RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493191.1

HMG20B-214, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 3

Gene HMG20B, Length 852 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-214ENST00000493191 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.59■■■■■ 6.65
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HMG20B-214ENST00000493191 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.43■■■■■ 5.34
HMG20B-214ENST00000493191 NACADO15069 1562 aa48.06■■■■■ 5.28
HMG20B-214ENST00000493191 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.01■■■■■ 5.28
HMG20B-214ENST00000493191 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.98■■■■■ 5.27
HMG20B-214ENST00000493191 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.53■■■■■ 5.23e-8■■■□□ 16.7
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HMG20B-214ENST00000493191 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.31■■■■■ 5.16
HMG20B-214ENST00000493191 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.04■■■■■ 5.12
HMG20B-214ENST00000493191 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.85■■■■■ 5.09
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HMG20B-214ENST00000493191 SCRIBQ14160 1630 aa46.35■■■■■ 5.01
HMG20B-214ENST00000493191 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.31■■■■■ 5
HMG20B-214ENST00000493191 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.05■■■■■ 4.96
HMG20B-214ENST00000493191 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.94■■■■■ 4.95
HMG20B-214ENST00000493191 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
HMG20B-214ENST00000493191 NCAPD3P42695 1498 aa44.4■■■■■ 4.7
HMG20B-214ENST00000493191 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.27■■■■■ 4.68
HMG20B-214ENST00000493191 SMARCA4P51532 1647 aa44.17■■■■■ 4.66
HMG20B-214ENST00000493191 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.13■■■■■ 4.66
HMG20B-214ENST00000493191 SMARCA2P51531 1590 aa44.09■■■■■ 4.65
HMG20B-214ENST00000493191 ERCC6Q03468 1493 aa44.04■■■■■ 4.64
HMG20B-214ENST00000493191 HMGXB3Q12766 1538 aa44.02■■■■■ 4.64
HMG20B-214ENST00000493191 CUX2O14529 1486 aa43.95■■■■■ 4.63
HMG20B-214ENST00000493191 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
HMG20B-214ENST00000493191 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
HMG20B-214ENST00000493191 NESP48681 1621 aa43.79■■■■■ 4.6
HMG20B-214ENST00000493191 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.7■■■■■ 4.59
HMG20B-214ENST00000493191 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.63■■■■■ 4.58
HMG20B-214ENST00000493191 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.39■■■■■ 4.54
HMG20B-214ENST00000493191 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
HMG20B-214ENST00000493191 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.19■■■■■ 4.5
HMG20B-214ENST00000493191 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.18■■■■■ 4.5
HMG20B-214ENST00000493191 WIZO95785 1651 aa43.11■■■■■ 4.49
HMG20B-214ENST00000493191 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.06■■■■■ 4.48
HMG20B-214ENST00000493191 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.81■■■■■ 4.44
HMG20B-214ENST00000493191 WDR62O43379 1518 aa42.69■■■■■ 4.42
HMG20B-214ENST00000493191 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
HMG20B-214ENST00000493191 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.62■■■■■ 4.41
HMG20B-214ENST00000493191 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.58■■■■■ 4.41
HMG20B-214ENST00000493191 CFTRP13569 1480 aa42.53■■■■■ 4.4
HMG20B-214ENST00000493191 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
HMG20B-214ENST00000493191 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
HMG20B-214ENST00000493191 TRIM41Q8WV44 630 aa42.22■■■■■ 4.35
HMG20B-214ENST00000493191 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.09■■■■■ 4.33
HMG20B-214ENST00000493191 PRDM2Q13029 1718 aa42.06■■■■■ 4.32
HMG20B-214ENST00000493191 OSCARQ8IYS5 282 aa42■■■■■ 4.31
HMG20B-214ENST00000493191 IFT140Q96RY7 1462 aa41.77■■■■■ 4.28
HMG20B-214ENST00000493191 TOPBP1Q92547 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
HMG20B-214ENST00000493191 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
HMG20B-214ENST00000493191 ABCC8Q09428 1581 aa41.62■■■■■ 4.25
HMG20B-214ENST00000493191 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.56■■■■■ 4.24
HMG20B-214ENST00000493191 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
HMG20B-214ENST00000493191 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.42■■■■■ 4.22
HMG20B-214ENST00000493191 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.42■■■■■ 4.22
HMG20B-214ENST00000493191 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.42■■■■■ 4.22
HMG20B-214ENST00000493191 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.213e-7■■■■■ 34.4
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HMG20B-214ENST00000493191 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
HMG20B-214ENST00000493191 ARHGEF11O15085 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
HMG20B-214ENST00000493191 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.21■■■■■ 4.19
HMG20B-214ENST00000493191 CHD1O14646 1710 aa41.21■■■■■ 4.19
HMG20B-214ENST00000493191 FBLN2P98095 1184 aa41.19■■■■■ 4.18
HMG20B-214ENST00000493191 SOGA1O94964 1423 aa41.16■■■■■ 4.18
HMG20B-214ENST00000493191 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
HMG20B-214ENST00000493191 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.07■■■■■ 4.17
HMG20B-214ENST00000493191 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.05■■■■■ 4.16
HMG20B-214ENST00000493191 CUX1P39880 1505 aa41■■■■■ 4.15
HMG20B-214ENST00000493191 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.92■■■■■ 4.14
HMG20B-214ENST00000493191 WDR97A6NE52 1622 aa40.88■■■■■ 4.13
HMG20B-214ENST00000493191 ARAP1Q96P48 1450 aa40.87■■■■■ 4.13
HMG20B-214ENST00000493191 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
HMG20B-214ENST00000493191 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
HMG20B-214ENST00000493191 GRIN2BQ13224 1484 aa40.77■■■■■ 4.12
HMG20B-214ENST00000493191 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
HMG20B-214ENST00000493191 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.7■■■■■ 4.11
HMG20B-214ENST00000493191 SYNJ1O43426 1573 aa40.67■■■■■ 4.1
HMG20B-214ENST00000493191 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
HMG20B-214ENST00000493191 SYNJ2O15056 1496 aa40.65■■■■■ 4.1
HMG20B-214ENST00000493191 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.64■■■■■ 4.1
HMG20B-214ENST00000493191 PBRM1Q86U86 1689 aa40.6■■■■■ 4.09
HMG20B-214ENST00000493191 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.56■■■■■ 4.08
HMG20B-214ENST00000493191 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.49■■■■■ 4.07
HMG20B-214ENST00000493191 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.06
HMG20B-214ENST00000493191 TOP2BQ02880 1626 aa40.28■■■■■ 4.04
HMG20B-214ENST00000493191 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.27■■■■■ 4.04
HMG20B-214ENST00000493191 GRIN2AQ12879 1464 aa40.26■■■■■ 4.03
HMG20B-214ENST00000493191 ADAMTS12P58397 1594 aa40.2■■■■■ 4.03
HMG20B-214ENST00000493191 NUP160Q12769 1436 aa40.12■■■■■ 4.01
HMG20B-214ENST00000493191 CEP170Q5SW79 1584 aa40.12■■■■■ 4.01
HMG20B-214ENST00000493191 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.12■■■■■ 4.01
HMG20B-214ENST00000493191 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.1■■■■■ 4.01
HMG20B-214ENST00000493191 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.03■■■■■ 4
HMG20B-214ENST00000493191 SHROOM2Q13796 1616 aa39.93■■■■□ 3.98
HMG20B-214ENST00000493191 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
HMG20B-214ENST00000493191 JPH4Q96JJ6 628 aa39.78■■■■□ 3.96
HMG20B-214ENST00000493191 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.62■■■■□ 3.93
HMG20B-214ENST00000493191 IGF1RP08069 1367 aa39.56■■■■□ 3.92
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