RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507118.5

SMAD5-202, Transcript of SMAD family member 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD5, Length 669 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-202ENST00000507118 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.86■■■■■ 6.85
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SMAD5-202ENST00000507118 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.52■■■■■ 5.52
SMAD5-202ENST00000507118 NACADO15069 1562 aa49.19■■■■■ 5.47
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SMAD5-202ENST00000507118 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.41■■■■■ 5.34
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SMAD5-202ENST00000507118 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.02■■■■■ 5.12
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SMAD5-202ENST00000507118 SMARCA2P51531 1590 aa45.1■■■■■ 4.81
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SMAD5-202ENST00000507118 ERCC6Q03468 1493 aa44.88■■■■■ 4.78
SMAD5-202ENST00000507118 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.81■■■■■ 4.76
SMAD5-202ENST00000507118 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
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SMAD5-202ENST00000507118 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.39■■■■■ 4.7
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SMAD5-202ENST00000507118 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.1■■■■■ 4.65
SMAD5-202ENST00000507118 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.09■■■■■ 4.65
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SMAD5-202ENST00000507118 WIZO95785 1651 aa43.96■■■■■ 4.63
SMAD5-202ENST00000507118 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.74■■■■■ 4.59
SMAD5-202ENST00000507118 WDR62O43379 1518 aa43.68■■■■■ 4.58
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SMAD5-202ENST00000507118 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.51■■■■■ 4.56
SMAD5-202ENST00000507118 CFTRP13569 1480 aa43.51■■■■■ 4.56
SMAD5-202ENST00000507118 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.46■■■■■ 4.55
SMAD5-202ENST00000507118 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
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SMAD5-202ENST00000507118 PRDM2Q13029 1718 aa43.02■■■■■ 4.48
SMAD5-202ENST00000507118 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.94■■■■■ 4.46
SMAD5-202ENST00000507118 TRIM41Q8WV44 630 aa42.84■■■■■ 4.45
SMAD5-202ENST00000507118 OSCARQ8IYS5 282 aa42.8■■■■■ 4.44
SMAD5-202ENST00000507118 IFT140Q96RY7 1462 aa42.68■■■■■ 4.42
SMAD5-202ENST00000507118 TOPBP1Q92547 1522 aa42.65■■■■■ 4.42
SMAD5-202ENST00000507118 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
SMAD5-202ENST00000507118 ABCC8Q09428 1581 aa42.56■■■■■ 4.4
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SMAD5-202ENST00000507118 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
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SMAD5-202ENST00000507118 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
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SMAD5-202ENST00000507118 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42■■■■■ 4.31
SMAD5-202ENST00000507118 SOGA1O94964 1423 aa41.96■■■■■ 4.31
SMAD5-202ENST00000507118 WDR97A6NE52 1622 aa41.92■■■■■ 4.3
SMAD5-202ENST00000507118 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.89■■■■■ 4.3
SMAD5-202ENST00000507118 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
SMAD5-202ENST00000507118 CUX1P39880 1505 aa41.86■■■■■ 4.29
SMAD5-202ENST00000507118 FBLN2P98095 1184 aa41.78■■■■■ 4.28
SMAD5-202ENST00000507118 ARAP1Q96P48 1450 aa41.76■■■■■ 4.28
SMAD5-202ENST00000507118 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.75■■■■■ 4.27
SMAD5-202ENST00000507118 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.75■■■■■ 4.27
SMAD5-202ENST00000507118 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
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SMAD5-202ENST00000507118 GRIN2BQ13224 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
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SMAD5-202ENST00000507118 SYNJ2O15056 1496 aa41.54■■■■■ 4.24
SMAD5-202ENST00000507118 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
SMAD5-202ENST00000507118 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.48■■■■■ 4.23
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SMAD5-202ENST00000507118 PBRM1Q86U86 1689 aa41.45■■■■■ 4.23
SMAD5-202ENST00000507118 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.42■■■■■ 4.22
SMAD5-202ENST00000507118 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
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SMAD5-202ENST00000507118 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.22■■■■■ 4.19
SMAD5-202ENST00000507118 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.18■■■■■ 4.18
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SMAD5-202ENST00000507118 GRIN2AQ12879 1464 aa41.13■■■■■ 4.17
SMAD5-202ENST00000507118 ADAMTS12P58397 1594 aa41.09■■■■■ 4.17
SMAD5-202ENST00000507118 NUP160Q12769 1436 aa41.04■■■■■ 4.16
SMAD5-202ENST00000507118 CEP170Q5SW79 1584 aa40.99■■■■■ 4.15
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SMAD5-202ENST00000507118 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.94■■■■■ 4.14
SMAD5-202ENST00000507118 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.93■■■■■ 4.14
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SMAD5-202ENST00000507118 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
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SMAD5-202ENST00000507118 IGF1RP08069 1367 aa40.36■■■■■ 4.05
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