RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493948.5

TSPAN32-215, Transcript of tetraspanin 32, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN32, Length 641 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSPAN32-215ENST00000493948 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.69■■■■□ 3.46
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TSPAN32-215ENST00000493948 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.95■■■■□ 3.18
TSPAN32-215ENST00000493948 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.64■■■■□ 3.14
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TSPAN32-215ENST00000493948 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.54■■■■□ 3.12
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TSPAN32-215ENST00000493948 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.43■■■■□ 3.1
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TSPAN32-215ENST00000493948 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.2■■■■□ 3.06
TSPAN32-215ENST00000493948 WDR62O43379 1518 aa34.11■■■■□ 3.05
TSPAN32-215ENST00000493948 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.05■■■■□ 3.04
TSPAN32-215ENST00000493948 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.03■■■■□ 3.04
TSPAN32-215ENST00000493948 CFTRP13569 1480 aa34.02■■■■□ 3.04
TSPAN32-215ENST00000493948 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
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TSPAN32-215ENST00000493948 PRDM2Q13029 1718 aa33.57■■■□□ 2.96
TSPAN32-215ENST00000493948 OSCARQ8IYS5 282 aa33.5■■■□□ 2.95
TSPAN32-215ENST00000493948 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
TSPAN32-215ENST00000493948 TOPBP1Q92547 1522 aa33.41■■■□□ 2.94
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TSPAN32-215ENST00000493948 CHD1O14646 1710 aa32.94■■■□□ 2.86
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TSPAN32-215ENST00000493948 WDR97A6NE52 1622 aa32.59■■■□□ 2.81
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TSPAN32-215ENST00000493948 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.99■■■□□ 2.71
TSPAN32-215ENST00000493948 SHROOM2Q13796 1616 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPAN32-215ENST00000493948 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
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TSPAN32-215ENST00000493948 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.7■■■□□ 2.67
TSPAN32-215ENST00000493948 IGF1RP08069 1367 aa31.7■■■□□ 2.67
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