RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496927.5

USP20-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 5

Gene USP20, Length 646 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-209ENST00000496927 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.41■■■□□ 2.46
USP20-209ENST00000496927 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.87■■□□□ 1.89
USP20-209ENST00000496927 ABCC9O60706 1549 aa26.07■■□□□ 1.76
USP20-209ENST00000496927 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
USP20-209ENST00000496927 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.4■■□□□ 1.66
USP20-209ENST00000496927 NACADO15069 1562 aa25.18■■□□□ 1.62
USP20-209ENST00000496927 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.16■■□□□ 1.62
USP20-209ENST00000496927 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.12■■□□□ 1.61
USP20-209ENST00000496927 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
USP20-209ENST00000496927 SCRIBQ14160 1630 aa24.66■■□□□ 1.54
USP20-209ENST00000496927 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.58■■□□□ 1.52
USP20-209ENST00000496927 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
USP20-209ENST00000496927 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.38■■□□□ 1.49
USP20-209ENST00000496927 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.36■■□□□ 1.49
USP20-209ENST00000496927 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
USP20-209ENST00000496927 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.68■■□□□ 1.38
USP20-209ENST00000496927 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
USP20-209ENST00000496927 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.55■■□□□ 1.36
USP20-209ENST00000496927 SMARCA4P51532 1647 aa23.55■■□□□ 1.36
USP20-209ENST00000496927 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.54■■□□□ 1.36
USP20-209ENST00000496927 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.47■■□□□ 1.35
USP20-209ENST00000496927 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.32■■□□□ 1.32
USP20-209ENST00000496927 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
USP20-209ENST00000496927 SMARCA2P51531 1590 aa23.31■■□□□ 1.32
USP20-209ENST00000496927 WIZO95785 1651 aa23.25■■□□□ 1.31
USP20-209ENST00000496927 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.24■■□□□ 1.31
USP20-209ENST00000496927 NCAPD3P42695 1498 aa23.21■■□□□ 1.31
USP20-209ENST00000496927 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
USP20-209ENST00000496927 HMGXB3Q12766 1538 aa23.16■■□□□ 1.3
USP20-209ENST00000496927 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
USP20-209ENST00000496927 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
USP20-209ENST00000496927 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.73■■□□□ 1.23
USP20-209ENST00000496927 NESP48681 1621 aa22.64■■□□□ 1.21
USP20-209ENST00000496927 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.59■■□□□ 1.21
USP20-209ENST00000496927 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.58■■□□□ 1.2
USP20-209ENST00000496927 CFTRP13569 1480 aa22.51■■□□□ 1.19
USP20-209ENST00000496927 ERCC6Q03468 1493 aa22.46■■□□□ 1.19
USP20-209ENST00000496927 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
USP20-209ENST00000496927 PRDM2Q13029 1718 aa22.39■■□□□ 1.17
USP20-209ENST00000496927 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-209ENST00000496927 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-209ENST00000496927 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.32■■□□□ 1.16
USP20-209ENST00000496927 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.2■■□□□ 1.14
USP20-209ENST00000496927 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP20-209ENST00000496927 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP20-209ENST00000496927 WDR62O43379 1518 aa22.09■■□□□ 1.13
USP20-209ENST00000496927 ABCC8Q09428 1581 aa22.07■■□□□ 1.12
USP20-209ENST00000496927 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.04■■□□□ 1.12
USP20-209ENST00000496927 TOPBP1Q92547 1522 aa22.04■■□□□ 1.12
USP20-209ENST00000496927 CUX2O14529 1486 aa22.01■■□□□ 1.11
USP20-209ENST00000496927 CUX1P39880 1505 aa22.01■■□□□ 1.11
USP20-209ENST00000496927 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
USP20-209ENST00000496927 SYNJ1O43426 1573 aa21.94■■□□□ 1.1
USP20-209ENST00000496927 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.9■■□□□ 1.1
USP20-209ENST00000496927 TOP2BQ02880 1626 aa21.88■■□□□ 1.09
USP20-209ENST00000496927 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
USP20-209ENST00000496927 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.88■■□□□ 1.09
USP20-209ENST00000496927 IFT140Q96RY7 1462 aa21.81■■□□□ 1.08
USP20-209ENST00000496927 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.81■■□□□ 1.08
USP20-209ENST00000496927 SOGA1O94964 1423 aa21.8■■□□□ 1.08
USP20-209ENST00000496927 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
USP20-209ENST00000496927 TRIM41Q8WV44 630 aa21.74■■□□□ 1.07
USP20-209ENST00000496927 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
USP20-209ENST00000496927 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.67■■□□□ 1.06
USP20-209ENST00000496927 WDR97A6NE52 1622 aa21.66■■□□□ 1.06
USP20-209ENST00000496927 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.65■■□□□ 1.06
USP20-209ENST00000496927 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
USP20-209ENST00000496927 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
USP20-209ENST00000496927 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 36.7
USP20-209ENST00000496927 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.55■■□□□ 1.04
USP20-209ENST00000496927 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.55■■□□□ 1.04
USP20-209ENST00000496927 KIF27Q86VH2 1401 aa21.51■■□□□ 1.03
USP20-209ENST00000496927 PBRM1Q86U86 1689 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-209ENST00000496927 GRIN2BQ13224 1484 aa21.5■■□□□ 1.03
USP20-209ENST00000496927 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.45■■□□□ 1.03
USP20-209ENST00000496927 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.43■■□□□ 1.02
USP20-209ENST00000496927 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.39■■□□□ 1.02
USP20-209ENST00000496927 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
USP20-209ENST00000496927 FBLN2P98095 1184 aa21.37■■□□□ 1.01
USP20-209ENST00000496927 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
USP20-209ENST00000496927 ADAMTS12P58397 1594 aa21.35■■□□□ 1.01
USP20-209ENST00000496927 IGF1RP08069 1367 aa21.34■■□□□ 1.01
USP20-209ENST00000496927 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
USP20-209ENST00000496927 SYNJ2O15056 1496 aa21.31■■□□□ 1
USP20-209ENST00000496927 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.3■■□□□ 1
USP20-209ENST00000496927 CHD1O14646 1710 aa21.3■■□□□ 1
USP20-209ENST00000496927 CUL7Q14999 1698 aa21.3■■□□□ 1
USP20-209ENST00000496927 EEA1Q15075 1411 aa21.29■■□□□ 1
USP20-209ENST00000496927 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.25■□□□□ 0.99
USP20-209ENST00000496927 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.23■□□□□ 0.99
USP20-209ENST00000496927 GRIN2AQ12879 1464 aa21.22■□□□□ 0.99
USP20-209ENST00000496927 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.17■□□□□ 0.98
USP20-209ENST00000496927 OSCARQ8IYS5 282 aa21.16■□□□□ 0.98
USP20-209ENST00000496927 PRXQ9BXM0 1461 aa21.14■□□□□ 0.98
USP20-209ENST00000496927 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.13■□□□□ 0.97
USP20-209ENST00000496927 CEP170Q5SW79 1584 aa21.11■□□□□ 0.97
USP20-209ENST00000496927 NUP160Q12769 1436 aa21.08■□□□□ 0.97
USP20-209ENST00000496927 KIF21BO75037 1637 aa21.07■□□□□ 0.96
USP20-209ENST00000496927 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.04■□□□□ 0.96
USP20-209ENST00000496927 GOLGA3Q08378 1498 aa21■□□□□ 0.95
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