RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493924.5

TSPAN32-214, Transcript of tetraspanin 32, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN32, Length 1,573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN32-214ENST00000493924 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.58■■■■■ 5.37
TSPAN32-214ENST00000493924 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.28■■■■■ 4.52
TSPAN32-214ENST00000493924 ABCC9O60706 1549 aa42.46■■■■■ 4.39
TSPAN32-214ENST00000493924 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.77■■■■■ 4.12
TSPAN32-214ENST00000493924 NACADO15069 1562 aa40.7■■■■■ 4.11
TSPAN32-214ENST00000493924 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.53■■■■■ 4.08
TSPAN32-214ENST00000493924 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
TSPAN32-214ENST00000493924 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.43■■■■■ 4.06
TSPAN32-214ENST00000493924 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.2■■■■■ 4.03
TSPAN32-214ENST00000493924 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.95■■■■□ 3.99
TSPAN32-214ENST00000493924 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.63■■■■□ 3.94
TSPAN32-214ENST00000493924 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.63■■■■□ 3.93
TSPAN32-214ENST00000493924 SCRIBQ14160 1630 aa39.46■■■■□ 3.91
TSPAN32-214ENST00000493924 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.16■■■■□ 3.86
TSPAN32-214ENST00000493924 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.12■■■■□ 3.85
TSPAN32-214ENST00000493924 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
TSPAN32-214ENST00000493924 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.43■■■■□ 3.74
TSPAN32-214ENST00000493924 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.16■■■■□ 3.7
TSPAN32-214ENST00000493924 SMARCA4P51532 1647 aa37.74■■■■□ 3.63
TSPAN32-214ENST00000493924 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
TSPAN32-214ENST00000493924 NCAPD3P42695 1498 aa37.56■■■■□ 3.6
TSPAN32-214ENST00000493924 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.56■■■■□ 3.6
TSPAN32-214ENST00000493924 SMARCA2P51531 1590 aa37.48■■■■□ 3.59
TSPAN32-214ENST00000493924 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.46■■■■□ 3.59
TSPAN32-214ENST00000493924 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.39■■■■□ 3.58
TSPAN32-214ENST00000493924 HMGXB3Q12766 1538 aa37.37■■■■□ 3.57
TSPAN32-214ENST00000493924 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
TSPAN32-214ENST00000493924 WIZO95785 1651 aa37.05■■■■□ 3.52
TSPAN32-214ENST00000493924 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
TSPAN32-214ENST00000493924 NESP48681 1621 aa36.73■■■■□ 3.47
TSPAN32-214ENST00000493924 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
TSPAN32-214ENST00000493924 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.6■■■■□ 3.45
TSPAN32-214ENST00000493924 ERCC6Q03468 1493 aa36.56■■■■□ 3.44
TSPAN32-214ENST00000493924 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.44■■■■□ 3.42
TSPAN32-214ENST00000493924 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.31■■■■□ 3.4
TSPAN32-214ENST00000493924 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.31■■■■□ 3.4
TSPAN32-214ENST00000493924 CUX2O14529 1486 aa36.28■■■■□ 3.4
TSPAN32-214ENST00000493924 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
TSPAN32-214ENST00000493924 CFTRP13569 1480 aa36.22■■■■□ 3.39
TSPAN32-214ENST00000493924 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.19■■■■□ 3.38
TSPAN32-214ENST00000493924 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.03■■■■□ 3.36
TSPAN32-214ENST00000493924 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.99■■■■□ 3.35
TSPAN32-214ENST00000493924 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.97■■■■□ 3.35
TSPAN32-214ENST00000493924 PRDM2Q13029 1718 aa35.97■■■■□ 3.35
TSPAN32-214ENST00000493924 WDR62O43379 1518 aa35.9■■■■□ 3.34
TSPAN32-214ENST00000493924 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
TSPAN32-214ENST00000493924 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
TSPAN32-214ENST00000493924 TOPBP1Q92547 1522 aa35.45■■■■□ 3.27
TSPAN32-214ENST00000493924 ABCC8Q09428 1581 aa35.39■■■■□ 3.26
TSPAN32-214ENST00000493924 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.39■■■■□ 3.26
TSPAN32-214ENST00000493924 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.34■■■■□ 3.25
TSPAN32-214ENST00000493924 IFT140Q96RY7 1462 aa35.24■■■■□ 3.23
TSPAN32-214ENST00000493924 CUX1P39880 1505 aa35.15■■■■□ 3.22
TSPAN32-214ENST00000493924 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
TSPAN32-214ENST00000493924 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
TSPAN32-214ENST00000493924 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
TSPAN32-214ENST00000493924 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.02■■■■□ 3.2
TSPAN32-214ENST00000493924 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
TSPAN32-214ENST00000493924 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.99■■■■□ 3.19
TSPAN32-214ENST00000493924 SOGA1O94964 1423 aa34.96■■■■□ 3.19
TSPAN32-214ENST00000493924 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.181e-7■■■■■ 38.9
TSPAN32-214ENST00000493924 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.81■■■■□ 3.16
TSPAN32-214ENST00000493924 WDR97A6NE52 1622 aa34.81■■■■□ 3.16
TSPAN32-214ENST00000493924 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.81■■■■□ 3.16
TSPAN32-214ENST00000493924 TOP2BQ02880 1626 aa34.79■■■■□ 3.16
TSPAN32-214ENST00000493924 SYNJ1O43426 1573 aa34.79■■■■□ 3.16
TSPAN32-214ENST00000493924 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
TSPAN32-214ENST00000493924 OSCARQ8IYS5 282 aa34.7■■■■□ 3.15
TSPAN32-214ENST00000493924 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.69■■■■□ 3.14
TSPAN32-214ENST00000493924 CHD1O14646 1710 aa34.6■■■■□ 3.13
TSPAN32-214ENST00000493924 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.59■■■■□ 3.13
TSPAN32-214ENST00000493924 GRIN2BQ13224 1484 aa34.58■■■■□ 3.13
TSPAN32-214ENST00000493924 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.57■■■■□ 3.12
TSPAN32-214ENST00000493924 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.57■■■■□ 3.12
TSPAN32-214ENST00000493924 PBRM1Q86U86 1689 aa34.55■■■■□ 3.12
TSPAN32-214ENST00000493924 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
TSPAN32-214ENST00000493924 FBLN2P98095 1184 aa34.42■■■■□ 3.1
TSPAN32-214ENST00000493924 SYNJ2O15056 1496 aa34.38■■■■□ 3.09
TSPAN32-214ENST00000493924 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.09
TSPAN32-214ENST00000493924 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.26■■■■□ 3.08
TSPAN32-214ENST00000493924 ADAMTS12P58397 1594 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPAN32-214ENST00000493924 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPAN32-214ENST00000493924 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPAN32-214ENST00000493924 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPAN32-214ENST00000493924 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.22■■■■□ 3.07
TSPAN32-214ENST00000493924 ARHGEF11O15085 1522 aa34.21■■■■□ 3.07
TSPAN32-214ENST00000493924 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPAN32-214ENST00000493924 GRIN2AQ12879 1464 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPAN32-214ENST00000493924 KIF27Q86VH2 1401 aa34.07■■■■□ 3.04
TSPAN32-214ENST00000493924 TRIM41Q8WV44 630 aa34.06■■■■□ 3.04
TSPAN32-214ENST00000493924 NUP160Q12769 1436 aa34.02■■■■□ 3.04
TSPAN32-214ENST00000493924 CEP170Q5SW79 1584 aa34.02■■■■□ 3.04
TSPAN32-214ENST00000493924 IGF1RP08069 1367 aa33.99■■■■□ 3.03
TSPAN32-214ENST00000493924 ARAP1Q96P48 1450 aa33.93■■■■□ 3.02
TSPAN32-214ENST00000493924 CUL7Q14999 1698 aa33.92■■■■□ 3.02
TSPAN32-214ENST00000493924 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.84■■■■□ 3.01
TSPAN32-214ENST00000493924 SHROOM2Q13796 1616 aa33.81■■■■□ 3
TSPAN32-214ENST00000493924 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.79■■■■□ 3
TSPAN32-214ENST00000493924 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.76■■■■□ 3
TSPAN32-214ENST00000493924 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms