RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495835.1

HLA-C-209, Transcript of major histocompatibility complex, class I, C, humanhuman

Gene HLA-C, Length 1,073 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-C-209ENST00000495835 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.82■■■■■ 7.17
HLA-C-209ENST00000495835 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.49■■■■■ 6.15
HLA-C-209ENST00000495835 ABCC9O60706 1549 aa52.74■■■■■ 6.03
HLA-C-209ENST00000495835 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.61■■■■■ 5.69
HLA-C-209ENST00000495835 NACADO15069 1562 aa50.44■■■■■ 5.67
HLA-C-209ENST00000495835 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.11■■■■■ 5.61
HLA-C-209ENST00000495835 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.03■■■■■ 5.6
HLA-C-209ENST00000495835 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.54
HLA-C-209ENST00000495835 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.56■■■■■ 5.52
HLA-C-209ENST00000495835 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.39■■■■■ 5.5
HLA-C-209ENST00000495835 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.16■■■■■ 5.46
HLA-C-209ENST00000495835 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.03■■■■■ 5.44
HLA-C-209ENST00000495835 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.93■■■■■ 5.42
HLA-C-209ENST00000495835 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.64■■■■■ 5.38
HLA-C-209ENST00000495835 SCRIBQ14160 1630 aa48.59■■■■■ 5.37
HLA-C-209ENST00000495835 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
HLA-C-209ENST00000495835 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.74■■■■■ 5.23
HLA-C-209ENST00000495835 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.51■■■■■ 5.2
HLA-C-209ENST00000495835 NCAPD3P42695 1498 aa46.55■■■■■ 5.04
HLA-C-209ENST00000495835 SMARCA4P51532 1647 aa46.51■■■■■ 5.04
HLA-C-209ENST00000495835 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.43■■■■■ 5.02
HLA-C-209ENST00000495835 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.43■■■■■ 5.02
HLA-C-209ENST00000495835 SMARCA2P51531 1590 aa46.39■■■■■ 5.02
HLA-C-209ENST00000495835 HMGXB3Q12766 1538 aa46.25■■■■■ 4.99
HLA-C-209ENST00000495835 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.15■■■■■ 4.98
HLA-C-209ENST00000495835 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.02■■■■■ 4.96
HLA-C-209ENST00000495835 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
HLA-C-209ENST00000495835 ERCC6Q03468 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
HLA-C-209ENST00000495835 WIZO95785 1651 aa45.49■■■■■ 4.87
HLA-C-209ENST00000495835 NESP48681 1621 aa45.45■■■■■ 4.87
HLA-C-209ENST00000495835 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.41■■■■■ 4.86
HLA-C-209ENST00000495835 CUX2O14529 1486 aa45.37■■■■■ 4.85
HLA-C-209ENST00000495835 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.33■■■■■ 4.85
HLA-C-209ENST00000495835 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.13■■■■■ 4.82
HLA-C-209ENST00000495835 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.12■■■■■ 4.81
HLA-C-209ENST00000495835 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
HLA-C-209ENST00000495835 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
HLA-C-209ENST00000495835 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.94■■■■■ 4.78
HLA-C-209ENST00000495835 CFTRP13569 1480 aa44.74■■■■■ 4.75
HLA-C-209ENST00000495835 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.64■■■■■ 4.74
HLA-C-209ENST00000495835 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.64■■■■■ 4.74
HLA-C-209ENST00000495835 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.58■■■■■ 4.73
HLA-C-209ENST00000495835 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.57■■■■■ 4.73
HLA-C-209ENST00000495835 WDR62O43379 1518 aa44.52■■■■■ 4.72
HLA-C-209ENST00000495835 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.48■■■■■ 4.71
HLA-C-209ENST00000495835 PRDM2Q13029 1718 aa44.36■■■■■ 4.69
HLA-C-209ENST00000495835 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
HLA-C-209ENST00000495835 ABCC8Q09428 1581 aa43.88■■■■■ 4.62
HLA-C-209ENST00000495835 TOPBP1Q92547 1522 aa43.79■■■■■ 4.6
HLA-C-209ENST00000495835 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.71■■■■■ 4.59
HLA-C-209ENST00000495835 IFT140Q96RY7 1462 aa43.7■■■■■ 4.59
HLA-C-209ENST00000495835 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
HLA-C-209ENST00000495835 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
HLA-C-209ENST00000495835 OSCARQ8IYS5 282 aa43.38■■■■■ 4.53
HLA-C-209ENST00000495835 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
HLA-C-209ENST00000495835 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
HLA-C-209ENST00000495835 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
HLA-C-209ENST00000495835 CUX1P39880 1505 aa43.22■■■■■ 4.51
HLA-C-209ENST00000495835 SOGA1O94964 1423 aa43.22■■■■■ 4.51
HLA-C-209ENST00000495835 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.17■■■■■ 4.5
HLA-C-209ENST00000495835 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.16■■■■■ 4.56e-7■■■■■ 27.8
HLA-C-209ENST00000495835 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.14■■■■■ 4.5
HLA-C-209ENST00000495835 WDR97A6NE52 1622 aa43.11■■■■■ 4.49
HLA-C-209ENST00000495835 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
HLA-C-209ENST00000495835 CHD1O14646 1710 aa42.85■■■■■ 4.45
HLA-C-209ENST00000495835 GRIN2BQ13224 1484 aa42.8■■■■■ 4.44
HLA-C-209ENST00000495835 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.78■■■■■ 4.44
HLA-C-209ENST00000495835 TRIM41Q8WV44 630 aa42.77■■■■■ 4.44
HLA-C-209ENST00000495835 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
HLA-C-209ENST00000495835 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.76■■■■■ 4.44
HLA-C-209ENST00000495835 TOP2BQ02880 1626 aa42.75■■■■■ 4.43
HLA-C-209ENST00000495835 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.75■■■■■ 4.43
HLA-C-209ENST00000495835 FBLN2P98095 1184 aa42.74■■■■■ 4.43
HLA-C-209ENST00000495835 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.74■■■■■ 4.43
HLA-C-209ENST00000495835 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.7■■■■■ 4.43
HLA-C-209ENST00000495835 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.67■■■■■ 4.42
HLA-C-209ENST00000495835 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.67■■■■■ 4.42
HLA-C-209ENST00000495835 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.67■■■■■ 4.42
HLA-C-209ENST00000495835 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.63■■■■■ 4.41
HLA-C-209ENST00000495835 SYNJ1O43426 1573 aa42.62■■■■■ 4.41
HLA-C-209ENST00000495835 PBRM1Q86U86 1689 aa42.62■■■■■ 4.41
HLA-C-209ENST00000495835 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
HLA-C-209ENST00000495835 ARHGEF11O15085 1522 aa42.61■■■■■ 4.41
HLA-C-209ENST00000495835 SYNJ2O15056 1496 aa42.58■■■■■ 4.41
HLA-C-209ENST00000495835 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.41■■■■■ 4.38
HLA-C-209ENST00000495835 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.29■■■■■ 4.36
HLA-C-209ENST00000495835 ADAMTS12P58397 1594 aa42.24■■■■■ 4.35
HLA-C-209ENST00000495835 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.23■■■■■ 4.35
HLA-C-209ENST00000495835 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.21■■■■■ 4.35
HLA-C-209ENST00000495835 GRIN2AQ12879 1464 aa42.21■■■■■ 4.35
HLA-C-209ENST00000495835 ARAP1Q96P48 1450 aa42.2■■■■■ 4.35
HLA-C-209ENST00000495835 NUP160Q12769 1436 aa42.07■■■■■ 4.33
HLA-C-209ENST00000495835 CEP170Q5SW79 1584 aa41.99■■■■■ 4.31
HLA-C-209ENST00000495835 KIF27Q86VH2 1401 aa41.95■■■■■ 4.31
HLA-C-209ENST00000495835 IGF1RP08069 1367 aa41.84■■■■■ 4.29
HLA-C-209ENST00000495835 SHROOM2Q13796 1616 aa41.83■■■■■ 4.29
HLA-C-209ENST00000495835 CUL7Q14999 1698 aa41.77■■■■■ 4.28
HLA-C-209ENST00000495835 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.68■■■■■ 4.26
HLA-C-209ENST00000495835 JPH4Q96JJ6 628 aa41.65■■■■■ 4.26
HLA-C-209ENST00000495835 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.64■■■■■ 4.26
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