RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495622.5

ITIH3-210, Transcript of inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain 3, humanhuman

TSL 5

Gene ITIH3, Length 920 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3-210ENST00000495622 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.66■■■■□ 3.62
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ITIH3-210ENST00000495622 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.11■■■□□ 2.73
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ITIH3-210ENST00000495622 NACADO15069 1562 aa31.91■■■□□ 2.7
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ITIH3-210ENST00000495622 SCRIBQ14160 1630 aa30.73■■■□□ 2.51
ITIH3-210ENST00000495622 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.54■■■□□ 2.48
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ITIH3-210ENST00000495622 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.44■■■□□ 2.46
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ITIH3-210ENST00000495622 SMARCA2P51531 1590 aa29.26■■■□□ 2.27
ITIH3-210ENST00000495622 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.25■■■□□ 2.27
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ITIH3-210ENST00000495622 ERCC6Q03468 1493 aa29.1■■■□□ 2.25
ITIH3-210ENST00000495622 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.09■■■□□ 2.25
ITIH3-210ENST00000495622 NESP48681 1621 aa29.08■■■□□ 2.25
ITIH3-210ENST00000495622 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
ITIH3-210ENST00000495622 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.04■■■□□ 2.24
ITIH3-210ENST00000495622 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.79■■■□□ 2.2
ITIH3-210ENST00000495622 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
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ITIH3-210ENST00000495622 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.64■■■□□ 2.17
ITIH3-210ENST00000495622 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.62■■■□□ 2.17
ITIH3-210ENST00000495622 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.62■■■□□ 2.17
ITIH3-210ENST00000495622 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
ITIH3-210ENST00000495622 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.39■■■□□ 2.13
ITIH3-210ENST00000495622 WDR62O43379 1518 aa28.33■■■□□ 2.13
ITIH3-210ENST00000495622 CFTRP13569 1480 aa28.29■■■□□ 2.12
ITIH3-210ENST00000495622 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
ITIH3-210ENST00000495622 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.25■■■□□ 2.11
ITIH3-210ENST00000495622 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.24■■■□□ 2.11
ITIH3-210ENST00000495622 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
ITIH3-210ENST00000495622 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.02■■■□□ 2.08
ITIH3-210ENST00000495622 PRDM2Q13029 1718 aa27.89■■■□□ 2.05
ITIH3-210ENST00000495622 TRIM41Q8WV44 630 aa27.86■■■□□ 2.05
ITIH3-210ENST00000495622 OSCARQ8IYS5 282 aa27.83■■■□□ 2.05
ITIH3-210ENST00000495622 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
ITIH3-210ENST00000495622 TOPBP1Q92547 1522 aa27.72■■■□□ 2.03
ITIH3-210ENST00000495622 IFT140Q96RY7 1462 aa27.7■■■□□ 2.03
ITIH3-210ENST00000495622 ABCC8Q09428 1581 aa27.62■■■□□ 2.01
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ITIH3-210ENST00000495622 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.44■■□□□ 1.98
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ITIH3-210ENST00000495622 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.44■■□□□ 1.98
ITIH3-210ENST00000495622 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.38■■□□□ 1.97
ITIH3-210ENST00000495622 ARHGEF11O15085 1522 aa27.35■■□□□ 1.97
ITIH3-210ENST00000495622 SOGA1O94964 1423 aa27.33■■□□□ 1.97
ITIH3-210ENST00000495622 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ITIH3-210ENST00000495622 CHD1O14646 1710 aa27.29■■□□□ 1.96
ITIH3-210ENST00000495622 CUX1P39880 1505 aa27.26■■□□□ 1.96
ITIH3-210ENST00000495622 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.25■■□□□ 1.95
ITIH3-210ENST00000495622 FBLN2P98095 1184 aa27.22■■□□□ 1.95
ITIH3-210ENST00000495622 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.19■■□□□ 1.94
ITIH3-210ENST00000495622 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.13■■□□□ 1.93
ITIH3-210ENST00000495622 WDR97A6NE52 1622 aa27.13■■□□□ 1.93
ITIH3-210ENST00000495622 ARAP1Q96P48 1450 aa27.11■■□□□ 1.93
ITIH3-210ENST00000495622 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
ITIH3-210ENST00000495622 GRIN2BQ13224 1484 aa27.06■■□□□ 1.92
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ITIH3-210ENST00000495622 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.03■■□□□ 1.92
ITIH3-210ENST00000495622 SYNJ2O15056 1496 aa26.98■■□□□ 1.91
ITIH3-210ENST00000495622 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.97■■□□□ 1.91
ITIH3-210ENST00000495622 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.95■■□□□ 1.91
ITIH3-210ENST00000495622 SYNJ1O43426 1573 aa26.92■■□□□ 1.9
ITIH3-210ENST00000495622 PBRM1Q86U86 1689 aa26.91■■□□□ 1.9
ITIH3-210ENST00000495622 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.9■■□□□ 1.9
ITIH3-210ENST00000495622 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ITIH3-210ENST00000495622 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
ITIH3-210ENST00000495622 TOP2BQ02880 1626 aa26.78■■□□□ 1.88
ITIH3-210ENST00000495622 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.78■■□□□ 1.88
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ITIH3-210ENST00000495622 ADAMTS12P58397 1594 aa26.67■■□□□ 1.86
ITIH3-210ENST00000495622 NUP160Q12769 1436 aa26.67■■□□□ 1.86
ITIH3-210ENST00000495622 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.66■■□□□ 1.86
ITIH3-210ENST00000495622 CEP170Q5SW79 1584 aa26.64■■□□□ 1.86
ITIH3-210ENST00000495622 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.63■■□□□ 1.85
ITIH3-210ENST00000495622 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.59■■□□□ 1.85
ITIH3-210ENST00000495622 SHROOM2Q13796 1616 aa26.54■■□□□ 1.84
ITIH3-210ENST00000495622 JPH4Q96JJ6 628 aa26.41■■□□□ 1.82
ITIH3-210ENST00000495622 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
ITIH3-210ENST00000495622 IGF1RP08069 1367 aa26.35■■□□□ 1.81
ITIH3-210ENST00000495622 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.3■■□□□ 1.8
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