RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.63■■■■■ 6.66
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TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC9O60706 1549 aa50.67■■■■■ 5.7
TRDMT1-211ENST00000495022 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.37■■■■■ 5.33
TRDMT1-211ENST00000495022 NACADO15069 1562 aa48.06■■■■■ 5.28
TRDMT1-211ENST00000495022 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.6■■■■■ 5.21
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.45■■■■■ 5.19
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.43■■■■■ 5.18
TRDMT1-211ENST00000495022 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.37■■■■■ 5.17
TRDMT1-211ENST00000495022 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.11■■■■■ 5.13
TRDMT1-211ENST00000495022 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
TRDMT1-211ENST00000495022 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.95■■■■■ 5.11
TRDMT1-211ENST00000495022 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.86■■■■■ 5.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.4■■■■■ 5.02
TRDMT1-211ENST00000495022 SCRIBQ14160 1630 aa46.27■■■■■ 5
TRDMT1-211ENST00000495022 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.86■■■■■ 4.93
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
TRDMT1-211ENST00000495022 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.67■■■■■ 4.9
TRDMT1-211ENST00000495022 NCAPD3P42695 1498 aa44.33■■■■■ 4.69
TRDMT1-211ENST00000495022 SMARCA4P51532 1647 aa44.21■■■■■ 4.67
TRDMT1-211ENST00000495022 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.17■■■■■ 4.66
TRDMT1-211ENST00000495022 SMARCA2P51531 1590 aa44.12■■■■■ 4.65
TRDMT1-211ENST00000495022 HMGXB3Q12766 1538 aa44.06■■■■■ 4.64
TRDMT1-211ENST00000495022 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.81■■■■■ 4.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ERCC6Q03468 1493 aa43.78■■■■■ 4.6
TRDMT1-211ENST00000495022 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
TRDMT1-211ENST00000495022 CUX2O14529 1486 aa43.75■■■■■ 4.59
TRDMT1-211ENST00000495022 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.61■■■■■ 4.57
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.57■■■■■ 4.57
TRDMT1-211ENST00000495022 NESP48681 1621 aa43.55■■■■■ 4.56
TRDMT1-211ENST00000495022 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.37■■■■■ 4.53
TRDMT1-211ENST00000495022 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
TRDMT1-211ENST00000495022 WIZO95785 1651 aa43.12■■■■■ 4.49
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.11■■■■■ 4.49
TRDMT1-211ENST00000495022 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.06■■■■■ 4.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.95■■■■■ 4.47
TRDMT1-211ENST00000495022 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
TRDMT1-211ENST00000495022 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.69■■■■■ 4.42
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR62O43379 1518 aa42.62■■■■■ 4.41
TRDMT1-211ENST00000495022 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.54■■■■■ 4.4
TRDMT1-211ENST00000495022 CFTRP13569 1480 aa42.51■■■■■ 4.39
TRDMT1-211ENST00000495022 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.47■■■■■ 4.39
TRDMT1-211ENST00000495022 PRDM2Q13029 1718 aa42.26■■■■■ 4.36
TRDMT1-211ENST00000495022 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.06■■■■■ 4.32
TRDMT1-211ENST00000495022 TOPBP1Q92547 1522 aa41.69■■■■■ 4.26
TRDMT1-211ENST00000495022 IFT140Q96RY7 1462 aa41.68■■■■■ 4.26
TRDMT1-211ENST00000495022 OSCARQ8IYS5 282 aa41.67■■■■■ 4.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC8Q09428 1581 aa41.65■■■■■ 4.26
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM41Q8WV44 630 aa41.61■■■■■ 4.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.58■■■■■ 4.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
TRDMT1-211ENST00000495022 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
TRDMT1-211ENST00000495022 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
TRDMT1-211ENST00000495022 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.2■■■■■ 4.19
TRDMT1-211ENST00000495022 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.2■■■■■ 4.19
TRDMT1-211ENST00000495022 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.2■■■■■ 4.19
TRDMT1-211ENST00000495022 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
TRDMT1-211ENST00000495022 CHD1O14646 1710 aa41.14■■■■■ 4.18
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF11O15085 1522 aa41.06■■■■■ 4.16
TRDMT1-211ENST00000495022 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.05■■■■■ 4.16
TRDMT1-211ENST00000495022 SOGA1O94964 1423 aa41.04■■■■■ 4.16
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR97A6NE52 1622 aa41.02■■■■■ 4.16
TRDMT1-211ENST00000495022 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41■■■■■ 4.15
TRDMT1-211ENST00000495022 CUX1P39880 1505 aa40.99■■■■■ 4.15
TRDMT1-211ENST00000495022 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
TRDMT1-211ENST00000495022 FBLN2P98095 1184 aa40.84■■■■■ 4.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.8■■■■■ 4.12
TRDMT1-211ENST00000495022 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
TRDMT1-211ENST00000495022 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
TRDMT1-211ENST00000495022 GRIN2BQ13224 1484 aa40.72■■■■■ 4.11
TRDMT1-211ENST00000495022 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.65■■■■■ 4.1
TRDMT1-211ENST00000495022 PBRM1Q86U86 1689 aa40.65■■■■■ 4.1
TRDMT1-211ENST00000495022 ARAP1Q96P48 1450 aa40.64■■■■■ 4.1
TRDMT1-211ENST00000495022 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.63■■■■■ 4.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SYNJ1O43426 1573 aa40.62■■■■■ 4.09
TRDMT1-211ENST00000495022 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SYNJ2O15056 1496 aa40.59■■■■■ 4.09
TRDMT1-211ENST00000495022 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.57■■■■■ 4.09
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.57■■■■■ 4.09
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.54■■■■■ 4.08
TRDMT1-211ENST00000495022 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.42■■■■■ 4.06
TRDMT1-211ENST00000495022 TOP2BQ02880 1626 aa40.39■■■■■ 4.06
TRDMT1-211ENST00000495022 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.06
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAMTS12P58397 1594 aa40.22■■■■■ 4.03
TRDMT1-211ENST00000495022 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
TRDMT1-211ENST00000495022 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
TRDMT1-211ENST00000495022 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.09■■■■■ 4.01
TRDMT1-211ENST00000495022 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.06■■■■■ 4
TRDMT1-211ENST00000495022 NUP160Q12769 1436 aa40.06■■■■■ 4
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP170Q5SW79 1584 aa40.06■■■■■ 4
TRDMT1-211ENST00000495022 SHROOM2Q13796 1616 aa39.94■■■■□ 3.98
TRDMT1-211ENST00000495022 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.93■■■■□ 3.98
TRDMT1-211ENST00000495022 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.65■■■■□ 3.94
TRDMT1-211ENST00000495022 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
TRDMT1-211ENST00000495022 JPH4Q96JJ6 628 aa39.59■■■■□ 3.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CUL7Q14999 1698 aa39.56■■■■□ 3.92
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