RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.31■■■■■ 5.64
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TTYH3-207ENST00000498454 ABCC9O60706 1549 aa42.9■■■■■ 4.46
TTYH3-207ENST00000498454 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
TTYH3-207ENST00000498454 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.75■■■■■ 4.27
TTYH3-207ENST00000498454 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.64■■■■■ 4.26
TTYH3-207ENST00000498454 NACADO15069 1562 aa41.63■■■■■ 4.26
TTYH3-207ENST00000498454 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.58■■■■■ 4.25
TTYH3-207ENST00000498454 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.54■■■■■ 4.24
TTYH3-207ENST00000498454 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.66■■■■■ 4.1
TTYH3-207ENST00000498454 SCRIBQ14160 1630 aa40.64■■■■■ 4.1
TTYH3-207ENST00000498454 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.27■■■■■ 4.04
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TTYH3-207ENST00000498454 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.13■■■■■ 4.01
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TTYH3-207ENST00000498454 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.13■■■■□ 3.85
TTYH3-207ENST00000498454 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
TTYH3-207ENST00000498454 SMARCA4P51532 1647 aa38.92■■■■□ 3.82
TTYH3-207ENST00000498454 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.84■■■■□ 3.81
TTYH3-207ENST00000498454 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.8■■■■□ 3.8
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TTYH3-207ENST00000498454 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.53■■■■□ 3.76
TTYH3-207ENST00000498454 SMARCA2P51531 1590 aa38.52■■■■□ 3.76
TTYH3-207ENST00000498454 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.51■■■■□ 3.76
TTYH3-207ENST00000498454 WIZO95785 1651 aa38.43■■■■□ 3.74
TTYH3-207ENST00000498454 NCAPD3P42695 1498 aa38.4■■■■□ 3.74
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TTYH3-207ENST00000498454 NESP48681 1621 aa37.32■■■■□ 3.56
TTYH3-207ENST00000498454 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.31■■■■□ 3.56
TTYH3-207ENST00000498454 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.3■■■■□ 3.56
TTYH3-207ENST00000498454 CFTRP13569 1480 aa37.23■■■■□ 3.55
TTYH3-207ENST00000498454 PRDM2Q13029 1718 aa37.07■■■■□ 3.52
TTYH3-207ENST00000498454 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.01■■■■□ 3.51
TTYH3-207ENST00000498454 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.92■■■■□ 3.5
TTYH3-207ENST00000498454 ERCC6Q03468 1493 aa36.9■■■■□ 3.5
TTYH3-207ENST00000498454 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.9■■■■□ 3.5
TTYH3-207ENST00000498454 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.81■■■■□ 3.48
TTYH3-207ENST00000498454 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
TTYH3-207ENST00000498454 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.62■■■■□ 3.45
TTYH3-207ENST00000498454 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
TTYH3-207ENST00000498454 WDR62O43379 1518 aa36.48■■■■□ 3.43
TTYH3-207ENST00000498454 ABCC8Q09428 1581 aa36.42■■■■□ 3.42
TTYH3-207ENST00000498454 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.41■■■■□ 3.42
TTYH3-207ENST00000498454 TOPBP1Q92547 1522 aa36.39■■■■□ 3.42
TTYH3-207ENST00000498454 CUX2O14529 1486 aa36.39■■■■□ 3.42
TTYH3-207ENST00000498454 CUX1P39880 1505 aa36.35■■■■□ 3.41
TTYH3-207ENST00000498454 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
TTYH3-207ENST00000498454 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.28■■■■□ 3.4
TTYH3-207ENST00000498454 SYNJ1O43426 1573 aa36.24■■■■□ 3.39
TTYH3-207ENST00000498454 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.23■■■■□ 3.39
TTYH3-207ENST00000498454 TOP2BQ02880 1626 aa36.21■■■■□ 3.39
TTYH3-207ENST00000498454 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.13■■■■□ 3.37
TTYH3-207ENST00000498454 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
TTYH3-207ENST00000498454 IFT140Q96RY7 1462 aa35.99■■■■□ 3.35
TTYH3-207ENST00000498454 SOGA1O94964 1423 aa35.97■■■■□ 3.35
TTYH3-207ENST00000498454 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.96■■■■□ 3.35
TTYH3-207ENST00000498454 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
TTYH3-207ENST00000498454 TRIM41Q8WV44 630 aa35.9■■■■□ 3.34
TTYH3-207ENST00000498454 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.89■■■■□ 3.34
TTYH3-207ENST00000498454 WDR97A6NE52 1622 aa35.83■■■■□ 3.33
TTYH3-207ENST00000498454 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.8■■■■□ 3.32
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
TTYH3-207ENST00000498454 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
TTYH3-207ENST00000498454 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
TTYH3-207ENST00000498454 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.36e-7■■■■□ 25.8
TTYH3-207ENST00000498454 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.64■■■■□ 3.3
TTYH3-207ENST00000498454 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.57■■■■□ 3.28
TTYH3-207ENST00000498454 KIF27Q86VH2 1401 aa35.53■■■■□ 3.28
TTYH3-207ENST00000498454 PBRM1Q86U86 1689 aa35.51■■■■□ 3.28
TTYH3-207ENST00000498454 GRIN2BQ13224 1484 aa35.48■■■■□ 3.27
TTYH3-207ENST00000498454 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.43■■■■□ 3.26
TTYH3-207ENST00000498454 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.38■■■■□ 3.25
TTYH3-207ENST00000498454 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.36■■■■□ 3.25
TTYH3-207ENST00000498454 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
TTYH3-207ENST00000498454 IGF1RP08069 1367 aa35.29■■■■□ 3.24
TTYH3-207ENST00000498454 EEA1Q15075 1411 aa35.27■■■■□ 3.24
TTYH3-207ENST00000498454 ADAMTS12P58397 1594 aa35.25■■■■□ 3.23
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TTYH3-207ENST00000498454 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.18■■■■□ 3.22
TTYH3-207ENST00000498454 SYNJ2O15056 1496 aa35.17■■■■□ 3.22
TTYH3-207ENST00000498454 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
TTYH3-207ENST00000498454 CHD1O14646 1710 aa35.15■■■■□ 3.22
TTYH3-207ENST00000498454 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.12■■■■□ 3.21
TTYH3-207ENST00000498454 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.11■■■■□ 3.21
TTYH3-207ENST00000498454 FBLN2P98095 1184 aa35.09■■■■□ 3.21
TTYH3-207ENST00000498454 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
TTYH3-207ENST00000498454 GRIN2AQ12879 1464 aa35.03■■■■□ 3.2
TTYH3-207ENST00000498454 PRXQ9BXM0 1461 aa35.01■■■■□ 3.19
TTYH3-207ENST00000498454 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.97■■■■□ 3.19
TTYH3-207ENST00000498454 KIF21BO75037 1637 aa34.88■■■■□ 3.17
TTYH3-207ENST00000498454 OSCARQ8IYS5 282 aa34.87■■■■□ 3.17
TTYH3-207ENST00000498454 NUP160Q12769 1436 aa34.85■■■■□ 3.17
TTYH3-207ENST00000498454 CEP170Q5SW79 1584 aa34.85■■■■□ 3.17
TTYH3-207ENST00000498454 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.75■■■■□ 3.15
TTYH3-207ENST00000498454 GOLGA3Q08378 1498 aa34.72■■■■□ 3.15
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