RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505559.5

SPATA20-212, Transcript of spermatogenesis associated 20, humanhuman

TSL 2

Gene SPATA20, Length 1,590 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20-212ENST00000505559 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.25■■■■■ 6.28
SPATA20-212ENST00000505559 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.97■■■■■ 5.27
SPATA20-212ENST00000505559 ABCC9O60706 1549 aa46.81■■■■■ 5.08
SPATA20-212ENST00000505559 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.36■■■■■ 4.85
SPATA20-212ENST00000505559 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
SPATA20-212ENST00000505559 NACADO15069 1562 aa45.03■■■■■ 4.8
SPATA20-212ENST00000505559 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.01■■■■■ 4.8
SPATA20-212ENST00000505559 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.79■■■■■ 4.76
SPATA20-212ENST00000505559 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.78■■■■■ 4.76
SPATA20-212ENST00000505559 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.14■■■■■ 4.66
SPATA20-212ENST00000505559 SCRIBQ14160 1630 aa43.99■■■■■ 4.63
SPATA20-212ENST00000505559 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.86■■■■■ 4.61
SPATA20-212ENST00000505559 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.75■■■■■ 4.59
SPATA20-212ENST00000505559 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.29■■■■■ 4.52
SPATA20-212ENST00000505559 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.71■■■■■ 4.43
SPATA20-212ENST00000505559 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
SPATA20-212ENST00000505559 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.34■■■■■ 4.37
SPATA20-212ENST00000505559 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.3■■■■■ 4.36
SPATA20-212ENST00000505559 SMARCA4P51532 1647 aa42.03■■■■■ 4.32
SPATA20-212ENST00000505559 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
SPATA20-212ENST00000505559 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.9■■■■■ 4.3
SPATA20-212ENST00000505559 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.71■■■■■ 4.27
SPATA20-212ENST00000505559 SMARCA2P51531 1590 aa41.6■■■■■ 4.25
SPATA20-212ENST00000505559 NCAPD3P42695 1498 aa41.57■■■■■ 4.25
SPATA20-212ENST00000505559 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.53■■■■■ 4.24
SPATA20-212ENST00000505559 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
SPATA20-212ENST00000505559 WIZO95785 1651 aa41.49■■■■■ 4.23
SPATA20-212ENST00000505559 HMGXB3Q12766 1538 aa41.38■■■■■ 4.21
SPATA20-212ENST00000505559 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
SPATA20-212ENST00000505559 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
SPATA20-212ENST00000505559 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SPATA20-212ENST00000505559 NESP48681 1621 aa40.64■■■■■ 4.1
SPATA20-212ENST00000505559 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.54■■■■■ 4.08
SPATA20-212ENST00000505559 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.42■■■■■ 4.06
SPATA20-212ENST00000505559 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.41■■■■■ 4.06
SPATA20-212ENST00000505559 CFTRP13569 1480 aa40.25■■■■■ 4.03
SPATA20-212ENST00000505559 ERCC6Q03468 1493 aa40.24■■■■■ 4.03
SPATA20-212ENST00000505559 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.13■■■■■ 4.01
SPATA20-212ENST00000505559 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.12■■■■■ 4.01
SPATA20-212ENST00000505559 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.98■■■■□ 3.99
SPATA20-212ENST00000505559 PRDM2Q13029 1718 aa39.95■■■■□ 3.99
SPATA20-212ENST00000505559 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.87■■■■□ 3.97
SPATA20-212ENST00000505559 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
SPATA20-212ENST00000505559 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.73■■■■□ 3.95
SPATA20-212ENST00000505559 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
SPATA20-212ENST00000505559 WDR62O43379 1518 aa39.59■■■■□ 3.93
SPATA20-212ENST00000505559 CUX2O14529 1486 aa39.58■■■■□ 3.93
SPATA20-212ENST00000505559 TOPBP1Q92547 1522 aa39.39■■■■□ 3.9
SPATA20-212ENST00000505559 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.33■■■■□ 3.89
SPATA20-212ENST00000505559 CUX1P39880 1505 aa39.27■■■■□ 3.88
SPATA20-212ENST00000505559 ABCC8Q09428 1581 aa39.27■■■■□ 3.88
SPATA20-212ENST00000505559 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.11■■■■□ 3.85
SPATA20-212ENST00000505559 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
SPATA20-212ENST00000505559 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.06■■■■□ 3.84
SPATA20-212ENST00000505559 SYNJ1O43426 1573 aa39.06■■■■□ 3.84
SPATA20-212ENST00000505559 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.99■■■■□ 3.83
SPATA20-212ENST00000505559 IFT140Q96RY7 1462 aa38.98■■■■□ 3.83
SPATA20-212ENST00000505559 TOP2BQ02880 1626 aa38.96■■■■□ 3.83
SPATA20-212ENST00000505559 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.95■■■■□ 3.83
SPATA20-212ENST00000505559 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
SPATA20-212ENST00000505559 SOGA1O94964 1423 aa38.92■■■■□ 3.82
SPATA20-212ENST00000505559 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
SPATA20-212ENST00000505559 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.75■■■■□ 3.797e-8■■■□□ 18.3
SPATA20-212ENST00000505559 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
SPATA20-212ENST00000505559 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
SPATA20-212ENST00000505559 WDR97A6NE52 1622 aa38.69■■■■□ 3.78
SPATA20-212ENST00000505559 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.63■■■■□ 3.77
SPATA20-212ENST00000505559 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.48■■■■□ 3.75
SPATA20-212ENST00000505559 TRIM41Q8WV44 630 aa38.48■■■■□ 3.75
SPATA20-212ENST00000505559 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.47■■■■□ 3.75
SPATA20-212ENST00000505559 PBRM1Q86U86 1689 aa38.39■■■■□ 3.74
SPATA20-212ENST00000505559 GRIN2BQ13224 1484 aa38.38■■■■□ 3.73
SPATA20-212ENST00000505559 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.35■■■■□ 3.73
SPATA20-212ENST00000505559 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.29■■■■□ 3.72
SPATA20-212ENST00000505559 FBLN2P98095 1184 aa38.23■■■■□ 3.71
SPATA20-212ENST00000505559 KIF27Q86VH2 1401 aa38.22■■■■□ 3.71
SPATA20-212ENST00000505559 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
SPATA20-212ENST00000505559 CHD1O14646 1710 aa38.2■■■■□ 3.71
SPATA20-212ENST00000505559 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.17■■■■□ 3.7
SPATA20-212ENST00000505559 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.15■■■■□ 3.7
SPATA20-212ENST00000505559 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 SYNJ2O15056 1496 aa38.09■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 ADAMTS12P58397 1594 aa38.09■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 IGF1RP08069 1367 aa38.08■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 OSCARQ8IYS5 282 aa38.08■■■■□ 3.69
SPATA20-212ENST00000505559 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.03■■■■□ 3.68
SPATA20-212ENST00000505559 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38■■■■□ 3.67
SPATA20-212ENST00000505559 GRIN2AQ12879 1464 aa37.92■■■■□ 3.66
SPATA20-212ENST00000505559 CUL7Q14999 1698 aa37.87■■■■□ 3.65
SPATA20-212ENST00000505559 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.85■■■■□ 3.65
SPATA20-212ENST00000505559 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.65
SPATA20-212ENST00000505559 CEP170Q5SW79 1584 aa37.77■■■■□ 3.64
SPATA20-212ENST00000505559 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.73■■■■□ 3.63
SPATA20-212ENST00000505559 NUP160Q12769 1436 aa37.71■■■■□ 3.63
SPATA20-212ENST00000505559 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.68■■■■□ 3.62
SPATA20-212ENST00000505559 EEA1Q15075 1411 aa37.64■■■■□ 3.62
SPATA20-212ENST00000505559 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.63■■■■□ 3.61
SPATA20-212ENST00000505559 PRXQ9BXM0 1461 aa37.61■■■■□ 3.61
SPATA20-212ENST00000505559 ARHGEF11O15085 1522 aa37.5■■■■□ 3.59
SPATA20-212ENST00000505559 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.48■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms