ENST00000515141 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.09■■■□□ 2.89
MTTP-211ENST00000515141 BICRAQ9NZM4 1560 aa33■■■□□ 2.87
MTTP-211ENST00000515141 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
MTTP-211ENST00000515141 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.59■■■□□ 2.81
MTTP-211ENST00000515141 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.47■■■□□ 2.79
MTTP-211ENST00000515141 SCRIBQ14160 1630 aa32.31■■■□□ 2.76
MTTP-211ENST00000515141 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.26■■■□□ 2.75
MTTP-211ENST00000515141 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.16■■■□□ 2.74
MTTP-211ENST00000515141 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
MTTP-211ENST00000515141 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.05■■■□□ 2.56
MTTP-211ENST00000515141 NCAPD3P42695 1498 aa31.01■■■□□ 2.56
MTTP-211ENST00000515141 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.89■■■□□ 2.54
MTTP-211ENST00000515141 CUX2O14529 1486 aa30.85■■■□□ 2.53
MTTP-211ENST00000515141 SMARCA4P51532 1647 aa30.83■■■□□ 2.53
MTTP-211ENST00000515141 HMGXB3Q12766 1538 aa30.8■■■□□ 2.52
MTTP-211ENST00000515141 SMARCA2P51531 1590 aa30.75■■■□□ 2.51
MTTP-211ENST00000515141 ERCC6Q03468 1493 aa30.74■■■□□ 2.51
MTTP-211ENST00000515141 NESP48681 1621 aa30.62■■■□□ 2.49
MTTP-211ENST00000515141 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
MTTP-211ENST00000515141 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.58■■■□□ 2.49
MTTP-211ENST00000515141 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
MTTP-211ENST00000515141 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
MTTP-211ENST00000515141 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.4■■■□□ 2.46
MTTP-211ENST00000515141 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.35■■■□□ 2.45
MTTP-211ENST00000515141 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.24■■■□□ 2.43
MTTP-211ENST00000515141 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.1■■■□□ 2.41
MTTP-211ENST00000515141 WIZO95785 1651 aa30.01■■■□□ 2.4
MTTP-211ENST00000515141 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.01■■■□□ 2.39
MTTP-211ENST00000515141 WDR62O43379 1518 aa29.92■■■□□ 2.38
MTTP-211ENST00000515141 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.92■■■□□ 2.38
MTTP-211ENST00000515141 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.73■■■□□ 2.35
MTTP-211ENST00000515141 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.69■■■□□ 2.34
MTTP-211ENST00000515141 CFTRP13569 1480 aa29.68■■■□□ 2.34
MTTP-211ENST00000515141 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
MTTP-211ENST00000515141 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
MTTP-211ENST00000515141 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
MTTP-211ENST00000515141 TRIM41Q8WV44 630 aa29.48■■■□□ 2.31
MTTP-211ENST00000515141 PRDM2Q13029 1718 aa29.4■■■□□ 2.3
MTTP-211ENST00000515141 OSCARQ8IYS5 282 aa29.26■■■□□ 2.27
MTTP-211ENST00000515141 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.25■■■□□ 2.27
MTTP-211ENST00000515141 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
MTTP-211ENST00000515141 IFT140Q96RY7 1462 aa29.15■■■□□ 2.26
MTTP-211ENST00000515141 TOPBP1Q92547 1522 aa29.13■■■□□ 2.25
MTTP-211ENST00000515141 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.09■■■□□ 2.25
MTTP-211ENST00000515141 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.09■■■□□ 2.25
MTTP-211ENST00000515141 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.09■■■□□ 2.25
MTTP-211ENST00000515141 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
MTTP-211ENST00000515141 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.01■■■□□ 2.23
MTTP-211ENST00000515141 ABCC8Q09428 1581 aa28.96■■■□□ 2.23
MTTP-211ENST00000515141 ARHGEF11O15085 1522 aa28.96■■■□□ 2.23
MTTP-211ENST00000515141 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
MTTP-211ENST00000515141 CHD1O14646 1710 aa28.86■■■□□ 2.21
MTTP-211ENST00000515141 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
MTTP-211ENST00000515141 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
MTTP-211ENST00000515141 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.7■■■□□ 2.18
MTTP-211ENST00000515141 ARAP1Q96P48 1450 aa28.68■■■□□ 2.18
MTTP-211ENST00000515141 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.6■■■□□ 2.17
MTTP-211ENST00000515141 WDR97A6NE52 1622 aa28.6■■■□□ 2.17
MTTP-211ENST00000515141 SOGA1O94964 1423 aa28.6■■■□□ 2.17
MTTP-211ENST00000515141 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.59■■■□□ 2.17
MTTP-211ENST00000515141 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
MTTP-211ENST00000515141 CUX1P39880 1505 aa28.58■■■□□ 2.17
MTTP-211ENST00000515141 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.56■■■□□ 2.16
MTTP-211ENST00000515141 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.55■■■□□ 2.16
MTTP-211ENST00000515141 FBLN2P98095 1184 aa28.52■■■□□ 2.16
MTTP-211ENST00000515141 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
MTTP-211ENST00000515141 GRIN2BQ13224 1484 aa28.41■■■□□ 2.14
MTTP-211ENST00000515141 SYNJ1O43426 1573 aa28.41■■■□□ 2.14
MTTP-211ENST00000515141 SYNJ2O15056 1496 aa28.37■■■□□ 2.13
MTTP-211ENST00000515141 PBRM1Q86U86 1689 aa28.36■■■□□ 2.13
MTTP-211ENST00000515141 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.31■■■□□ 2.12
MTTP-211ENST00000515141 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
MTTP-211ENST00000515141 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.28■■■□□ 2.12
MTTP-211ENST00000515141 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
MTTP-211ENST00000515141 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.27■■■□□ 2.12
MTTP-211ENST00000515141 ADAMTS12P58397 1594 aa28.1■■■□□ 2.09
MTTP-211ENST00000515141 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.09■■■□□ 2.09
MTTP-211ENST00000515141 GRIN2AQ12879 1464 aa28.08■■■□□ 2.09
MTTP-211ENST00000515141 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.07■■■□□ 2.08
MTTP-211ENST00000515141 CEP170Q5SW79 1584 aa28.05■■■□□ 2.08
MTTP-211ENST00000515141 TOP2BQ02880 1626 aa28.04■■■□□ 2.08
MTTP-211ENST00000515141 NUP160Q12769 1436 aa28.03■■■□□ 2.08
MTTP-211ENST00000515141 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
MTTP-211ENST00000515141 SHROOM2Q13796 1616 aa27.98■■■□□ 2.07
MTTP-211ENST00000515141 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
MTTP-211ENST00000515141 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.92■■■□□ 2.06
MTTP-211ENST00000515141 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.9■■■□□ 2.06
MTTP-211ENST00000515141 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.72■■■□□ 2.03
MTTP-211ENST00000515141 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.72■■■□□ 2.03
MTTP-211ENST00000515141 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
MTTP-211ENST00000515141 JPH4Q96JJ6 628 aa27.59■■■□□ 2.01
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