RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513460.5

ANKRD13D-214, Transcript of ankyrin repeat domain 13D, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD13D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13D-214ENST00000513460 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.24■■■■■ 6.43
ANKRD13D-214ENST00000513460 ABCC9O60706 1549 aa49.78■■■■■ 5.56
ANKRD13D-214ENST00000513460 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.48■■■■■ 5.51
ANKRD13D-214ENST00000513460 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.22■■■■■ 5.15
ANKRD13D-214ENST00000513460 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.88■■■■■ 5.1
ANKRD13D-214ENST00000513460 NACADO15069 1562 aa46.87■■■■■ 5.09
ANKRD13D-214ENST00000513460 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.81■■■■■ 5.08
ANKRD13D-214ENST00000513460 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.41■■■■■ 5.02
ANKRD13D-214ENST00000513460 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.15■■■■■ 4.98
ANKRD13D-214ENST00000513460 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.05■■■■■ 4.96
ANKRD13D-214ENST00000513460 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.86■■■■■ 4.93
ANKRD13D-214ENST00000513460 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
ANKRD13D-214ENST00000513460 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.55■■■■■ 4.88
ANKRD13D-214ENST00000513460 SCRIBQ14160 1630 aa45.23■■■■■ 4.83
ANKRD13D-214ENST00000513460 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.17■■■■■ 4.82
ANKRD13D-214ENST00000513460 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.87■■■■■ 4.77
ANKRD13D-214ENST00000513460 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.82■■■■■ 4.77
ANKRD13D-214ENST00000513460 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
ANKRD13D-214ENST00000513460 NCAPD3P42695 1498 aa43.32■■■■■ 4.52
ANKRD13D-214ENST00000513460 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.2■■■■■ 4.51
ANKRD13D-214ENST00000513460 SMARCA4P51532 1647 aa43.08■■■■■ 4.49
ANKRD13D-214ENST00000513460 SMARCA2P51531 1590 aa43.02■■■■■ 4.48
ANKRD13D-214ENST00000513460 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.99■■■■■ 4.47
ANKRD13D-214ENST00000513460 ERCC6Q03468 1493 aa42.97■■■■■ 4.47
ANKRD13D-214ENST00000513460 HMGXB3Q12766 1538 aa42.93■■■■■ 4.46
ANKRD13D-214ENST00000513460 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
ANKRD13D-214ENST00000513460 CUX2O14529 1486 aa42.83■■■■■ 4.45
ANKRD13D-214ENST00000513460 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
ANKRD13D-214ENST00000513460 NESP48681 1621 aa42.73■■■■■ 4.43
ANKRD13D-214ENST00000513460 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.61■■■■■ 4.41
ANKRD13D-214ENST00000513460 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.61■■■■■ 4.41
ANKRD13D-214ENST00000513460 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.3■■■■■ 4.36
ANKRD13D-214ENST00000513460 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
ANKRD13D-214ENST00000513460 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.13■■■■■ 4.34
ANKRD13D-214ENST00000513460 WIZO95785 1651 aa42.05■■■■■ 4.32
ANKRD13D-214ENST00000513460 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.05■■■■■ 4.32
ANKRD13D-214ENST00000513460 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.03■■■■■ 4.32
ANKRD13D-214ENST00000513460 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.78■■■■■ 4.28
ANKRD13D-214ENST00000513460 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
ANKRD13D-214ENST00000513460 WDR62O43379 1518 aa41.63■■■■■ 4.25
ANKRD13D-214ENST00000513460 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.6■■■■■ 4.25
ANKRD13D-214ENST00000513460 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.56■■■■■ 4.24
ANKRD13D-214ENST00000513460 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
ANKRD13D-214ENST00000513460 CFTRP13569 1480 aa41.51■■■■■ 4.24
ANKRD13D-214ENST00000513460 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
ANKRD13D-214ENST00000513460 TRIM41Q8WV44 630 aa41.18■■■■■ 4.18
ANKRD13D-214ENST00000513460 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.09■■■■■ 4.17
ANKRD13D-214ENST00000513460 OSCARQ8IYS5 282 aa40.97■■■■■ 4.15
ANKRD13D-214ENST00000513460 PRDM2Q13029 1718 aa40.9■■■■■ 4.14
ANKRD13D-214ENST00000513460 IFT140Q96RY7 1462 aa40.76■■■■■ 4.12
ANKRD13D-214ENST00000513460 TOPBP1Q92547 1522 aa40.75■■■■■ 4.11
ANKRD13D-214ENST00000513460 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
ANKRD13D-214ENST00000513460 ABCC8Q09428 1581 aa40.6■■■■■ 4.09
ANKRD13D-214ENST00000513460 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.55■■■■■ 4.08
ANKRD13D-214ENST00000513460 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
ANKRD13D-214ENST00000513460 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.062e-6■■■■■ 26.9
ANKRD13D-214ENST00000513460 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
ANKRD13D-214ENST00000513460 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
ANKRD13D-214ENST00000513460 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
ANKRD13D-214ENST00000513460 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
ANKRD13D-214ENST00000513460 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
ANKRD13D-214ENST00000513460 ARHGEF11O15085 1522 aa40.25■■■■■ 4.03
ANKRD13D-214ENST00000513460 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.24■■■■■ 4.03
ANKRD13D-214ENST00000513460 FBLN2P98095 1184 aa40.22■■■■■ 4.03
ANKRD13D-214ENST00000513460 SOGA1O94964 1423 aa40.19■■■■■ 4.02
ANKRD13D-214ENST00000513460 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
ANKRD13D-214ENST00000513460 CHD1O14646 1710 aa40.11■■■■■ 4.01
ANKRD13D-214ENST00000513460 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.08■■■■■ 4.01
ANKRD13D-214ENST00000513460 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.07■■■■■ 4.01
ANKRD13D-214ENST00000513460 CUX1P39880 1505 aa40.02■■■■■ 4
ANKRD13D-214ENST00000513460 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.95■■■■□ 3.99
ANKRD13D-214ENST00000513460 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
ANKRD13D-214ENST00000513460 ARAP1Q96P48 1450 aa39.87■■■■□ 3.97
ANKRD13D-214ENST00000513460 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
ANKRD13D-214ENST00000513460 WDR97A6NE52 1622 aa39.84■■■■□ 3.97
ANKRD13D-214ENST00000513460 GRIN2BQ13224 1484 aa39.81■■■■□ 3.96
ANKRD13D-214ENST00000513460 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
ANKRD13D-214ENST00000513460 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.7■■■■□ 3.95
ANKRD13D-214ENST00000513460 SYNJ2O15056 1496 aa39.68■■■■□ 3.94
ANKRD13D-214ENST00000513460 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
ANKRD13D-214ENST00000513460 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.67■■■■□ 3.94
ANKRD13D-214ENST00000513460 SYNJ1O43426 1573 aa39.67■■■■□ 3.94
ANKRD13D-214ENST00000513460 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.58■■■■□ 3.93
ANKRD13D-214ENST00000513460 PBRM1Q86U86 1689 aa39.54■■■■□ 3.92
ANKRD13D-214ENST00000513460 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.5■■■■□ 3.91
ANKRD13D-214ENST00000513460 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.46■■■■□ 3.91
ANKRD13D-214ENST00000513460 TOP2BQ02880 1626 aa39.3■■■■□ 3.88
ANKRD13D-214ENST00000513460 GRIN2AQ12879 1464 aa39.3■■■■□ 3.88
ANKRD13D-214ENST00000513460 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.27■■■■□ 3.88
ANKRD13D-214ENST00000513460 ADAMTS12P58397 1594 aa39.22■■■■□ 3.87
ANKRD13D-214ENST00000513460 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.16■■■■□ 3.86
ANKRD13D-214ENST00000513460 NUP160Q12769 1436 aa39.15■■■■□ 3.86
ANKRD13D-214ENST00000513460 CEP170Q5SW79 1584 aa39.14■■■■□ 3.86
ANKRD13D-214ENST00000513460 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.14■■■■□ 3.86
ANKRD13D-214ENST00000513460 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.06■■■■□ 3.84
ANKRD13D-214ENST00000513460 SHROOM2Q13796 1616 aa38.92■■■■□ 3.82
ANKRD13D-214ENST00000513460 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
ANKRD13D-214ENST00000513460 JPH4Q96JJ6 628 aa38.83■■■■□ 3.81
ANKRD13D-214ENST00000513460 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.67■■■■□ 3.78
ANKRD13D-214ENST00000513460 IGF1RP08069 1367 aa38.63■■■■□ 3.77
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