RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498208.1

ATP6V0B-210, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit b, humanhuman

TSL 5

Gene ATP6V0B, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0B-210ENST00000498208 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.16■■■■■ 6.9
ATP6V0B-210ENST00000498208 ABCC9O60706 1549 aa52.27■■■■■ 5.96
ATP6V0B-210ENST00000498208 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.25■■■■■ 5.95
ATP6V0B-210ENST00000498208 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.75■■■■■ 5.55
ATP6V0B-210ENST00000498208 NACADO15069 1562 aa49.38■■■■■ 5.5
ATP6V0B-210ENST00000498208 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.09■■■■■ 5.45
ATP6V0B-210ENST00000498208 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.07■■■■■ 5.45
ATP6V0B-210ENST00000498208 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.68■■■■■ 5.38
ATP6V0B-210ENST00000498208 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.67■■■■■ 5.38
ATP6V0B-210ENST00000498208 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.64■■■■■ 5.38
ATP6V0B-210ENST00000498208 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.3■■■■■ 5.32
ATP6V0B-210ENST00000498208 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.18■■■■■ 5.3
ATP6V0B-210ENST00000498208 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.03■■■■■ 5.28
ATP6V0B-210ENST00000498208 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.63■■■■■ 5.22
ATP6V0B-210ENST00000498208 SCRIBQ14160 1630 aa47.59■■■■■ 5.21
ATP6V0B-210ENST00000498208 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.24■■■■■ 5.15
ATP6V0B-210ENST00000498208 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
ATP6V0B-210ENST00000498208 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.09■■■■■ 5.13
ATP6V0B-210ENST00000498208 NCAPD3P42695 1498 aa45.57■■■■■ 4.89
ATP6V0B-210ENST00000498208 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.43■■■■■ 4.86
ATP6V0B-210ENST00000498208 SMARCA4P51532 1647 aa45.4■■■■■ 4.86
ATP6V0B-210ENST00000498208 SMARCA2P51531 1590 aa45.32■■■■■ 4.85
ATP6V0B-210ENST00000498208 HMGXB3Q12766 1538 aa45.25■■■■■ 4.83
ATP6V0B-210ENST00000498208 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
ATP6V0B-210ENST00000498208 ERCC6Q03468 1493 aa45.13■■■■■ 4.82
ATP6V0B-210ENST00000498208 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.09■■■■■ 4.81
ATP6V0B-210ENST00000498208 CUX2O14529 1486 aa45.07■■■■■ 4.81
ATP6V0B-210ENST00000498208 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
ATP6V0B-210ENST00000498208 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.95■■■■■ 4.79
ATP6V0B-210ENST00000498208 NESP48681 1621 aa44.89■■■■■ 4.78
ATP6V0B-210ENST00000498208 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.82■■■■■ 4.76
ATP6V0B-210ENST00000498208 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.58■■■■■ 4.73
ATP6V0B-210ENST00000498208 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
ATP6V0B-210ENST00000498208 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.35■■■■■ 4.69
ATP6V0B-210ENST00000498208 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.3■■■■■ 4.68
ATP6V0B-210ENST00000498208 WIZO95785 1651 aa44.29■■■■■ 4.68
ATP6V0B-210ENST00000498208 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.18■■■■■ 4.66
ATP6V0B-210ENST00000498208 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.93■■■■■ 4.62
ATP6V0B-210ENST00000498208 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
ATP6V0B-210ENST00000498208 WDR62O43379 1518 aa43.84■■■■■ 4.61
ATP6V0B-210ENST00000498208 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.75■■■■■ 4.59
ATP6V0B-210ENST00000498208 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
ATP6V0B-210ENST00000498208 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.7■■■■■ 4.59
ATP6V0B-210ENST00000498208 CFTRP13569 1480 aa43.68■■■■■ 4.58
ATP6V0B-210ENST00000498208 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
ATP6V0B-210ENST00000498208 PRDM2Q13029 1718 aa43.3■■■■■ 4.52
ATP6V0B-210ENST00000498208 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.21■■■■■ 4.51
ATP6V0B-210ENST00000498208 TRIM41Q8WV44 630 aa43.1■■■■■ 4.49
ATP6V0B-210ENST00000498208 OSCARQ8IYS5 282 aa42.99■■■■■ 4.47
ATP6V0B-210ENST00000498208 IFT140Q96RY7 1462 aa42.87■■■■■ 4.45
ATP6V0B-210ENST00000498208 TOPBP1Q92547 1522 aa42.87■■■■■ 4.45
ATP6V0B-210ENST00000498208 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
ATP6V0B-210ENST00000498208 ABCC8Q09428 1581 aa42.77■■■■■ 4.44
ATP6V0B-210ENST00000498208 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.71■■■■■ 4.43
ATP6V0B-210ENST00000498208 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
ATP6V0B-210ENST00000498208 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
ATP6V0B-210ENST00000498208 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.48■■■■■ 4.39
ATP6V0B-210ENST00000498208 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.48■■■■■ 4.39
ATP6V0B-210ENST00000498208 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.48■■■■■ 4.39
ATP6V0B-210ENST00000498208 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
ATP6V0B-210ENST00000498208 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.389e-16■■■■■ 48.9
ATP6V0B-210ENST00000498208 ARHGEF11O15085 1522 aa42.32■■■■■ 4.37
ATP6V0B-210ENST00000498208 CHD1O14646 1710 aa42.32■■■■■ 4.36
ATP6V0B-210ENST00000498208 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.27■■■■■ 4.36
ATP6V0B-210ENST00000498208 SOGA1O94964 1423 aa42.21■■■■■ 4.35
ATP6V0B-210ENST00000498208 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.15■■■■■ 4.34
ATP6V0B-210ENST00000498208 FBLN2P98095 1184 aa42.14■■■■■ 4.34
ATP6V0B-210ENST00000498208 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
ATP6V0B-210ENST00000498208 CUX1P39880 1505 aa42.11■■■■■ 4.33
ATP6V0B-210ENST00000498208 WDR97A6NE52 1622 aa42.07■■■■■ 4.33
ATP6V0B-210ENST00000498208 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.99■■■■■ 4.31
ATP6V0B-210ENST00000498208 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.99■■■■■ 4.31
ATP6V0B-210ENST00000498208 ARAP1Q96P48 1450 aa41.9■■■■■ 4.3
ATP6V0B-210ENST00000498208 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
ATP6V0B-210ENST00000498208 GRIN2BQ13224 1484 aa41.86■■■■■ 4.29
ATP6V0B-210ENST00000498208 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
ATP6V0B-210ENST00000498208 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
ATP6V0B-210ENST00000498208 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.8■■■■■ 4.28
ATP6V0B-210ENST00000498208 SYNJ1O43426 1573 aa41.77■■■■■ 4.28
ATP6V0B-210ENST00000498208 PBRM1Q86U86 1689 aa41.74■■■■■ 4.27
ATP6V0B-210ENST00000498208 SYNJ2O15056 1496 aa41.73■■■■■ 4.27
ATP6V0B-210ENST00000498208 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.72■■■■■ 4.27
ATP6V0B-210ENST00000498208 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.67■■■■■ 4.26
ATP6V0B-210ENST00000498208 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.64■■■■■ 4.26
ATP6V0B-210ENST00000498208 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
ATP6V0B-210ENST00000498208 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
ATP6V0B-210ENST00000498208 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.44■■■■■ 4.22
ATP6V0B-210ENST00000498208 TOP2BQ02880 1626 aa41.43■■■■■ 4.22
ATP6V0B-210ENST00000498208 GRIN2AQ12879 1464 aa41.34■■■■■ 4.21
ATP6V0B-210ENST00000498208 ADAMTS12P58397 1594 aa41.32■■■■■ 4.2
ATP6V0B-210ENST00000498208 CEP170Q5SW79 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
ATP6V0B-210ENST00000498208 NUP160Q12769 1436 aa41.18■■■■■ 4.18
ATP6V0B-210ENST00000498208 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.18■■■■■ 4.18
ATP6V0B-210ENST00000498208 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.15■■■■■ 4.18
ATP6V0B-210ENST00000498208 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.15■■■■■ 4.18
ATP6V0B-210ENST00000498208 SHROOM2Q13796 1616 aa41.04■■■■■ 4.16
ATP6V0B-210ENST00000498208 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
ATP6V0B-210ENST00000498208 JPH4Q96JJ6 628 aa40.75■■■■■ 4.11
ATP6V0B-210ENST00000498208 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.74■■■■■ 4.11
ATP6V0B-210ENST00000498208 KIF27Q86VH2 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms