RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513575.5

CENPH-204, Transcript of centromere protein H, humanhuman

TSL 5

Gene CENPH, Length 437 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPH-204ENST00000513575 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.32■■■■■ 5.49
CENPH-204ENST00000513575 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.02■■■■■ 4.64
CENPH-204ENST00000513575 ABCC9O60706 1549 aa43.64■■■■■ 4.58
CENPH-204ENST00000513575 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.77■■■■■ 4.28
CENPH-204ENST00000513575 NACADO15069 1562 aa41.62■■■■■ 4.25
CENPH-204ENST00000513575 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.47■■■■■ 4.23
CENPH-204ENST00000513575 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.26■■■■■ 4.2
CENPH-204ENST00000513575 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CENPH-204ENST00000513575 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.83■■■■■ 4.13
CENPH-204ENST00000513575 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
CENPH-204ENST00000513575 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.7■■■■■ 4.11
CENPH-204ENST00000513575 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.64■■■■■ 4.1
CENPH-204ENST00000513575 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.49■■■■■ 4.07
CENPH-204ENST00000513575 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.13■■■■■ 4.02
CENPH-204ENST00000513575 SCRIBQ14160 1630 aa40.05■■■■■ 4
CENPH-204ENST00000513575 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
CENPH-204ENST00000513575 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.44■■■■□ 3.9
CENPH-204ENST00000513575 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.33■■■■□ 3.89
CENPH-204ENST00000513575 NCAPD3P42695 1498 aa38.47■■■■□ 3.75
CENPH-204ENST00000513575 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.35■■■■□ 3.73
CENPH-204ENST00000513575 SMARCA4P51532 1647 aa38.31■■■■□ 3.72
CENPH-204ENST00000513575 SMARCA2P51531 1590 aa38.26■■■■□ 3.72
CENPH-204ENST00000513575 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
CENPH-204ENST00000513575 HMGXB3Q12766 1538 aa38.13■■■■□ 3.69
CENPH-204ENST00000513575 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.02■■■■□ 3.68
CENPH-204ENST00000513575 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
CENPH-204ENST00000513575 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.95■■■■□ 3.67
CENPH-204ENST00000513575 ERCC6Q03468 1493 aa37.69■■■■□ 3.62
CENPH-204ENST00000513575 NESP48681 1621 aa37.58■■■■□ 3.61
CENPH-204ENST00000513575 CUX2O14529 1486 aa37.57■■■■□ 3.6
CENPH-204ENST00000513575 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.46■■■■□ 3.59
CENPH-204ENST00000513575 WIZO95785 1651 aa37.44■■■■□ 3.58
CENPH-204ENST00000513575 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
CENPH-204ENST00000513575 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.32■■■■□ 3.57
CENPH-204ENST00000513575 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.31■■■■□ 3.56
CENPH-204ENST00000513575 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.19■■■■□ 3.54
CENPH-204ENST00000513575 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
CENPH-204ENST00000513575 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
CENPH-204ENST00000513575 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.02■■■■□ 3.52
CENPH-204ENST00000513575 CFTRP13569 1480 aa36.94■■■■□ 3.5
CENPH-204ENST00000513575 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.88■■■■□ 3.49
CENPH-204ENST00000513575 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.82■■■■□ 3.48
CENPH-204ENST00000513575 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.8■■■■□ 3.48
CENPH-204ENST00000513575 WDR62O43379 1518 aa36.76■■■■□ 3.48
CENPH-204ENST00000513575 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.69■■■■□ 3.46
CENPH-204ENST00000513575 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
CENPH-204ENST00000513575 PRDM2Q13029 1718 aa36.4■■■■□ 3.42
CENPH-204ENST00000513575 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CENPH-204ENST00000513575 ABCC8Q09428 1581 aa36.21■■■■□ 3.39
CENPH-204ENST00000513575 TOPBP1Q92547 1522 aa36.14■■■■□ 3.38
CENPH-204ENST00000513575 IFT140Q96RY7 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
CENPH-204ENST00000513575 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.03■■■■□ 3.36
CENPH-204ENST00000513575 OSCARQ8IYS5 282 aa35.99■■■■□ 3.35
CENPH-204ENST00000513575 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
CENPH-204ENST00000513575 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CENPH-204ENST00000513575 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
CENPH-204ENST00000513575 SOGA1O94964 1423 aa35.71■■■■□ 3.31
CENPH-204ENST00000513575 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
CENPH-204ENST00000513575 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.69■■■■□ 3.3
CENPH-204ENST00000513575 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.64■■■■□ 3.3
CENPH-204ENST00000513575 CUX1P39880 1505 aa35.62■■■■□ 3.29
CENPH-204ENST00000513575 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.6■■■■□ 3.29
CENPH-204ENST00000513575 TRIM41Q8WV44 630 aa35.57■■■■□ 3.28
CENPH-204ENST00000513575 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
CENPH-204ENST00000513575 WDR97A6NE52 1622 aa35.51■■■■□ 3.28
CENPH-204ENST00000513575 FBLN2P98095 1184 aa35.41■■■■□ 3.26
CENPH-204ENST00000513575 GRIN2BQ13224 1484 aa35.34■■■■□ 3.25
CENPH-204ENST00000513575 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.3■■■■□ 3.24
CENPH-204ENST00000513575 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
CENPH-204ENST00000513575 CHD1O14646 1710 aa35.29■■■■□ 3.24
CENPH-204ENST00000513575 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.29■■■■□ 3.24
CENPH-204ENST00000513575 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.28■■■■□ 3.24
CENPH-204ENST00000513575 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.28■■■■□ 3.24
CENPH-204ENST00000513575 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.28■■■■□ 3.24
CENPH-204ENST00000513575 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
CENPH-204ENST00000513575 ARHGEF11O15085 1522 aa35.26■■■■□ 3.23
CENPH-204ENST00000513575 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
CENPH-204ENST00000513575 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.25■■■■□ 3.23
CENPH-204ENST00000513575 TOP2BQ02880 1626 aa35.17■■■■□ 3.22
CENPH-204ENST00000513575 SYNJ2O15056 1496 aa35.16■■■■□ 3.22
CENPH-204ENST00000513575 SYNJ1O43426 1573 aa35.15■■■■□ 3.22
CENPH-204ENST00000513575 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.14■■■■□ 3.22
CENPH-204ENST00000513575 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.1■■■■□ 3.21
CENPH-204ENST00000513575 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.06■■■■□ 3.2
CENPH-204ENST00000513575 PBRM1Q86U86 1689 aa35.05■■■■□ 3.2
CENPH-204ENST00000513575 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.02■■■■□ 3.2
CENPH-204ENST00000513575 ARAP1Q96P48 1450 aa34.93■■■■□ 3.18
CENPH-204ENST00000513575 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.86■■■■□ 3.17
CENPH-204ENST00000513575 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.86■■■■□ 3.17
CENPH-204ENST00000513575 GRIN2AQ12879 1464 aa34.84■■■■□ 3.17
CENPH-204ENST00000513575 ADAMTS12P58397 1594 aa34.8■■■■□ 3.16
CENPH-204ENST00000513575 NUP160Q12769 1436 aa34.75■■■■□ 3.15
CENPH-204ENST00000513575 CEP170Q5SW79 1584 aa34.63■■■■□ 3.13
CENPH-204ENST00000513575 KIF27Q86VH2 1401 aa34.58■■■■□ 3.13
CENPH-204ENST00000513575 IGF1RP08069 1367 aa34.56■■■■□ 3.12
CENPH-204ENST00000513575 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
CENPH-204ENST00000513575 SHROOM2Q13796 1616 aa34.48■■■■□ 3.11
CENPH-204ENST00000513575 JPH4Q96JJ6 628 aa34.48■■■■□ 3.11
CENPH-204ENST00000513575 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.44■■■■□ 3.1
CENPH-204ENST00000513575 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
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