RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.53■■■■■ 5.68
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.68■■■■■ 4.74
ACTN3-202ENST00000511191 ABCC9O60706 1549 aa43.09■■■■■ 4.49
ACTN3-202ENST00000511191 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
ACTN3-202ENST00000511191 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.9■■■■■ 4.3
ACTN3-202ENST00000511191 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.9■■■■■ 4.3
ACTN3-202ENST00000511191 NACADO15069 1562 aa41.88■■■■■ 4.3
ACTN3-202ENST00000511191 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.83■■■■■ 4.29
ACTN3-202ENST00000511191 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.76■■■■■ 4.28
ACTN3-202ENST00000511191 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.76■■■■■ 4.12
ACTN3-202ENST00000511191 SCRIBQ14160 1630 aa40.73■■■■■ 4.11
ACTN3-202ENST00000511191 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.48■■■■■ 4.07
ACTN3-202ENST00000511191 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
ACTN3-202ENST00000511191 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.2■■■■■ 4.03
ACTN3-202ENST00000511191 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
ACTN3-202ENST00000511191 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.26■■■■□ 3.88
ACTN3-202ENST00000511191 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
ACTN3-202ENST00000511191 SMARCA4P51532 1647 aa39.07■■■■□ 3.84
ACTN3-202ENST00000511191 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.05■■■■□ 3.84
ACTN3-202ENST00000511191 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.03■■■■□ 3.84
ACTN3-202ENST00000511191 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.92■■■■□ 3.82
ACTN3-202ENST00000511191 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.74■■■■□ 3.79
ACTN3-202ENST00000511191 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.73■■■■□ 3.79
ACTN3-202ENST00000511191 SMARCA2P51531 1590 aa38.71■■■■□ 3.79
ACTN3-202ENST00000511191 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
ACTN3-202ENST00000511191 NCAPD3P42695 1498 aa38.66■■■■□ 3.78
ACTN3-202ENST00000511191 HMGXB3Q12766 1538 aa38.52■■■■□ 3.76
ACTN3-202ENST00000511191 WIZO95785 1651 aa38.49■■■■□ 3.75
ACTN3-202ENST00000511191 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
ACTN3-202ENST00000511191 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
ACTN3-202ENST00000511191 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.71■■■■□ 3.63
ACTN3-202ENST00000511191 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.54■■■■□ 3.6
ACTN3-202ENST00000511191 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.51■■■■□ 3.6
ACTN3-202ENST00000511191 NESP48681 1621 aa37.47■■■■□ 3.59
ACTN3-202ENST00000511191 CFTRP13569 1480 aa37.45■■■■□ 3.59
ACTN3-202ENST00000511191 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.24■■■■□ 3.55
ACTN3-202ENST00000511191 PRDM2Q13029 1718 aa37.15■■■■□ 3.54
ACTN3-202ENST00000511191 ERCC6Q03468 1493 aa37.1■■■■□ 3.53
ACTN3-202ENST00000511191 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.07■■■■□ 3.53
ACTN3-202ENST00000511191 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.02■■■■□ 3.52
ACTN3-202ENST00000511191 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.97■■■■□ 3.51
ACTN3-202ENST00000511191 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.82■■■■□ 3.49
ACTN3-202ENST00000511191 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
ACTN3-202ENST00000511191 WDR62O43379 1518 aa36.69■■■■□ 3.46
ACTN3-202ENST00000511191 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
ACTN3-202ENST00000511191 ABCC8Q09428 1581 aa36.62■■■■□ 3.45
ACTN3-202ENST00000511191 CUX2O14529 1486 aa36.58■■■■□ 3.45
ACTN3-202ENST00000511191 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.57■■■■□ 3.44
ACTN3-202ENST00000511191 TOPBP1Q92547 1522 aa36.56■■■■□ 3.44
ACTN3-202ENST00000511191 CUX1P39880 1505 aa36.49■■■■□ 3.43
ACTN3-202ENST00000511191 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.47■■■■□ 3.43
ACTN3-202ENST00000511191 TOP2BQ02880 1626 aa36.34■■■■□ 3.41
ACTN3-202ENST00000511191 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.33■■■■□ 3.41
ACTN3-202ENST00000511191 SYNJ1O43426 1573 aa36.32■■■■□ 3.41
ACTN3-202ENST00000511191 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
ACTN3-202ENST00000511191 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.26■■■■□ 3.4
ACTN3-202ENST00000511191 IFT140Q96RY7 1462 aa36.21■■■■□ 3.39
ACTN3-202ENST00000511191 SOGA1O94964 1423 aa36.13■■■■□ 3.37
ACTN3-202ENST00000511191 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
ACTN3-202ENST00000511191 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.09■■■■□ 3.37
ACTN3-202ENST00000511191 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.98■■■■□ 3.35
ACTN3-202ENST00000511191 WDR97A6NE52 1622 aa35.95■■■■□ 3.35
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM41Q8WV44 630 aa35.95■■■■□ 3.35
ACTN3-202ENST00000511191 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.9■■■■□ 3.34
ACTN3-202ENST00000511191 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
ACTN3-202ENST00000511191 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
ACTN3-202ENST00000511191 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.81■■■■□ 3.32
ACTN3-202ENST00000511191 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.77■■■■□ 3.32
ACTN3-202ENST00000511191 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.73■■■■□ 3.31
ACTN3-202ENST00000511191 GRIN2BQ13224 1484 aa35.67■■■■□ 3.3
ACTN3-202ENST00000511191 KIF27Q86VH2 1401 aa35.66■■■■□ 3.3
ACTN3-202ENST00000511191 PBRM1Q86U86 1689 aa35.58■■■■□ 3.29
ACTN3-202ENST00000511191 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.57■■■■□ 3.28
ACTN3-202ENST00000511191 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
ACTN3-202ENST00000511191 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.5■■■■□ 3.27
ACTN3-202ENST00000511191 IGF1RP08069 1367 aa35.47■■■■□ 3.27
ACTN3-202ENST00000511191 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.47■■■■□ 3.27
ACTN3-202ENST00000511191 EEA1Q15075 1411 aa35.4■■■■□ 3.26
ACTN3-202ENST00000511191 ADAMTS12P58397 1594 aa35.38■■■■□ 3.25
ACTN3-202ENST00000511191 SYNJ2O15056 1496 aa35.36■■■■□ 3.25
ACTN3-202ENST00000511191 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.36■■■■□ 3.25
ACTN3-202ENST00000511191 CUL7Q14999 1698 aa35.32■■■■□ 3.24
ACTN3-202ENST00000511191 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
ACTN3-202ENST00000511191 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.25■■■■□ 3.23
ACTN3-202ENST00000511191 CHD1O14646 1710 aa35.24■■■■□ 3.23
ACTN3-202ENST00000511191 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.21■■■■□ 3.23
ACTN3-202ENST00000511191 FBLN2P98095 1184 aa35.2■■■■□ 3.23
ACTN3-202ENST00000511191 GRIN2AQ12879 1464 aa35.2■■■■□ 3.23
ACTN3-202ENST00000511191 PRXQ9BXM0 1461 aa35.16■■■■□ 3.22
ACTN3-202ENST00000511191 OSCARQ8IYS5 282 aa35.13■■■■□ 3.21
ACTN3-202ENST00000511191 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.11■■■■□ 3.21
ACTN3-202ENST00000511191 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
ACTN3-202ENST00000511191 NUP160Q12769 1436 aa35.06■■■■□ 3.2
ACTN3-202ENST00000511191 CEP170Q5SW79 1584 aa34.98■■■■□ 3.19
ACTN3-202ENST00000511191 KIF21BO75037 1637 aa34.95■■■■□ 3.19
ACTN3-202ENST00000511191 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.95■■■■□ 3.19
ACTN3-202ENST00000511191 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.85■■■■□ 3.17
ACTN3-202ENST00000511191 GOLGA3Q08378 1498 aa34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 207 ms