RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502816.1

TRIO-204, Transcript of trio Rho guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 2

Gene TRIO, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIO-204ENST00000502816 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.23■■■■■ 7.39
TRIO-204ENST00000502816 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.66■■■■■ 6.34
TRIO-204ENST00000502816 ABCC9O60706 1549 aa53.73■■■■■ 6.19
TRIO-204ENST00000502816 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.61■■■■■ 5.85
TRIO-204ENST00000502816 NACADO15069 1562 aa51.49■■■■■ 5.83
TRIO-204ENST00000502816 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.14■■■■■ 5.78
TRIO-204ENST00000502816 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.09■■■■■ 5.77
TRIO-204ENST00000502816 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.9■■■■■ 5.74
TRIO-204ENST00000502816 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.73■■■■■ 5.71
TRIO-204ENST00000502816 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.48■■■■■ 5.67
TRIO-204ENST00000502816 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.11■■■■■ 5.61
TRIO-204ENST00000502816 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.11■■■■■ 5.61
TRIO-204ENST00000502816 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.79■■■■■ 5.56
TRIO-204ENST00000502816 SCRIBQ14160 1630 aa49.68■■■■■ 5.54
TRIO-204ENST00000502816 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.6■■■■■ 5.53
TRIO-204ENST00000502816 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
TRIO-204ENST00000502816 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.66■■■■■ 5.38
TRIO-204ENST00000502816 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.37■■■■■ 5.33
TRIO-204ENST00000502816 SMARCA4P51532 1647 aa47.58■■■■■ 5.21
TRIO-204ENST00000502816 NCAPD3P42695 1498 aa47.53■■■■■ 5.2
TRIO-204ENST00000502816 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
TRIO-204ENST00000502816 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.44■■■■■ 5.18
TRIO-204ENST00000502816 SMARCA2P51531 1590 aa47.37■■■■■ 5.17
TRIO-204ENST00000502816 HMGXB3Q12766 1538 aa47.24■■■■■ 5.15
TRIO-204ENST00000502816 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.22■■■■■ 5.15
TRIO-204ENST00000502816 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.14■■■■■ 5.14
TRIO-204ENST00000502816 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
TRIO-204ENST00000502816 WIZO95785 1651 aa46.6■■■■■ 5.05
TRIO-204ENST00000502816 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
TRIO-204ENST00000502816 NESP48681 1621 aa46.4■■■■■ 5.02
TRIO-204ENST00000502816 ERCC6Q03468 1493 aa46.32■■■■■ 5.01
TRIO-204ENST00000502816 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.31■■■■■ 5
TRIO-204ENST00000502816 CUX2O14529 1486 aa46.12■■■■■ 4.97
TRIO-204ENST00000502816 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
TRIO-204ENST00000502816 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.07■■■■■ 4.97
TRIO-204ENST00000502816 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.98■■■■■ 4.95
TRIO-204ENST00000502816 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.88■■■■■ 4.94
TRIO-204ENST00000502816 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
TRIO-204ENST00000502816 CFTRP13569 1480 aa45.74■■■■■ 4.91
TRIO-204ENST00000502816 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.55■■■■■ 4.88
TRIO-204ENST00000502816 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.51■■■■■ 4.88
TRIO-204ENST00000502816 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.49■■■■■ 4.87
TRIO-204ENST00000502816 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.47■■■■■ 4.87
TRIO-204ENST00000502816 WDR62O43379 1518 aa45.43■■■■■ 4.86
TRIO-204ENST00000502816 PRDM2Q13029 1718 aa45.37■■■■■ 4.85
TRIO-204ENST00000502816 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.22■■■■■ 4.83
TRIO-204ENST00000502816 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
TRIO-204ENST00000502816 ABCC8Q09428 1581 aa44.77■■■■■ 4.76
TRIO-204ENST00000502816 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
TRIO-204ENST00000502816 TOPBP1Q92547 1522 aa44.75■■■■■ 4.75
TRIO-204ENST00000502816 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.66■■■■■ 4.74
TRIO-204ENST00000502816 IFT140Q96RY7 1462 aa44.58■■■■■ 4.73
TRIO-204ENST00000502816 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
TRIO-204ENST00000502816 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
TRIO-204ENST00000502816 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
TRIO-204ENST00000502816 CUX1P39880 1505 aa44.24■■■■■ 4.67
TRIO-204ENST00000502816 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
TRIO-204ENST00000502816 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.14■■■■■ 4.66
TRIO-204ENST00000502816 SOGA1O94964 1423 aa44.13■■■■■ 4.65
TRIO-204ENST00000502816 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.1■■■■■ 4.65
TRIO-204ENST00000502816 OSCARQ8IYS5 282 aa44.1■■■■■ 4.65
TRIO-204ENST00000502816 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.06■■■■■ 4.64
TRIO-204ENST00000502816 WDR97A6NE52 1622 aa44.02■■■■■ 4.64
TRIO-204ENST00000502816 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
TRIO-204ENST00000502816 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.81■■■■■ 4.6
TRIO-204ENST00000502816 TOP2BQ02880 1626 aa43.78■■■■■ 4.6
TRIO-204ENST00000502816 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.78■■■■■ 4.6
TRIO-204ENST00000502816 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.75■■■■■ 4.59
TRIO-204ENST00000502816 CHD1O14646 1710 aa43.73■■■■■ 4.59
TRIO-204ENST00000502816 SYNJ1O43426 1573 aa43.71■■■■■ 4.59
TRIO-204ENST00000502816 GRIN2BQ13224 1484 aa43.68■■■■■ 4.58
TRIO-204ENST00000502816 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
TRIO-204ENST00000502816 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.63■■■■■ 4.57
TRIO-204ENST00000502816 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.62■■■■■ 4.57
TRIO-204ENST00000502816 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.61■■■■■ 4.57
TRIO-204ENST00000502816 PBRM1Q86U86 1689 aa43.56■■■■■ 4.56
TRIO-204ENST00000502816 FBLN2P98095 1184 aa43.5■■■■■ 4.55
TRIO-204ENST00000502816 SYNJ2O15056 1496 aa43.45■■■■■ 4.55
TRIO-204ENST00000502816 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.44■■■■■ 4.54
TRIO-204ENST00000502816 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.44■■■■■ 4.54
TRIO-204ENST00000502816 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.44■■■■■ 4.54
TRIO-204ENST00000502816 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
TRIO-204ENST00000502816 ARHGEF11O15085 1522 aa43.38■■■■■ 4.53
TRIO-204ENST00000502816 TRIM41Q8WV44 630 aa43.33■■■■■ 4.53
TRIO-204ENST00000502816 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.29■■■■■ 4.52
TRIO-204ENST00000502816 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.22■■■■■ 4.51
TRIO-204ENST00000502816 ADAMTS12P58397 1594 aa43.19■■■■■ 4.5
TRIO-204ENST00000502816 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.12■■■■■ 4.49
TRIO-204ENST00000502816 GRIN2AQ12879 1464 aa43.11■■■■■ 4.49
TRIO-204ENST00000502816 ARAP1Q96P48 1450 aa43■■■■■ 4.47
TRIO-204ENST00000502816 NUP160Q12769 1436 aa42.99■■■■■ 4.47
TRIO-204ENST00000502816 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.93■■■■■ 4.46
TRIO-204ENST00000502816 CEP170Q5SW79 1584 aa42.91■■■■■ 4.46
TRIO-204ENST00000502816 KIF27Q86VH2 1401 aa42.9■■■■■ 4.46
TRIO-204ENST00000502816 IGF1RP08069 1367 aa42.83■■■■■ 4.45
TRIO-204ENST00000502816 SHROOM2Q13796 1616 aa42.74■■■■■ 4.43
TRIO-204ENST00000502816 CUL7Q14999 1698 aa42.73■■■■■ 4.43
TRIO-204ENST00000502816 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.6■■■■■ 4.41
TRIO-204ENST00000502816 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.56■■■■■ 4.4
TRIO-204ENST00000502816 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.52■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms