RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.94■□□□□ 0.94
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PKP4-216ENST00000495123 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.08■□□□□ 0.64
PKP4-216ENST00000495123 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.56■□□□□ 0.56
PKP4-216ENST00000495123 ABCC9O60706 1549 aa18.14■□□□□ 0.49
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PKP4-216ENST00000495123 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
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PKP4-216ENST00000495123 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.44■□□□□ 0.38
PKP4-216ENST00000495123 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.34■□□□□ 0.37
PKP4-216ENST00000495123 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.31■□□□□ 0.36
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PKP4-216ENST00000495123 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.71■□□□□ 0.27
PKP4-216ENST00000495123 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.61■□□□□ 0.25
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PKP4-216ENST00000495123 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.4■□□□□ 0.22
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PKP4-216ENST00000495123 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.35■□□□□ 0.21
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PKP4-216ENST00000495123 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PKP4-216ENST00000495123 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.17■□□□□ 0.18
PKP4-216ENST00000495123 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.14■□□□□ 0.17
PKP4-216ENST00000495123 NCAPD3P42695 1498 aa16.1■□□□□ 0.17
PKP4-216ENST00000495123 SMARCA2P51531 1590 aa16.09■□□□□ 0.17
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PKP4-216ENST00000495123 WDR62O43379 1518 aa15.35■□□□□ 0.05
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PKP4-216ENST00000495123 SOGA1O94964 1423 aa15.04■□□□□ -0
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PKP4-216ENST00000495123 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.02□□□□□ -0.01
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PKP4-216ENST00000495123 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
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PKP4-216ENST00000495123 WDR97A6NE52 1622 aa14.95□□□□□ -0.02
PKP4-216ENST00000495123 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.93□□□□□ -0.02
PKP4-216ENST00000495123 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.87□□□□□ -0.03
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PKP4-216ENST00000495123 GRIN2BQ13224 1484 aa14.85□□□□□ -0.03
PKP4-216ENST00000495123 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.84□□□□□ -0.03
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PKP4-216ENST00000495123 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PKP4-216ENST00000495123 ADAMTS12P58397 1594 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP4-216ENST00000495123 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.71□□□□□ -0.05
PKP4-216ENST00000495123 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.69□□□□□ -0.06
PKP4-216ENST00000495123 IGF1RP08069 1367 aa14.68□□□□□ -0.06
PKP4-216ENST00000495123 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP4-216ENST00000495123 GRIN2AQ12879 1464 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP4-216ENST00000495123 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP4-216ENST00000495123 CUL7Q14999 1698 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP4-216ENST00000495123 CEP170Q5SW79 1584 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-216ENST00000495123 NUP160Q12769 1436 aa14.6□□□□□ -0.07
PKP4-216ENST00000495123 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.6□□□□□ -0.07
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