RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511610.5

MTTP-209, Transcript of microsomal triglyceride transfer protein, humanhuman

TSL 4

Gene MTTP, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTP-209ENST00000511610 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.07■■■■□ 3.04
MTTP-209ENST00000511610 ABCC9O60706 1549 aa30.81■■■□□ 2.52
MTTP-209ENST00000511610 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.56■■■□□ 2.48
MTTP-209ENST00000511610 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.26■■■□□ 2.27
MTTP-209ENST00000511610 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.22■■■□□ 2.27
MTTP-209ENST00000511610 NACADO15069 1562 aa29.02■■■□□ 2.24
MTTP-209ENST00000511610 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.74■■■□□ 2.19
MTTP-209ENST00000511610 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
MTTP-209ENST00000511610 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.64■■■□□ 2.18
MTTP-209ENST00000511610 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.49■■■□□ 2.15
MTTP-209ENST00000511610 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.46■■■□□ 2.15
MTTP-209ENST00000511610 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
MTTP-209ENST00000511610 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.18■■■□□ 2.1
MTTP-209ENST00000511610 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.07■■■□□ 2.08
MTTP-209ENST00000511610 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.82■■■□□ 2.04
MTTP-209ENST00000511610 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.82■■■□□ 2.04
MTTP-209ENST00000511610 SCRIBQ14160 1630 aa27.79■■■□□ 2.04
MTTP-209ENST00000511610 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
MTTP-209ENST00000511610 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.02■■□□□ 1.92
MTTP-209ENST00000511610 NCAPD3P42695 1498 aa26.88■■□□□ 1.89
MTTP-209ENST00000511610 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.73■■□□□ 1.87
MTTP-209ENST00000511610 CUX2O14529 1486 aa26.69■■□□□ 1.86
MTTP-209ENST00000511610 HMGXB3Q12766 1538 aa26.58■■□□□ 1.85
MTTP-209ENST00000511610 SMARCA2P51531 1590 aa26.58■■□□□ 1.85
MTTP-209ENST00000511610 ERCC6Q03468 1493 aa26.57■■□□□ 1.84
MTTP-209ENST00000511610 SMARCA4P51532 1647 aa26.56■■□□□ 1.84
MTTP-209ENST00000511610 NESP48681 1621 aa26.44■■□□□ 1.82
MTTP-209ENST00000511610 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
MTTP-209ENST00000511610 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.39■■□□□ 1.82
MTTP-209ENST00000511610 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
MTTP-209ENST00000511610 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.24■■□□□ 1.79
MTTP-209ENST00000511610 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.19■■□□□ 1.78
MTTP-209ENST00000511610 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
MTTP-209ENST00000511610 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.08■■□□□ 1.77
MTTP-209ENST00000511610 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.03■■□□□ 1.76
MTTP-209ENST00000511610 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.98■■□□□ 1.75
MTTP-209ENST00000511610 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.85■■□□□ 1.73
MTTP-209ENST00000511610 WIZO95785 1651 aa25.83■■□□□ 1.73
MTTP-209ENST00000511610 WDR62O43379 1518 aa25.82■■□□□ 1.72
MTTP-209ENST00000511610 CFTRP13569 1480 aa25.69■■□□□ 1.7
MTTP-209ENST00000511610 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.68■■□□□ 1.7
MTTP-209ENST00000511610 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.67■■□□□ 1.7
MTTP-209ENST00000511610 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
MTTP-209ENST00000511610 TRIM41Q8WV44 630 aa25.57■■□□□ 1.68
MTTP-209ENST00000511610 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
MTTP-209ENST00000511610 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
MTTP-209ENST00000511610 OSCARQ8IYS5 282 aa25.46■■□□□ 1.67
MTTP-209ENST00000511610 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.29■■□□□ 1.64
MTTP-209ENST00000511610 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
MTTP-209ENST00000511610 IFT140Q96RY7 1462 aa25.21■■□□□ 1.63
MTTP-209ENST00000511610 PRDM2Q13029 1718 aa25.19■■□□□ 1.62
MTTP-209ENST00000511610 TOPBP1Q92547 1522 aa25.17■■□□□ 1.62
MTTP-209ENST00000511610 ABCC8Q09428 1581 aa25.1■■□□□ 1.61
MTTP-209ENST00000511610 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.05■■□□□ 1.6
MTTP-209ENST00000511610 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.05■■□□□ 1.6
MTTP-209ENST00000511610 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.05■■□□□ 1.6
MTTP-209ENST00000511610 ARHGEF11O15085 1522 aa25.02■■□□□ 1.6
MTTP-209ENST00000511610 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.01■■□□□ 1.59
MTTP-209ENST00000511610 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
MTTP-209ENST00000511610 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
MTTP-209ENST00000511610 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
MTTP-209ENST00000511610 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
MTTP-209ENST00000511610 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.85■■□□□ 1.57
MTTP-209ENST00000511610 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.81■■□□□ 1.56
MTTP-209ENST00000511610 SOGA1O94964 1423 aa24.78■■□□□ 1.56
MTTP-209ENST00000511610 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
MTTP-209ENST00000511610 CHD1O14646 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
MTTP-209ENST00000511610 ARAP1Q96P48 1450 aa24.77■■□□□ 1.56
MTTP-209ENST00000511610 FBLN2P98095 1184 aa24.75■■□□□ 1.55
MTTP-209ENST00000511610 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.68■■□□□ 1.54
MTTP-209ENST00000511610 WDR97A6NE52 1622 aa24.66■■□□□ 1.54
MTTP-209ENST00000511610 CUX1P39880 1505 aa24.66■■□□□ 1.54
MTTP-209ENST00000511610 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.64■■□□□ 1.54
MTTP-209ENST00000511610 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.61■■□□□ 1.53
MTTP-209ENST00000511610 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
MTTP-209ENST00000511610 GRIN2BQ13224 1484 aa24.58■■□□□ 1.53
MTTP-209ENST00000511610 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
MTTP-209ENST00000511610 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
MTTP-209ENST00000511610 SYNJ2O15056 1496 aa24.53■■□□□ 1.52
MTTP-209ENST00000511610 SYNJ1O43426 1573 aa24.5■■□□□ 1.51
MTTP-209ENST00000511610 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.46■■□□□ 1.51
MTTP-209ENST00000511610 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.44■■□□□ 1.5
MTTP-209ENST00000511610 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.36■■□□□ 1.49
MTTP-209ENST00000511610 PBRM1Q86U86 1689 aa24.33■■□□□ 1.49
MTTP-209ENST00000511610 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
MTTP-209ENST00000511610 GRIN2AQ12879 1464 aa24.26■■□□□ 1.47
MTTP-209ENST00000511610 NUP160Q12769 1436 aa24.26■■□□□ 1.47
MTTP-209ENST00000511610 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
MTTP-209ENST00000511610 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.2■■□□□ 1.46
MTTP-209ENST00000511610 ADAMTS12P58397 1594 aa24.18■■□□□ 1.46
MTTP-209ENST00000511610 TOP2BQ02880 1626 aa24.17■■□□□ 1.46
MTTP-209ENST00000511610 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.17■■□□□ 1.46
MTTP-209ENST00000511610 CEP170Q5SW79 1584 aa24.16■■□□□ 1.46
MTTP-209ENST00000511610 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.13■■□□□ 1.45
MTTP-209ENST00000511610 SHROOM2Q13796 1616 aa24.11■■□□□ 1.45
MTTP-209ENST00000511610 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
MTTP-209ENST00000511610 JPH4Q96JJ6 628 aa23.99■■□□□ 1.43
MTTP-209ENST00000511610 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
MTTP-209ENST00000511610 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
MTTP-209ENST00000511610 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.84■■□□□ 1.41
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