RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494191.6

CROCC-211, Transcript of ciliary rootlet coiled-coil, rootletin, humanhuman

TSL 5

Gene CROCC, Length 1,996 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC-211ENST00000494191 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.52■■■■■ 5.36
CROCC-211ENST00000494191 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.1■■■■■ 4.33
CROCC-211ENST00000494191 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
CROCC-211ENST00000494191 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.26■■■■■ 4.04
CROCC-211ENST00000494191 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.02■■■■■ 4
CROCC-211ENST00000494191 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.98■■■■□ 3.99
CROCC-211ENST00000494191 ABCC9O60706 1549 aa39.8■■■■□ 3.96
CROCC-211ENST00000494191 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.38■■■■□ 3.89
CROCC-211ENST00000494191 NACADO15069 1562 aa39.17■■■■□ 3.86
CROCC-211ENST00000494191 SCRIBQ14160 1630 aa38.94■■■■□ 3.82
CROCC-211ENST00000494191 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.81■■■■□ 3.8
CROCC-211ENST00000494191 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
CROCC-211ENST00000494191 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.13■■■■□ 3.69
CROCC-211ENST00000494191 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.78■■■■□ 3.64
CROCC-211ENST00000494191 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
CROCC-211ENST00000494191 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.68■■■■□ 3.62
CROCC-211ENST00000494191 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.66■■■■□ 3.62
CROCC-211ENST00000494191 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.56■■■■□ 3.6
CROCC-211ENST00000494191 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
CROCC-211ENST00000494191 WIZO95785 1651 aa37.3■■■■□ 3.56
CROCC-211ENST00000494191 SMARCA4P51532 1647 aa37.25■■■■□ 3.55
CROCC-211ENST00000494191 CHIC1Q5VXU3 224 aa37■■■■□ 3.51
CROCC-211ENST00000494191 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
CROCC-211ENST00000494191 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.69■■■■□ 3.46
CROCC-211ENST00000494191 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.58■■■■□ 3.45
CROCC-211ENST00000494191 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
CROCC-211ENST00000494191 SMARCA2P51531 1590 aa36.52■■■■□ 3.44
CROCC-211ENST00000494191 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.51■■■■□ 3.44
CROCC-211ENST00000494191 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
CROCC-211ENST00000494191 TRIM41Q8WV44 630 aa36.2■■■■□ 3.39
CROCC-211ENST00000494191 NCAPD3P42695 1498 aa36.17■■■■□ 3.38
CROCC-211ENST00000494191 HMGXB3Q12766 1538 aa36.12■■■■□ 3.37
CROCC-211ENST00000494191 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.96■■■■□ 3.35
CROCC-211ENST00000494191 ABCC8Q09428 1581 aa35.9■■■■□ 3.34
CROCC-211ENST00000494191 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.71■■■■□ 3.31
CROCC-211ENST00000494191 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
CROCC-211ENST00000494191 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
CROCC-211ENST00000494191 CFTRP13569 1480 aa35.46■■■■□ 3.27
CROCC-211ENST00000494191 SYNJ1O43426 1573 aa35.42■■■■□ 3.26
CROCC-211ENST00000494191 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.31■■■■□ 3.24
CROCC-211ENST00000494191 PRDM2Q13029 1718 aa35.29■■■■□ 3.24
CROCC-211ENST00000494191 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.28■■■■□ 3.24
CROCC-211ENST00000494191 SOGA1O94964 1423 aa35.27■■■■□ 3.24
CROCC-211ENST00000494191 TOP2BQ02880 1626 aa35.19■■■■□ 3.22
CROCC-211ENST00000494191 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.15■■■■□ 3.22
CROCC-211ENST00000494191 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.14■■■■□ 3.22
CROCC-211ENST00000494191 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.13■■■■□ 3.21
CROCC-211ENST00000494191 CUX1P39880 1505 aa35.09■■■■□ 3.21
CROCC-211ENST00000494191 EEA1Q15075 1411 aa35.08■■■■□ 3.21
CROCC-211ENST00000494191 NESP48681 1621 aa35.03■■■■□ 3.2
CROCC-211ENST00000494191 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35■■■■□ 3.19
CROCC-211ENST00000494191 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.95■■■■□ 3.19
CROCC-211ENST00000494191 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.9■■■■□ 3.18
CROCC-211ENST00000494191 GOLGA3Q08378 1498 aa34.69■■■■□ 3.14
CROCC-211ENST00000494191 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.69■■■■□ 3.14
CROCC-211ENST00000494191 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.67■■■■□ 3.14
CROCC-211ENST00000494191 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
CROCC-211ENST00000494191 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.66■■■■□ 3.14
CROCC-211ENST00000494191 KIF21BO75037 1637 aa34.66■■■■□ 3.14
CROCC-211ENST00000494191 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.64■■■■□ 3.14
CROCC-211ENST00000494191 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.62■■■■□ 3.13
CROCC-211ENST00000494191 KIF27Q86VH2 1401 aa34.61■■■■□ 3.13
CROCC-211ENST00000494191 TOPBP1Q92547 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
CROCC-211ENST00000494191 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.57■■■■□ 3.12
CROCC-211ENST00000494191 CUX2O14529 1486 aa34.51■■■■□ 3.12
CROCC-211ENST00000494191 CEP162Q5TB80 1403 aa34.51■■■■□ 3.12
CROCC-211ENST00000494191 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
CROCC-211ENST00000494191 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.51■■■■□ 3.11
CROCC-211ENST00000494191 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
CROCC-211ENST00000494191 PRXQ9BXM0 1461 aa34.42■■■■□ 3.1
CROCC-211ENST00000494191 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.41■■■■□ 3.1
CROCC-211ENST00000494191 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.35■■■■□ 3.09
CROCC-211ENST00000494191 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.33■■■■□ 3.09
CROCC-211ENST00000494191 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.31■■■■□ 3.08
CROCC-211ENST00000494191 IGF1RP08069 1367 aa34.3■■■■□ 3.08
CROCC-211ENST00000494191 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.2■■■■□ 3.07
CROCC-211ENST00000494191 CLIP1P30622 1438 aa34.18■■■■□ 3.06
CROCC-211ENST00000494191 WDR97A6NE52 1622 aa34.18■■■■□ 3.06
CROCC-211ENST00000494191 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
CROCC-211ENST00000494191 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CROCC-211ENST00000494191 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.15■■■■□ 3.06
CROCC-211ENST00000494191 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CROCC-211ENST00000494191 ERCC6Q03468 1493 aa34.07■■■■□ 3.04
CROCC-211ENST00000494191 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
CROCC-211ENST00000494191 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CROCC-211ENST00000494191 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.02■■■■□ 3.04
CROCC-211ENST00000494191 WDR62O43379 1518 aa33.99■■■■□ 3.03
CROCC-211ENST00000494191 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.97■■■■□ 3.03
CROCC-211ENST00000494191 CUL7Q14999 1698 aa33.95■■■■□ 3.03
CROCC-211ENST00000494191 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.88■■■■□ 3.01
CROCC-211ENST00000494191 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
CROCC-211ENST00000494191 ARAP1Q96P48 1450 aa33.81■■■■□ 3
CROCC-211ENST00000494191 IFT140Q96RY7 1462 aa33.81■■■■□ 3
CROCC-211ENST00000494191 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.8■■■■□ 3
CROCC-211ENST00000494191 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
CROCC-211ENST00000494191 PBRM1Q86U86 1689 aa33.77■■■■□ 3
CROCC-211ENST00000494191 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.75■■■□□ 2.99
CROCC-211ENST00000494191 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
CROCC-211ENST00000494191 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.66■■■□□ 2.98
CROCC-211ENST00000494191 APLP2Q06481 763 aa33.64■■■□□ 2.98
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