RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493230.5

HRAS-211, Transcript of HRas proto-oncogene, GTPase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HRAS, Length 1,114 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRAS-211ENST00000493230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.15■■■■■ 4.82
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HRAS-211ENST00000493230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.95■■■■□ 3.67
HRAS-211ENST00000493230 NACADO15069 1562 aa37.89■■■■□ 3.66
HRAS-211ENST00000493230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.78■■■■□ 3.64
HRAS-211ENST00000493230 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.66■■■■□ 3.62
HRAS-211ENST00000493230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
HRAS-211ENST00000493230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.42■■■■□ 3.58
HRAS-211ENST00000493230 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.96■■■■□ 3.51
HRAS-211ENST00000493230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.82■■■■□ 3.48
HRAS-211ENST00000493230 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.71■■■■□ 3.47
HRAS-211ENST00000493230 SCRIBQ14160 1630 aa36.59■■■■□ 3.45
HRAS-211ENST00000493230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.49■■■■□ 3.43
HRAS-211ENST00000493230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.3■■■■□ 3.4
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HRAS-211ENST00000493230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.68■■■■□ 3.3
HRAS-211ENST00000493230 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.49■■■■□ 3.27
HRAS-211ENST00000493230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
HRAS-211ENST00000493230 SMARCA4P51532 1647 aa35.03■■■■□ 3.2
HRAS-211ENST00000493230 NCAPD3P42695 1498 aa34.97■■■■□ 3.19
HRAS-211ENST00000493230 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.91■■■■□ 3.18
HRAS-211ENST00000493230 SMARCA2P51531 1590 aa34.91■■■■□ 3.18
HRAS-211ENST00000493230 HMGXB3Q12766 1538 aa34.76■■■■□ 3.15
HRAS-211ENST00000493230 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.75■■■■□ 3.15
HRAS-211ENST00000493230 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.73■■■■□ 3.15
HRAS-211ENST00000493230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
HRAS-211ENST00000493230 WIZO95785 1651 aa34.34■■■■□ 3.09
HRAS-211ENST00000493230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
HRAS-211ENST00000493230 ERCC6Q03468 1493 aa34.07■■■■□ 3.04
HRAS-211ENST00000493230 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.05■■■■□ 3.04
HRAS-211ENST00000493230 NESP48681 1621 aa34.04■■■■□ 3.04
HRAS-211ENST00000493230 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
HRAS-211ENST00000493230 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.94■■■■□ 3.02
HRAS-211ENST00000493230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.87■■■■□ 3.01
HRAS-211ENST00000493230 CUX2O14529 1486 aa33.8■■■■□ 3
HRAS-211ENST00000493230 CFTRP13569 1480 aa33.69■■■□□ 2.98
HRAS-211ENST00000493230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.64■■■□□ 2.98
HRAS-211ENST00000493230 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.63■■■□□ 2.97
HRAS-211ENST00000493230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
HRAS-211ENST00000493230 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.5■■■□□ 2.95
HRAS-211ENST00000493230 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.49■■■□□ 2.95
HRAS-211ENST00000493230 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.47■■■□□ 2.95
HRAS-211ENST00000493230 PRDM2Q13029 1718 aa33.37■■■□□ 2.93
HRAS-211ENST00000493230 WDR62O43379 1518 aa33.35■■■□□ 2.93
HRAS-211ENST00000493230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
HRAS-211ENST00000493230 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
HRAS-211ENST00000493230 ABCC8Q09428 1581 aa33.04■■■□□ 2.88
HRAS-211ENST00000493230 TOPBP1Q92547 1522 aa32.94■■■□□ 2.86
HRAS-211ENST00000493230 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.94■■■□□ 2.86
HRAS-211ENST00000493230 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.9■■■□□ 2.86
HRAS-211ENST00000493230 IFT140Q96RY7 1462 aa32.82■■■□□ 2.84
HRAS-211ENST00000493230 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
HRAS-211ENST00000493230 CUX1P39880 1505 aa32.6■■■□□ 2.81
HRAS-211ENST00000493230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
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HRAS-211ENST00000493230 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.54■■■□□ 2.8
HRAS-211ENST00000493230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.47■■■□□ 2.79
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HRAS-211ENST00000493230 WDR97A6NE52 1622 aa32.42■■■□□ 2.78
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HRAS-211ENST00000493230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.4■■■□□ 2.78
HRAS-211ENST00000493230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
HRAS-211ENST00000493230 TOP2BQ02880 1626 aa32.33■■■□□ 2.77
HRAS-211ENST00000493230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.3■■■□□ 2.76
HRAS-211ENST00000493230 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.26■■■□□ 2.76
HRAS-211ENST00000493230 SYNJ1O43426 1573 aa32.24■■■□□ 2.75
HRAS-211ENST00000493230 GRIN2BQ13224 1484 aa32.2■■■□□ 2.75
HRAS-211ENST00000493230 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.16■■■□□ 2.74
HRAS-211ENST00000493230 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
HRAS-211ENST00000493230 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.1■■■□□ 2.73
HRAS-211ENST00000493230 FBLN2P98095 1184 aa32.1■■■□□ 2.73
HRAS-211ENST00000493230 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.09■■■□□ 2.73
HRAS-211ENST00000493230 CHD1O14646 1710 aa32.06■■■□□ 2.72
HRAS-211ENST00000493230 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
HRAS-211ENST00000493230 PBRM1Q86U86 1689 aa32.04■■■□□ 2.72
HRAS-211ENST00000493230 SYNJ2O15056 1496 aa32■■■□□ 2.71
HRAS-211ENST00000493230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.9■■■□□ 2.7
HRAS-211ENST00000493230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.81■■■□□ 2.68
HRAS-211ENST00000493230 ADAMTS12P58397 1594 aa31.79■■■□□ 2.68
HRAS-211ENST00000493230 ARHGEF11O15085 1522 aa31.78■■■□□ 2.68
HRAS-211ENST00000493230 KIF27Q86VH2 1401 aa31.77■■■□□ 2.68
HRAS-211ENST00000493230 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.77■■■□□ 2.68
HRAS-211ENST00000493230 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.77■■■□□ 2.68
HRAS-211ENST00000493230 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.77■■■□□ 2.68
HRAS-211ENST00000493230 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.75■■■□□ 2.67
HRAS-211ENST00000493230 GRIN2AQ12879 1464 aa31.75■■■□□ 2.67
HRAS-211ENST00000493230 TRIM41Q8WV44 630 aa31.71■■■□□ 2.67
HRAS-211ENST00000493230 IGF1RP08069 1367 aa31.63■■■□□ 2.65
HRAS-211ENST00000493230 NUP160Q12769 1436 aa31.63■■■□□ 2.65
HRAS-211ENST00000493230 CUL7Q14999 1698 aa31.56■■■□□ 2.64
HRAS-211ENST00000493230 CEP170Q5SW79 1584 aa31.55■■■□□ 2.64
HRAS-211ENST00000493230 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.52■■■□□ 2.64
HRAS-211ENST00000493230 ARAP1Q96P48 1450 aa31.49■■■□□ 2.63
HRAS-211ENST00000493230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.45■■■□□ 2.63
HRAS-211ENST00000493230 SHROOM2Q13796 1616 aa31.38■■■□□ 2.61
HRAS-211ENST00000493230 JPH4Q96JJ6 628 aa31.35■■■□□ 2.61
HRAS-211ENST00000493230 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.32■■■□□ 2.6
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