RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496824.5

PFKL-210, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 5

Gene PFKL, Length 1,063 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-210ENST00000496824 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.55■■■■■ 5.52
PFKL-210ENST00000496824 ABCC9O60706 1549 aa44.62■■■■■ 4.73
PFKL-210ENST00000496824 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.55■■■■■ 4.72
PFKL-210ENST00000496824 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.4■■■■■ 4.38
PFKL-210ENST00000496824 NACADO15069 1562 aa42.05■■■■■ 4.32
PFKL-210ENST00000496824 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.86■■■■■ 4.29
PFKL-210ENST00000496824 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.84■■■■■ 4.29
PFKL-210ENST00000496824 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.62■■■■■ 4.25
PFKL-210ENST00000496824 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.233e-7■□□□□ 10.7
PFKL-210ENST00000496824 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.38■■■■■ 4.21
PFKL-210ENST00000496824 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.22■■■■■ 4.19
PFKL-210ENST00000496824 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
PFKL-210ENST00000496824 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.86■■■■■ 4.13
PFKL-210ENST00000496824 SCRIBQ14160 1630 aa40.67■■■■■ 4.1
PFKL-210ENST00000496824 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.51■■■■■ 4.08
PFKL-210ENST00000496824 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.31■■■■■ 4.04
PFKL-210ENST00000496824 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
PFKL-210ENST00000496824 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.15■■■■■ 4.02
PFKL-210ENST00000496824 NCAPD3P42695 1498 aa38.78■■■■□ 3.8
PFKL-210ENST00000496824 SMARCA4P51532 1647 aa38.74■■■■□ 3.79
PFKL-210ENST00000496824 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.71■■■■□ 3.79
PFKL-210ENST00000496824 SMARCA2P51531 1590 aa38.6■■■■□ 3.77
PFKL-210ENST00000496824 HMGXB3Q12766 1538 aa38.56■■■■□ 3.76
PFKL-210ENST00000496824 ERCC6Q03468 1493 aa38.51■■■■□ 3.76
PFKL-210ENST00000496824 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PFKL-210ENST00000496824 CUX2O14529 1486 aa38.4■■■■□ 3.74
PFKL-210ENST00000496824 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.38■■■■□ 3.73
PFKL-210ENST00000496824 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.36■■■■□ 3.73
PFKL-210ENST00000496824 NESP48681 1621 aa38.34■■■■□ 3.73
PFKL-210ENST00000496824 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.28■■■■□ 3.72
PFKL-210ENST00000496824 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.23■■■■□ 3.71
PFKL-210ENST00000496824 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.99■■■■□ 3.67
PFKL-210ENST00000496824 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
PFKL-210ENST00000496824 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.92■■■■□ 3.66
PFKL-210ENST00000496824 WIZO95785 1651 aa37.84■■■■□ 3.65
PFKL-210ENST00000496824 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.7■■■■□ 3.63
PFKL-210ENST00000496824 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.6■■■■□ 3.61
PFKL-210ENST00000496824 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.45■■■■□ 3.59
PFKL-210ENST00000496824 WDR62O43379 1518 aa37.38■■■■□ 3.57
PFKL-210ENST00000496824 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
PFKL-210ENST00000496824 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.31■■■■□ 3.56
PFKL-210ENST00000496824 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
PFKL-210ENST00000496824 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.25■■■■□ 3.55
PFKL-210ENST00000496824 CFTRP13569 1480 aa37.19■■■■□ 3.54
PFKL-210ENST00000496824 PRDM2Q13029 1718 aa36.99■■■■□ 3.51
PFKL-210ENST00000496824 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
PFKL-210ENST00000496824 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.82■■■■□ 3.49
PFKL-210ENST00000496824 TRIM41Q8WV44 630 aa36.8■■■■□ 3.48
PFKL-210ENST00000496824 OSCARQ8IYS5 282 aa36.57■■■■□ 3.44
PFKL-210ENST00000496824 TOPBP1Q92547 1522 aa36.55■■■■□ 3.44
PFKL-210ENST00000496824 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
PFKL-210ENST00000496824 IFT140Q96RY7 1462 aa36.51■■■■□ 3.44
PFKL-210ENST00000496824 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.43■■■■□ 3.42
PFKL-210ENST00000496824 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
PFKL-210ENST00000496824 ABCC8Q09428 1581 aa36.36■■■■□ 3.41
PFKL-210ENST00000496824 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.29■■■■□ 3.4
PFKL-210ENST00000496824 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.29■■■■□ 3.4
PFKL-210ENST00000496824 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.29■■■■□ 3.4
PFKL-210ENST00000496824 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
PFKL-210ENST00000496824 CHD1O14646 1710 aa36.19■■■■□ 3.38
PFKL-210ENST00000496824 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.386e-7■■■■■ 42
PFKL-210ENST00000496824 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
PFKL-210ENST00000496824 ARHGEF11O15085 1522 aa36.12■■■■□ 3.37
PFKL-210ENST00000496824 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.07■■■■□ 3.37
PFKL-210ENST00000496824 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.96■■■■□ 3.35
PFKL-210ENST00000496824 SOGA1O94964 1423 aa35.95■■■■□ 3.35
PFKL-210ENST00000496824 FBLN2P98095 1184 aa35.94■■■■□ 3.34
PFKL-210ENST00000496824 CUX1P39880 1505 aa35.93■■■■□ 3.34
PFKL-210ENST00000496824 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
PFKL-210ENST00000496824 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.84■■■■□ 3.33
PFKL-210ENST00000496824 WDR97A6NE52 1622 aa35.82■■■■□ 3.32
PFKL-210ENST00000496824 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.78■■■■□ 3.32
PFKL-210ENST00000496824 ARAP1Q96P48 1450 aa35.76■■■■□ 3.32
PFKL-210ENST00000496824 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
PFKL-210ENST00000496824 PBRM1Q86U86 1689 aa35.68■■■■□ 3.3
PFKL-210ENST00000496824 GRIN2BQ13224 1484 aa35.67■■■■□ 3.3
PFKL-210ENST00000496824 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
PFKL-210ENST00000496824 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.66■■■■□ 3.3
PFKL-210ENST00000496824 SYNJ1O43426 1573 aa35.62■■■■□ 3.29
PFKL-210ENST00000496824 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
PFKL-210ENST00000496824 SYNJ2O15056 1496 aa35.56■■■■□ 3.28
PFKL-210ENST00000496824 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.54■■■■□ 3.28
PFKL-210ENST00000496824 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.54■■■■□ 3.28
PFKL-210ENST00000496824 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.49■■■■□ 3.27
PFKL-210ENST00000496824 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
PFKL-210ENST00000496824 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.37■■■■□ 3.25
PFKL-210ENST00000496824 TOP2BQ02880 1626 aa35.33■■■■□ 3.25
PFKL-210ENST00000496824 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.32■■■■□ 3.24
PFKL-210ENST00000496824 ADAMTS12P58397 1594 aa35.28■■■■□ 3.24
PFKL-210ENST00000496824 GRIN2AQ12879 1464 aa35.24■■■■□ 3.23
PFKL-210ENST00000496824 CEP170Q5SW79 1584 aa35.18■■■■□ 3.22
PFKL-210ENST00000496824 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.17■■■■□ 3.22
PFKL-210ENST00000496824 NUP160Q12769 1436 aa35.08■■■■□ 3.21
PFKL-210ENST00000496824 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.06■■■■□ 3.2
PFKL-210ENST00000496824 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.05■■■■□ 3.2
PFKL-210ENST00000496824 SHROOM2Q13796 1616 aa35.01■■■■□ 3.19
PFKL-210ENST00000496824 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.8■■■■□ 3.16
PFKL-210ENST00000496824 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
PFKL-210ENST00000496824 JPH4Q96JJ6 628 aa34.66■■■■□ 3.14
PFKL-210ENST00000496824 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.3 ms