RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493947.5

ZNF655-223, Transcript of zinc finger protein 655, human

TSL 4

Gene ZNF655, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF655-223	ENST00000493947	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ZNF655-223	ENST00000493947	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.71	■■■■□ 3.63
ZNF655-223	ENST00000493947	ABCC9	O60706	1549 aa		37.47	■■■■□ 3.59
ZNF655-223	ENST00000493947	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.76	■■■■□ 3.31
ZNF655-223	ENST00000493947	NACAD	O15069	1562 aa		35.54	■■■■□ 3.28
ZNF655-223	ENST00000493947	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.16	■■■■□ 3.22
ZNF655-223	ENST00000493947	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.11	■■■■□ 3.21
ZNF655-223	ENST00000493947	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.11	■■■■□ 3.21
ZNF655-223	ENST00000493947	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.11	■■■■□ 3.21
ZNF655-223	ENST00000493947	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.82	■■■■□ 3.16
ZNF655-223	ENST00000493947	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.82	■■■■□ 3.16
ZNF655-223	ENST00000493947	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.8	■■■■□ 3.16
ZNF655-223	ENST00000493947	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.69	■■■■□ 3.14
ZNF655-223	ENST00000493947	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.27	■■■■□ 3.08
ZNF655-223	ENST00000493947	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.27	■■■■□ 3.08
ZNF655-223	ENST00000493947	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.95	■■■■□ 3.03
ZNF655-223	ENST00000493947	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
ZNF655-223	ENST00000493947	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ZNF655-223	ENST00000493947	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ZNF655-223	ENST00000493947	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ZNF655-223	ENST00000493947	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ZNF655-223	ENST00000493947	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ZNF655-223	ENST00000493947	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ZNF655-223	ENST00000493947	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
ZNF655-223	ENST00000493947	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ZNF655-223	ENST00000493947	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
ZNF655-223	ENST00000493947	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ZNF655-223	ENST00000493947	CUX2	O14529	1486 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ZNF655-223	ENST00000493947	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ZNF655-223	ENST00000493947	NES	P48681	1621 aa		32.26	■■■□□ 2.76
ZNF655-223	ENST00000493947	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ZNF655-223	ENST00000493947	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ZNF655-223	ENST00000493947	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
ZNF655-223	ENST00000493947	WIZ	O95785	1651 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ZNF655-223	ENST00000493947	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ZNF655-223	ENST00000493947	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ZNF655-223	ENST00000493947	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ZNF655-223	ENST00000493947	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
ZNF655-223	ENST00000493947	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ZNF655-223	ENST00000493947	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
ZNF655-223	ENST00000493947	WDR62	O43379	1518 aa		31.54	■■■□□ 2.64
ZNF655-223	ENST00000493947	CFTR	P13569	1480 aa		31.45	■■■□□ 2.62
ZNF655-223	ENST00000493947	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ZNF655-223	ENST00000493947	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.4	■■■□□ 2.62
ZNF655-223	ENST00000493947	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ZNF655-223	ENST00000493947	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
ZNF655-223	ENST00000493947	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ZNF655-223	ENST00000493947	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.85	■■■□□ 2.53
ZNF655-223	ENST00000493947	IFT140	Q96RY7	1462 aa		30.79	■■■□□ 2.52
ZNF655-223	ENST00000493947	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.78	■■■□□ 2.52
ZNF655-223	ENST00000493947	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.77	■■■□□ 2.52
ZNF655-223	ENST00000493947	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.74	■■■□□ 2.51
ZNF655-223	ENST00000493947	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.71	■■■□□ 2.51
ZNF655-223	ENST00000493947	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.66	■■■□□ 2.5
ZNF655-223	ENST00000493947	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.65	■■■□□ 2.5
ZNF655-223	ENST00000493947	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.65	■■■□□ 2.5
ZNF655-223	ENST00000493947	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.54	■■■□□ 2.48
ZNF655-223	ENST00000493947	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.49	■■■□□ 2.47
ZNF655-223	ENST00000493947	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.49	■■■□□ 2.47
ZNF655-223	ENST00000493947	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.49	■■■□□ 2.47
ZNF655-223	ENST00000493947	CHD1	O14646	1710 aa		30.48	■■■□□ 2.47
ZNF655-223	ENST00000493947	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.46	■■■□□ 2.47	2e-8	■■■■■ 33.7
ZNF655-223	ENST00000493947	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.39	■■■□□ 2.46
ZNF655-223	ENST00000493947	CUX1	P39880	1505 aa		30.37	■■■□□ 2.45
ZNF655-223	ENST00000493947	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.35	■■■□□ 2.45
ZNF655-223	ENST00000493947	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.34	■■■□□ 2.45
ZNF655-223	ENST00000493947	SOGA1	O94964	1423 aa		30.32	■■■□□ 2.44
ZNF655-223	ENST00000493947	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.32	■■■□□ 2.44
ZNF655-223	ENST00000493947	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.25	■■■□□ 2.43
ZNF655-223	ENST00000493947	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.17	■■■□□ 2.42
ZNF655-223	ENST00000493947	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.13	■■■□□ 2.41
ZNF655-223	ENST00000493947	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.12	■■■□□ 2.41
ZNF655-223	ENST00000493947	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.11	■■■□□ 2.41
ZNF655-223	ENST00000493947	FBLN2	P98095	1184 aa		30.1	■■■□□ 2.41
ZNF655-223	ENST00000493947	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.09	■■■□□ 2.41
ZNF655-223	ENST00000493947	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.08	■■■□□ 2.41
ZNF655-223	ENST00000493947	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.07	■■■□□ 2.4
ZNF655-223	ENST00000493947	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.05	■■■□□ 2.4
ZNF655-223	ENST00000493947	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.02	■■■□□ 2.4
ZNF655-223	ENST00000493947	SYNJ1	O43426	1573 aa		30	■■■□□ 2.39
ZNF655-223	ENST00000493947	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.99	■■■□□ 2.39
ZNF655-223	ENST00000493947	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.99	■■■□□ 2.39
ZNF655-223	ENST00000493947	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.98	■■■□□ 2.39
ZNF655-223	ENST00000493947	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ZNF655-223	ENST00000493947	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.93	■■■□□ 2.38
ZNF655-223	ENST00000493947	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
ZNF655-223	ENST00000493947	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.83	■■■□□ 2.37
ZNF655-223	ENST00000493947	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.78	■■■□□ 2.36
ZNF655-223	ENST00000493947	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.73	■■■□□ 2.35
ZNF655-223	ENST00000493947	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ZNF655-223	ENST00000493947	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.66	■■■□□ 2.34
ZNF655-223	ENST00000493947	NUP160	Q12769	1436 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ZNF655-223	ENST00000493947	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.62	■■■□□ 2.33
ZNF655-223	ENST00000493947	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ZNF655-223	ENST00000493947	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ZNF655-223	ENST00000493947	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.56	■■■□□ 2.32
ZNF655-223	ENST00000493947	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.38	■■■□□ 2.29
ZNF655-223	ENST00000493947	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
ZNF655-223	ENST00000493947	CUL7	Q14999	1698 aa		29.28	■■■□□ 2.28
ZNF655-223	ENST00000493947	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.23	■■■□□ 2.27

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