RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510836.5

TUSC3-210, Transcript of tumor suppressor candidate 3, humanhuman

TSL 5

Gene TUSC3, Length 1,452 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3-210ENST00000510836 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.08■■■■■ 7.37
TUSC3-210ENST00000510836 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.2■■■■■ 6.27
TUSC3-210ENST00000510836 ABCC9O60706 1549 aa52.67■■■■■ 6.02
TUSC3-210ENST00000510836 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.94■■■■■ 5.75
TUSC3-210ENST00000510836 NACADO15069 1562 aa50.87■■■■■ 5.73
TUSC3-210ENST00000510836 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.82■■■■■ 5.73
TUSC3-210ENST00000510836 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.73■■■■■ 5.71
TUSC3-210ENST00000510836 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.7■■■■■ 5.71
TUSC3-210ENST00000510836 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.6■■■■■ 5.69
TUSC3-210ENST00000510836 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.82■■■■■ 5.57
TUSC3-210ENST00000510836 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.39■■■■■ 5.5
TUSC3-210ENST00000510836 SCRIBQ14160 1630 aa49.38■■■■■ 5.5
TUSC3-210ENST00000510836 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.24■■■■■ 5.47
TUSC3-210ENST00000510836 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.84■■■■■ 5.41
TUSC3-210ENST00000510836 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.21■■■■■ 5.31
TUSC3-210ENST00000510836 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
TUSC3-210ENST00000510836 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.73■■■■■ 5.23
TUSC3-210ENST00000510836 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.55■■■■■ 5.2
TUSC3-210ENST00000510836 SMARCA4P51532 1647 aa47.33■■■■■ 5.17
TUSC3-210ENST00000510836 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
TUSC3-210ENST00000510836 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.07■■■■■ 5.12
TUSC3-210ENST00000510836 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.01■■■■■ 5.12
TUSC3-210ENST00000510836 NCAPD3P42695 1498 aa46.97■■■■■ 5.11
TUSC3-210ENST00000510836 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.94■■■■■ 5.1
TUSC3-210ENST00000510836 SMARCA2P51531 1590 aa46.93■■■■■ 5.1
TUSC3-210ENST00000510836 HMGXB3Q12766 1538 aa46.74■■■■■ 5.07
TUSC3-210ENST00000510836 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
TUSC3-210ENST00000510836 WIZO95785 1651 aa46.58■■■■■ 5.05
TUSC3-210ENST00000510836 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.04
TUSC3-210ENST00000510836 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
TUSC3-210ENST00000510836 NESP48681 1621 aa45.71■■■■■ 4.91
TUSC3-210ENST00000510836 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.65■■■■■ 4.9
TUSC3-210ENST00000510836 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.56■■■■■ 4.88
TUSC3-210ENST00000510836 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.54■■■■■ 4.88
TUSC3-210ENST00000510836 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
TUSC3-210ENST00000510836 CFTRP13569 1480 aa45.38■■■■■ 4.86
TUSC3-210ENST00000510836 ERCC6Q03468 1493 aa45.3■■■■■ 4.84
TUSC3-210ENST00000510836 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.28■■■■■ 4.84
TUSC3-210ENST00000510836 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.21■■■■■ 4.83
TUSC3-210ENST00000510836 PRDM2Q13029 1718 aa45.1■■■■■ 4.81
TUSC3-210ENST00000510836 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.01■■■■■ 4.8
TUSC3-210ENST00000510836 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
TUSC3-210ENST00000510836 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.91■■■■■ 4.78
TUSC3-210ENST00000510836 CUX2O14529 1486 aa44.85■■■■■ 4.77
TUSC3-210ENST00000510836 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.81■■■■■ 4.76
TUSC3-210ENST00000510836 WDR62O43379 1518 aa44.71■■■■■ 4.75
TUSC3-210ENST00000510836 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
TUSC3-210ENST00000510836 TOPBP1Q92547 1522 aa44.35■■■■■ 4.69
TUSC3-210ENST00000510836 ABCC8Q09428 1581 aa44.34■■■■■ 4.69
TUSC3-210ENST00000510836 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.32■■■■■ 4.69
TUSC3-210ENST00000510836 CUX1P39880 1505 aa44.14■■■■■ 4.66
TUSC3-210ENST00000510836 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
TUSC3-210ENST00000510836 IFT140Q96RY7 1462 aa43.98■■■■■ 4.63
TUSC3-210ENST00000510836 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
TUSC3-210ENST00000510836 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.91■■■■■ 4.62
TUSC3-210ENST00000510836 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.9■■■■■ 4.62
TUSC3-210ENST00000510836 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.85■■■■■ 4.61
TUSC3-210ENST00000510836 TOP2BQ02880 1626 aa43.83■■■■■ 4.61
TUSC3-210ENST00000510836 SYNJ1O43426 1573 aa43.83■■■■■ 4.61
TUSC3-210ENST00000510836 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
TUSC3-210ENST00000510836 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.79■■■■■ 4.6
TUSC3-210ENST00000510836 SOGA1O94964 1423 aa43.78■■■■■ 4.6
TUSC3-210ENST00000510836 WDR97A6NE52 1622 aa43.62■■■■■ 4.57
TUSC3-210ENST00000510836 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
TUSC3-210ENST00000510836 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.55■■■■■ 4.56
TUSC3-210ENST00000510836 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.54■■■■■ 4.56
TUSC3-210ENST00000510836 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
TUSC3-210ENST00000510836 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.36■■■■■ 4.53
TUSC3-210ENST00000510836 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.29■■■■■ 4.52
TUSC3-210ENST00000510836 GRIN2BQ13224 1484 aa43.24■■■■■ 4.51
TUSC3-210ENST00000510836 PBRM1Q86U86 1689 aa43.22■■■■■ 4.51
TUSC3-210ENST00000510836 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.17■■■■■ 4.5
TUSC3-210ENST00000510836 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.14■■■■■ 4.5
TUSC3-210ENST00000510836 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
TUSC3-210ENST00000510836 CHD1O14646 1710 aa43.04■■■■■ 4.48
TUSC3-210ENST00000510836 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.01■■■■■ 4.48
TUSC3-210ENST00000510836 OSCARQ8IYS5 282 aa42.99■■■■■ 4.47
TUSC3-210ENST00000510836 TRIM41Q8WV44 630 aa42.96■■■■■ 4.47
TUSC3-210ENST00000510836 SYNJ2O15056 1496 aa42.95■■■■■ 4.47
TUSC3-210ENST00000510836 KIF27Q86VH2 1401 aa42.94■■■■■ 4.46
TUSC3-210ENST00000510836 ADAMTS12P58397 1594 aa42.89■■■■■ 4.46
TUSC3-210ENST00000510836 FBLN2P98095 1184 aa42.84■■■■■ 4.45
TUSC3-210ENST00000510836 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
TUSC3-210ENST00000510836 IGF1RP08069 1367 aa42.81■■■■■ 4.44
TUSC3-210ENST00000510836 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.8■■■■■ 4.44
TUSC3-210ENST00000510836 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.71■■■■■ 4.43
TUSC3-210ENST00000510836 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.71■■■■■ 4.43
TUSC3-210ENST00000510836 GRIN2AQ12879 1464 aa42.7■■■■■ 4.43
TUSC3-210ENST00000510836 CUL7Q14999 1698 aa42.66■■■■■ 4.42
TUSC3-210ENST00000510836 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.6■■■■■ 4.41
TUSC3-210ENST00000510836 NUP160Q12769 1436 aa42.55■■■■■ 4.4
TUSC3-210ENST00000510836 CEP170Q5SW79 1584 aa42.51■■■■■ 4.4
TUSC3-210ENST00000510836 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.51■■■■■ 4.39
TUSC3-210ENST00000510836 ARHGEF11O15085 1522 aa42.34■■■■■ 4.37
TUSC3-210ENST00000510836 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
TUSC3-210ENST00000510836 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
TUSC3-210ENST00000510836 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
TUSC3-210ENST00000510836 EEA1Q15075 1411 aa42.31■■■■■ 4.36
TUSC3-210ENST00000510836 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.28■■■■■ 4.36
TUSC3-210ENST00000510836 PRXQ9BXM0 1461 aa42.27■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.7 ms