RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498224.5

SLC20A1-209, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC20A1, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-209ENST00000498224 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC20A1-209ENST00000498224 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.18■■□□□ 1.3
SLC20A1-209ENST00000498224 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SLC20A1-209ENST00000498224 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.71■□□□□ 0.91
SLC20A1-209ENST00000498224 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-209ENST00000498224 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SLC20A1-209ENST00000498224 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.68■□□□□ 0.74
SLC20A1-209ENST00000498224 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.67■□□□□ 0.74
SLC20A1-209ENST00000498224 ABCC9O60706 1549 aa19.6■□□□□ 0.73
SLC20A1-209ENST00000498224 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.47■□□□□ 0.71
SLC20A1-209ENST00000498224 NACADO15069 1562 aa19.33■□□□□ 0.69
SLC20A1-209ENST00000498224 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.33■□□□□ 0.68
SLC20A1-209ENST00000498224 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.24■□□□□ 0.67
SLC20A1-209ENST00000498224 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SLC20A1-209ENST00000498224 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.17■□□□□ 0.66
SLC20A1-209ENST00000498224 SCRIBQ14160 1630 aa19.01■□□□□ 0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SLC20A1-209ENST00000498224 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.62■□□□□ 0.57
SLC20A1-209ENST00000498224 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-209ENST00000498224 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-209ENST00000498224 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SLC20A1-209ENST00000498224 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.43■□□□□ 0.54
SLC20A1-209ENST00000498224 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
SLC20A1-209ENST00000498224 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.32■□□□□ 0.52
SLC20A1-209ENST00000498224 SMARCA4P51532 1647 aa18.23■□□□□ 0.51
SLC20A1-209ENST00000498224 WIZO95785 1651 aa18.14■□□□□ 0.49
SLC20A1-209ENST00000498224 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.04■□□□□ 0.48
SLC20A1-209ENST00000498224 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC20A1-209ENST00000498224 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SLC20A1-209ENST00000498224 ADRA2BP18089 450 aa17.99■□□□□ 0.47
SLC20A1-209ENST00000498224 SMARCA2P51531 1590 aa17.99■□□□□ 0.47
SLC20A1-209ENST00000498224 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.98■□□□□ 0.47
SLC20A1-209ENST00000498224 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SLC20A1-209ENST00000498224 NCAPD3P42695 1498 aa17.86■□□□□ 0.45
SLC20A1-209ENST00000498224 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.83■□□□□ 0.45
SLC20A1-209ENST00000498224 HMGXB3Q12766 1538 aa17.8■□□□□ 0.44
SLC20A1-209ENST00000498224 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.77■□□□□ 0.44
SLC20A1-209ENST00000498224 KCNA4P22459 653 aa17.73■□□□□ 0.43
SLC20A1-209ENST00000498224 FOXD1Q16676 465 aa17.73■□□□□ 0.43
SLC20A1-209ENST00000498224 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.72■□□□□ 0.43
SLC20A1-209ENST00000498224 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.66■□□□□ 0.42
SLC20A1-209ENST00000498224 TRIM41Q8WV44 630 aa17.58■□□□□ 0.4
SLC20A1-209ENST00000498224 CFTRP13569 1480 aa17.44■□□□□ 0.38
SLC20A1-209ENST00000498224 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.4■□□□□ 0.38
SLC20A1-209ENST00000498224 ABCC8Q09428 1581 aa17.39■□□□□ 0.37
SLC20A1-209ENST00000498224 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
SLC20A1-209ENST00000498224 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.29■□□□□ 0.36
SLC20A1-209ENST00000498224 PRDM2Q13029 1718 aa17.24■□□□□ 0.35
SLC20A1-209ENST00000498224 SYNJ1O43426 1573 aa17.23■□□□□ 0.35
SLC20A1-209ENST00000498224 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.23■□□□□ 0.35
SLC20A1-209ENST00000498224 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SLC20A1-209ENST00000498224 TOP2BQ02880 1626 aa17.19■□□□□ 0.34
SLC20A1-209ENST00000498224 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.18■□□□□ 0.34
SLC20A1-209ENST00000498224 NESP48681 1621 aa17.18■□□□□ 0.34
SLC20A1-209ENST00000498224 EEA1Q15075 1411 aa17.16■□□□□ 0.34
SLC20A1-209ENST00000498224 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.15■□□□□ 0.34
SLC20A1-209ENST00000498224 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.15■□□□□ 0.34
SLC20A1-209ENST00000498224 CUX1P39880 1505 aa17.13■□□□□ 0.33
SLC20A1-209ENST00000498224 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.12■□□□□ 0.33
SLC20A1-209ENST00000498224 SOGA1O94964 1423 aa17.11■□□□□ 0.33
SLC20A1-209ENST00000498224 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.09■□□□□ 0.33
SLC20A1-209ENST00000498224 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.08■□□□□ 0.32
SLC20A1-209ENST00000498224 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.06■□□□□ 0.32
SLC20A1-209ENST00000498224 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SLC20A1-209ENST00000498224 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.02■□□□□ 0.31
SLC20A1-209ENST00000498224 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.01■□□□□ 0.31
SLC20A1-209ENST00000498224 TOPBP1Q92547 1522 aa16.98■□□□□ 0.31
SLC20A1-209ENST00000498224 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SLC20A1-209ENST00000498224 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.98■□□□□ 0.31
SLC20A1-209ENST00000498224 KIF27Q86VH2 1401 aa16.96■□□□□ 0.3
SLC20A1-209ENST00000498224 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SLC20A1-209ENST00000498224 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.92■□□□□ 0.3
SLC20A1-209ENST00000498224 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SLC20A1-209ENST00000498224 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SLC20A1-209ENST00000498224 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.89■□□□□ 0.29
SLC20A1-209ENST00000498224 CUX2O14529 1486 aa16.88■□□□□ 0.29
SLC20A1-209ENST00000498224 GOLGA3Q08378 1498 aa16.88■□□□□ 0.29
SLC20A1-209ENST00000498224 ERCC6Q03468 1493 aa16.86■□□□□ 0.29
SLC20A1-209ENST00000498224 KIF21BO75037 1637 aa16.85■□□□□ 0.29
SLC20A1-209ENST00000498224 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.84■□□□□ 0.29
SLC20A1-209ENST00000498224 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.84■□□□□ 0.29
SLC20A1-209ENST00000498224 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SLC20A1-209ENST00000498224 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.83■□□□□ 0.28
SLC20A1-209ENST00000498224 PRXQ9BXM0 1461 aa16.8■□□□□ 0.28
SLC20A1-209ENST00000498224 IGF1RP08069 1367 aa16.78■□□□□ 0.28
SLC20A1-209ENST00000498224 WDR62O43379 1518 aa16.78■□□□□ 0.28
SLC20A1-209ENST00000498224 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.77■□□□□ 0.28
SLC20A1-209ENST00000498224 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.75■□□□□ 0.27
SLC20A1-209ENST00000498224 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.71■□□□□ 0.27
SLC20A1-209ENST00000498224 IFT140Q96RY7 1462 aa16.71■□□□□ 0.27
SLC20A1-209ENST00000498224 CEP162Q5TB80 1403 aa16.7■□□□□ 0.26
SLC20A1-209ENST00000498224 WDR97A6NE52 1622 aa16.7■□□□□ 0.26
SLC20A1-209ENST00000498224 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SLC20A1-209ENST00000498224 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SLC20A1-209ENST00000498224 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SLC20A1-209ENST00000498224 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.68■□□□□ 0.26
SLC20A1-209ENST00000498224 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.66■□□□□ 0.26
SLC20A1-209ENST00000498224 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SLC20A1-209ENST00000498224 CUL7Q14999 1698 aa16.62■□□□□ 0.25
SLC20A1-209ENST00000498224 CLIP1P30622 1438 aa16.61■□□□□ 0.25
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