RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505295.1

CKMT2-AS1-205, CKMT2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CKMT2-AS1, Length 909 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.8■■■□□ 2.2
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.05■■□□□ 1.44
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NACADO15069 1562 aa24.04■■□□□ 1.44
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.91■■□□□ 1.42
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.82■■□□□ 1.4
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.5■■□□□ 1.35
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SCRIBQ14160 1630 aa23.31■■□□□ 1.32
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.06■■□□□ 1.28
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.03■■□□□ 1.28
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.62■■□□□ 1.21
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.47■■□□□ 1.19
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.22■■□□□ 1.15
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SMARCA2P51531 1590 aa22.16■■□□□ 1.14
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.12■■□□□ 1.13
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 HMGXB3Q12766 1538 aa22.06■■□□□ 1.12
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NESP48681 1621 aa21.67■■□□□ 1.06
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.58■■□□□ 1.05
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ERCC6Q03468 1493 aa21.54■■□□□ 1.04
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.37■■□□□ 1.01
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.3■■□□□ 1
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 PRDM2Q13029 1718 aa21.2■□□□□ 0.98
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 WDR62O43379 1518 aa21.15■□□□□ 0.98
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.74■□□□□ 0.91
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 WDR97A6NE52 1622 aa20.53■□□□□ 0.88
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.47■□□□□ 0.87
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 GRIN2BQ13224 1484 aa20.45■□□□□ 0.86
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.42■□□□□ 0.86
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 PBRM1Q86U86 1689 aa20.37■□□□□ 0.85
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CHD1O14646 1710 aa20.35■□□□□ 0.85
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SYNJ2O15056 1496 aa20.32■□□□□ 0.84
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.28■□□□□ 0.84
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 TRIM41Q8WV44 630 aa20.26■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 KIF27Q86VH2 1401 aa20.26■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.23■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 IGF1RP08069 1367 aa20.22■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ADAMTS12P58397 1594 aa20.22■□□□□ 0.83
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CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.15■□□□□ 0.82
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.12■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NUP160Q12769 1436 aa20.11■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ARHGEF11O15085 1522 aa20.11■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CEP170Q5SW79 1584 aa20.08■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.08■□□□□ 0.8
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CUL7Q14999 1698 aa20.07■□□□□ 0.8
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.05■□□□□ 0.8
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.97■□□□□ 0.79
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ARAP1Q96P48 1450 aa19.95■□□□□ 0.78
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 JPH4Q96JJ6 628 aa19.95■□□□□ 0.78
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