RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498738.1

KMT5C-208, Transcript of lysine methyltransferase 5C, humanhuman

TSL 5

Gene KMT5C, Length 713 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KMT5C-208ENST00000498738 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.67■■■■■ 6.34
KMT5C-208ENST00000498738 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.87■■■■■ 5.41
KMT5C-208ENST00000498738 ABCC9O60706 1549 aa48.65■■■■■ 5.38
KMT5C-208ENST00000498738 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.44■■■■■ 5.03
KMT5C-208ENST00000498738 NACADO15069 1562 aa46.21■■■■■ 4.99
KMT5C-208ENST00000498738 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.07■■■■■ 4.97
KMT5C-208ENST00000498738 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.7■■■■■ 4.91
KMT5C-208ENST00000498738 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.46■■■■■ 4.87
KMT5C-208ENST00000498738 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.39■■■■■ 4.86
KMT5C-208ENST00000498738 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.34■■■■■ 4.85
KMT5C-208ENST00000498738 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.28■■■■■ 4.84
KMT5C-208ENST00000498738 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.2■■■■■ 4.83
KMT5C-208ENST00000498738 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.06■■■■■ 4.8
KMT5C-208ENST00000498738 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.54■■■■■ 4.72
KMT5C-208ENST00000498738 SCRIBQ14160 1630 aa44.53■■■■■ 4.72
KMT5C-208ENST00000498738 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.95■■■■■ 4.63
KMT5C-208ENST00000498738 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
KMT5C-208ENST00000498738 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.83■■■■■ 4.61
KMT5C-208ENST00000498738 NCAPD3P42695 1498 aa42.69■■■■■ 4.42
KMT5C-208ENST00000498738 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.57■■■■■ 4.41
KMT5C-208ENST00000498738 SMARCA4P51532 1647 aa42.54■■■■■ 4.4
KMT5C-208ENST00000498738 SMARCA2P51531 1590 aa42.45■■■■■ 4.39
KMT5C-208ENST00000498738 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
KMT5C-208ENST00000498738 HMGXB3Q12766 1538 aa42.34■■■■■ 4.37
KMT5C-208ENST00000498738 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.16■■■■■ 4.34
KMT5C-208ENST00000498738 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
KMT5C-208ENST00000498738 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.11■■■■■ 4.33
KMT5C-208ENST00000498738 ERCC6Q03468 1493 aa42■■■■■ 4.31
KMT5C-208ENST00000498738 NESP48681 1621 aa41.87■■■■■ 4.29
KMT5C-208ENST00000498738 CUX2O14529 1486 aa41.86■■■■■ 4.29
KMT5C-208ENST00000498738 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.63■■■■■ 4.26
KMT5C-208ENST00000498738 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.6■■■■■ 4.25
KMT5C-208ENST00000498738 WIZO95785 1651 aa41.58■■■■■ 4.25
KMT5C-208ENST00000498738 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.44■■■■■ 4.22
KMT5C-208ENST00000498738 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.41■■■■■ 4.22
KMT5C-208ENST00000498738 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
KMT5C-208ENST00000498738 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
KMT5C-208ENST00000498738 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.26■■■■■ 4.2
KMT5C-208ENST00000498738 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
KMT5C-208ENST00000498738 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.02■■■■■ 4.16
KMT5C-208ENST00000498738 CFTRP13569 1480 aa40.98■■■■■ 4.15
KMT5C-208ENST00000498738 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.9■■■■■ 4.14
KMT5C-208ENST00000498738 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.9■■■■■ 4.14
KMT5C-208ENST00000498738 WDR62O43379 1518 aa40.89■■■■■ 4.14
KMT5C-208ENST00000498738 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.66■■■■■ 4.1
KMT5C-208ENST00000498738 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
KMT5C-208ENST00000498738 PRDM2Q13029 1718 aa40.45■■■■■ 4.07
KMT5C-208ENST00000498738 TOPBP1Q92547 1522 aa40.15■■■■■ 4.02
KMT5C-208ENST00000498738 ABCC8Q09428 1581 aa40.14■■■■■ 4.02
KMT5C-208ENST00000498738 IFT140Q96RY7 1462 aa40.11■■■■■ 4.01
KMT5C-208ENST00000498738 OSCARQ8IYS5 282 aa40.07■■■■■ 4.01
KMT5C-208ENST00000498738 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.01■■■■□ 3.99
KMT5C-208ENST00000498738 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
KMT5C-208ENST00000498738 TRIM41Q8WV44 630 aa39.82■■■■□ 3.97
KMT5C-208ENST00000498738 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
KMT5C-208ENST00000498738 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
KMT5C-208ENST00000498738 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
KMT5C-208ENST00000498738 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
KMT5C-208ENST00000498738 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.68■■■■□ 3.949e-7■■□□□ 14.4
KMT5C-208ENST00000498738 SOGA1O94964 1423 aa39.62■■■■□ 3.93
KMT5C-208ENST00000498738 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.61■■■■□ 3.93
KMT5C-208ENST00000498738 CUX1P39880 1505 aa39.54■■■■□ 3.92
KMT5C-208ENST00000498738 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.53■■■■□ 3.92
KMT5C-208ENST00000498738 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
KMT5C-208ENST00000498738 FBLN2P98095 1184 aa39.39■■■■□ 3.9
KMT5C-208ENST00000498738 WDR97A6NE52 1622 aa39.39■■■■□ 3.9
KMT5C-208ENST00000498738 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
KMT5C-208ENST00000498738 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
KMT5C-208ENST00000498738 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
KMT5C-208ENST00000498738 CHD1O14646 1710 aa39.35■■■■□ 3.89
KMT5C-208ENST00000498738 ARHGEF11O15085 1522 aa39.32■■■■□ 3.89
KMT5C-208ENST00000498738 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.26■■■■□ 3.88
KMT5C-208ENST00000498738 GRIN2BQ13224 1484 aa39.23■■■■□ 3.87
KMT5C-208ENST00000498738 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
KMT5C-208ENST00000498738 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
KMT5C-208ENST00000498738 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.13■■■■□ 3.85
KMT5C-208ENST00000498738 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.12■■■■□ 3.85
KMT5C-208ENST00000498738 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.08■■■■□ 3.85
KMT5C-208ENST00000498738 SYNJ2O15056 1496 aa39.06■■■■□ 3.84
KMT5C-208ENST00000498738 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.05■■■■□ 3.84
KMT5C-208ENST00000498738 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.99■■■■□ 3.83
KMT5C-208ENST00000498738 SYNJ1O43426 1573 aa38.99■■■■□ 3.83
KMT5C-208ENST00000498738 PBRM1Q86U86 1689 aa38.98■■■■□ 3.83
KMT5C-208ENST00000498738 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.98■■■■□ 3.83
KMT5C-208ENST00000498738 TOP2BQ02880 1626 aa38.97■■■■□ 3.83
KMT5C-208ENST00000498738 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.96■■■■□ 3.83
KMT5C-208ENST00000498738 ARAP1Q96P48 1450 aa38.94■■■■□ 3.82
KMT5C-208ENST00000498738 GRIN2AQ12879 1464 aa38.7■■■■□ 3.79
KMT5C-208ENST00000498738 ADAMTS12P58397 1594 aa38.67■■■■□ 3.78
KMT5C-208ENST00000498738 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.65■■■■□ 3.78
KMT5C-208ENST00000498738 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.63■■■■□ 3.78
KMT5C-208ENST00000498738 NUP160Q12769 1436 aa38.58■■■■□ 3.77
KMT5C-208ENST00000498738 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
KMT5C-208ENST00000498738 CEP170Q5SW79 1584 aa38.52■■■■□ 3.76
KMT5C-208ENST00000498738 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.36■■■■□ 3.73
KMT5C-208ENST00000498738 SHROOM2Q13796 1616 aa38.34■■■■□ 3.73
KMT5C-208ENST00000498738 KIF27Q86VH2 1401 aa38.28■■■■□ 3.72
KMT5C-208ENST00000498738 IGF1RP08069 1367 aa38.26■■■■□ 3.72
KMT5C-208ENST00000498738 JPH4Q96JJ6 628 aa38.25■■■■□ 3.71
KMT5C-208ENST00000498738 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms