RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495354.1

ARF4-208, Transcript of ADP ribosylation factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene ARF4, Length 495 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4-208ENST00000495354 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.62■■■□□ 2.49
ARF4-208ENST00000495354 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.61■■■□□ 2.01
ARF4-208ENST00000495354 ABCC9O60706 1549 aa27.59■■■□□ 2.01
ARF4-208ENST00000495354 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.33■■□□□ 1.8
ARF4-208ENST00000495354 NACADO15069 1562 aa26.12■■□□□ 1.77
ARF4-208ENST00000495354 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.84■■□□□ 1.73
ARF4-208ENST00000495354 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.81■■□□□ 1.72
ARF4-208ENST00000495354 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.76■■□□□ 1.71
ARF4-208ENST00000495354 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.62■■□□□ 1.69
ARF4-208ENST00000495354 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
ARF4-208ENST00000495354 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.44■■□□□ 1.66
ARF4-208ENST00000495354 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ARF4-208ENST00000495354 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.36■■□□□ 1.65
ARF4-208ENST00000495354 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.3■■□□□ 1.64
ARF4-208ENST00000495354 SCRIBQ14160 1630 aa25.06■■□□□ 1.6
ARF4-208ENST00000495354 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.95■■□□□ 1.58
ARF4-208ENST00000495354 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.91■■□□□ 1.58
ARF4-208ENST00000495354 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ARF4-208ENST00000495354 NCAPD3P42695 1498 aa24.07■■□□□ 1.44
ARF4-208ENST00000495354 SMARCA2P51531 1590 aa23.96■■□□□ 1.43
ARF4-208ENST00000495354 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.96■■□□□ 1.43
ARF4-208ENST00000495354 CUX2O14529 1486 aa23.95■■□□□ 1.42
ARF4-208ENST00000495354 HMGXB3Q12766 1538 aa23.94■■□□□ 1.42
ARF4-208ENST00000495354 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.93■■□□□ 1.42
ARF4-208ENST00000495354 ERCC6Q03468 1493 aa23.93■■□□□ 1.42
ARF4-208ENST00000495354 SMARCA4P51532 1647 aa23.92■■□□□ 1.42
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ARF4-208ENST00000495354 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ARF4-208ENST00000495354 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.73■■□□□ 1.39
ARF4-208ENST00000495354 NESP48681 1621 aa23.62■■□□□ 1.37
ARF4-208ENST00000495354 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.59■■□□□ 1.37
ARF4-208ENST00000495354 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.53■■□□□ 1.36
ARF4-208ENST00000495354 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ARF4-208ENST00000495354 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.46■■□□□ 1.35
ARF4-208ENST00000495354 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.38■■□□□ 1.33
ARF4-208ENST00000495354 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.32■■□□□ 1.32
ARF4-208ENST00000495354 WIZO95785 1651 aa23.25■■□□□ 1.31
ARF4-208ENST00000495354 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.24■■□□□ 1.31
ARF4-208ENST00000495354 WDR62O43379 1518 aa23.18■■□□□ 1.3
ARF4-208ENST00000495354 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.14■■□□□ 1.29
ARF4-208ENST00000495354 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.06■■□□□ 1.28
ARF4-208ENST00000495354 CFTRP13569 1480 aa23.05■■□□□ 1.28
ARF4-208ENST00000495354 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
ARF4-208ENST00000495354 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ARF4-208ENST00000495354 PRDM2Q13029 1718 aa22.85■■□□□ 1.25
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ARF4-208ENST00000495354 TRIM41Q8WV44 630 aa22.83■■□□□ 1.25
ARF4-208ENST00000495354 OSCARQ8IYS5 282 aa22.76■■□□□ 1.23
ARF4-208ENST00000495354 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.7■■□□□ 1.22
ARF4-208ENST00000495354 IFT140Q96RY7 1462 aa22.68■■□□□ 1.22
ARF4-208ENST00000495354 ABCC8Q09428 1581 aa22.64■■□□□ 1.22
ARF4-208ENST00000495354 TOPBP1Q92547 1522 aa22.61■■□□□ 1.21
ARF4-208ENST00000495354 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.55■■□□□ 1.2
ARF4-208ENST00000495354 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ARF4-208ENST00000495354 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ARF4-208ENST00000495354 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
ARF4-208ENST00000495354 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
ARF4-208ENST00000495354 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.46■■□□□ 1.19
ARF4-208ENST00000495354 ARHGEF11O15085 1522 aa22.41■■□□□ 1.18
ARF4-208ENST00000495354 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ARF4-208ENST00000495354 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ARF4-208ENST00000495354 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
ARF4-208ENST00000495354 CHD1O14646 1710 aa22.32■■□□□ 1.16
ARF4-208ENST00000495354 WDR97A6NE52 1622 aa22.31■■□□□ 1.16
ARF4-208ENST00000495354 SOGA1O94964 1423 aa22.25■■□□□ 1.15
ARF4-208ENST00000495354 FBLN2P98095 1184 aa22.23■■□□□ 1.15
ARF4-208ENST00000495354 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.22■■□□□ 1.15
ARF4-208ENST00000495354 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.21■■□□□ 1.15
ARF4-208ENST00000495354 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.18■■□□□ 1.14
ARF4-208ENST00000495354 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ARF4-208ENST00000495354 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.16■■□□□ 1.14
ARF4-208ENST00000495354 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ARF4-208ENST00000495354 ARAP1Q96P48 1450 aa22.15■■□□□ 1.14
ARF4-208ENST00000495354 CUX1P39880 1505 aa22.14■■□□□ 1.13
ARF4-208ENST00000495354 SYNJ1O43426 1573 aa22.12■■□□□ 1.13
ARF4-208ENST00000495354 GRIN2BQ13224 1484 aa22.12■■□□□ 1.13
ARF4-208ENST00000495354 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ARF4-208ENST00000495354 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.08■■□□□ 1.13
ARF4-208ENST00000495354 SYNJ2O15056 1496 aa22.06■■□□□ 1.12
ARF4-208ENST00000495354 PBRM1Q86U86 1689 aa22.01■■□□□ 1.11
ARF4-208ENST00000495354 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ARF4-208ENST00000495354 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.01■■□□□ 1.11
ARF4-208ENST00000495354 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.99■■□□□ 1.11
ARF4-208ENST00000495354 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.95■■□□□ 1.1
ARF4-208ENST00000495354 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
ARF4-208ENST00000495354 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ARF4-208ENST00000495354 GRIN2AQ12879 1464 aa21.82■■□□□ 1.08
ARF4-208ENST00000495354 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.81■■□□□ 1.08
ARF4-208ENST00000495354 ADAMTS12P58397 1594 aa21.81■■□□□ 1.08
ARF4-208ENST00000495354 TOP2BQ02880 1626 aa21.8■■□□□ 1.08
ARF4-208ENST00000495354 NUP160Q12769 1436 aa21.75■■□□□ 1.07
ARF4-208ENST00000495354 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.74■■□□□ 1.07
ARF4-208ENST00000495354 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.73■■□□□ 1.07
ARF4-208ENST00000495354 CEP170Q5SW79 1584 aa21.71■■□□□ 1.07
ARF4-208ENST00000495354 SHROOM2Q13796 1616 aa21.66■■□□□ 1.06
ARF4-208ENST00000495354 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.64■■□□□ 1.05
ARF4-208ENST00000495354 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ARF4-208ENST00000495354 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ARF4-208ENST00000495354 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.5■■□□□ 1.03
ARF4-208ENST00000495354 JPH4Q96JJ6 628 aa21.48■■□□□ 1.03
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