RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502877.1

CLTB-203, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

TSL 2

Gene CLTB, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-203ENST00000502877 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.43■■■■■ 5.82
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CLTB-203ENST00000502877 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.06■■■■■ 4.96
CLTB-203ENST00000502877 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.86■■■■■ 4.61
CLTB-203ENST00000502877 NACADO15069 1562 aa43.6■■■■■ 4.57
CLTB-203ENST00000502877 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.35■■■■■ 4.53
CLTB-203ENST00000502877 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.32■■■■■ 4.53
CLTB-203ENST00000502877 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.07■■■■■ 4.48
CLTB-203ENST00000502877 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.94■■■■■ 4.46
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CLTB-203ENST00000502877 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.63■■■■■ 4.41
CLTB-203ENST00000502877 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
CLTB-203ENST00000502877 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.51■■■■■ 4.4
CLTB-203ENST00000502877 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.07■■■■■ 4.33
CLTB-203ENST00000502877 SCRIBQ14160 1630 aa41.95■■■■■ 4.31
CLTB-203ENST00000502877 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.62■■■■■ 4.25
CLTB-203ENST00000502877 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
CLTB-203ENST00000502877 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.53■■■■■ 4.24
CLTB-203ENST00000502877 NCAPD3P42695 1498 aa40.31■■■■■ 4.04
CLTB-203ENST00000502877 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.16■■■■■ 4.02
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CLTB-203ENST00000502877 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.76■■■■□ 3.96
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CLTB-203ENST00000502877 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.73■■■■□ 3.95
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CLTB-203ENST00000502877 WIZO95785 1651 aa39.09■■■■□ 3.85
CLTB-203ENST00000502877 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.08■■■■□ 3.85
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CLTB-203ENST00000502877 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.59■■■■□ 3.77
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CLTB-203ENST00000502877 OSCARQ8IYS5 282 aa37.96■■■■□ 3.67
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CLTB-203ENST00000502877 IFT140Q96RY7 1462 aa37.86■■■■□ 3.65
CLTB-203ENST00000502877 TOPBP1Q92547 1522 aa37.86■■■■□ 3.65
CLTB-203ENST00000502877 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
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CLTB-203ENST00000502877 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.7■■■■□ 3.63
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CLTB-203ENST00000502877 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
CLTB-203ENST00000502877 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
CLTB-203ENST00000502877 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.34■■■■□ 3.57
CLTB-203ENST00000502877 SOGA1O94964 1423 aa37.33■■■■□ 3.57
CLTB-203ENST00000502877 ARHGEF11O15085 1522 aa37.3■■■■□ 3.56
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CLTB-203ENST00000502877 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.23■■■■□ 3.55
CLTB-203ENST00000502877 CUX1P39880 1505 aa37.21■■■■□ 3.55
CLTB-203ENST00000502877 CHD1O14646 1710 aa37.2■■■■□ 3.55
CLTB-203ENST00000502877 FBLN2P98095 1184 aa37.18■■■■□ 3.54
CLTB-203ENST00000502877 WDR97A6NE52 1622 aa37.12■■■■□ 3.53
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CLTB-203ENST00000502877 GRIN2BQ13224 1484 aa36.98■■■■□ 3.51
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CLTB-203ENST00000502877 ARAP1Q96P48 1450 aa36.94■■■■□ 3.5
CLTB-203ENST00000502877 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
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CLTB-203ENST00000502877 SYNJ2O15056 1496 aa36.87■■■■□ 3.49
CLTB-203ENST00000502877 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.85■■■■□ 3.49
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CLTB-203ENST00000502877 SYNJ1O43426 1573 aa36.81■■■■□ 3.48
CLTB-203ENST00000502877 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.74■■■■□ 3.47
CLTB-203ENST00000502877 PBRM1Q86U86 1689 aa36.73■■■■□ 3.47
CLTB-203ENST00000502877 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
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CLTB-203ENST00000502877 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.36■■■■□ 3.41
CLTB-203ENST00000502877 CEP170Q5SW79 1584 aa36.35■■■■□ 3.41
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CLTB-203ENST00000502877 SHROOM2Q13796 1616 aa36.2■■■■□ 3.39
CLTB-203ENST00000502877 JPH4Q96JJ6 628 aa36.06■■■■□ 3.36
CLTB-203ENST00000502877 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
CLTB-203ENST00000502877 IGF1RP08069 1367 aa35.97■■■■□ 3.35
CLTB-203ENST00000502877 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.93■■■■□ 3.34
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