RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492953.5

ABCB6-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 6 (Langereis blood group), humanhuman

TSL 4

Gene ABCB6, Length 570 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6-210ENST00000492953 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.86■■■■□ 3.97
ABCB6-210ENST00000492953 ABCC9O60706 1549 aa35.91■■■■□ 3.34
ABCB6-210ENST00000492953 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.79■■■■□ 3.32
ABCB6-210ENST00000492953 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.11■■■■□ 3.05
ABCB6-210ENST00000492953 NACADO15069 1562 aa33.86■■■■□ 3.01
ABCB6-210ENST00000492953 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.8■■■■□ 3
ABCB6-210ENST00000492953 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.66■■■□□ 2.98
ABCB6-210ENST00000492953 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.42■■■□□ 2.94
ABCB6-210ENST00000492953 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.39■■■□□ 2.94
ABCB6-210ENST00000492953 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.37■■■□□ 2.93
ABCB6-210ENST00000492953 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.17■■■□□ 2.9
ABCB6-210ENST00000492953 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
ABCB6-210ENST00000492953 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.91■■■□□ 2.86
ABCB6-210ENST00000492953 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.67■■■□□ 2.82
ABCB6-210ENST00000492953 SCRIBQ14160 1630 aa32.62■■■□□ 2.81
ABCB6-210ENST00000492953 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.44■■■□□ 2.78
ABCB6-210ENST00000492953 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.35■■■□□ 2.77
ABCB6-210ENST00000492953 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
ABCB6-210ENST00000492953 NCAPD3P42695 1498 aa31.27■■■□□ 2.6
ABCB6-210ENST00000492953 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.17■■■□□ 2.58
ABCB6-210ENST00000492953 SMARCA4P51532 1647 aa31.11■■■□□ 2.57
ABCB6-210ENST00000492953 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.08■■■□□ 2.57
ABCB6-210ENST00000492953 SMARCA2P51531 1590 aa31.05■■■□□ 2.56
ABCB6-210ENST00000492953 HMGXB3Q12766 1538 aa31.03■■■□□ 2.56
ABCB6-210ENST00000492953 ERCC6Q03468 1493 aa30.98■■■□□ 2.55
ABCB6-210ENST00000492953 CUX2O14529 1486 aa30.96■■■□□ 2.55
ABCB6-210ENST00000492953 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
ABCB6-210ENST00000492953 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
ABCB6-210ENST00000492953 NESP48681 1621 aa30.84■■■□□ 2.53
ABCB6-210ENST00000492953 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.81■■■□□ 2.52
ABCB6-210ENST00000492953 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.72■■■□□ 2.51
ABCB6-210ENST00000492953 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.58■■■□□ 2.49
ABCB6-210ENST00000492953 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
ABCB6-210ENST00000492953 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.42■■■□□ 2.46
ABCB6-210ENST00000492953 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.39■■■□□ 2.46
ABCB6-210ENST00000492953 WIZO95785 1651 aa30.35■■■□□ 2.45
ABCB6-210ENST00000492953 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.31■■■□□ 2.44
ABCB6-210ENST00000492953 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.15■■■□□ 2.42
ABCB6-210ENST00000492953 WDR62O43379 1518 aa30.08■■■□□ 2.41
ABCB6-210ENST00000492953 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
ABCB6-210ENST00000492953 CEP164Q9UPV0 1460 aa30■■■□□ 2.39
ABCB6-210ENST00000492953 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.98■■■□□ 2.39
ABCB6-210ENST00000492953 CFTRP13569 1480 aa29.95■■■□□ 2.39
ABCB6-210ENST00000492953 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
ABCB6-210ENST00000492953 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
ABCB6-210ENST00000492953 TRIM41Q8WV44 630 aa29.67■■■□□ 2.34
ABCB6-210ENST00000492953 PRDM2Q13029 1718 aa29.64■■■□□ 2.34
ABCB6-210ENST00000492953 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.61■■■□□ 2.33
ABCB6-210ENST00000492953 OSCARQ8IYS5 282 aa29.54■■■□□ 2.32
ABCB6-210ENST00000492953 IFT140Q96RY7 1462 aa29.41■■■□□ 2.3
ABCB6-210ENST00000492953 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
ABCB6-210ENST00000492953 TOPBP1Q92547 1522 aa29.4■■■□□ 2.3
ABCB6-210ENST00000492953 ABCC8Q09428 1581 aa29.3■■■□□ 2.28
ABCB6-210ENST00000492953 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.28■■■□□ 2.28
ABCB6-210ENST00000492953 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ABCB6-210ENST00000492953 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.19■■■□□ 2.26
ABCB6-210ENST00000492953 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.19■■■□□ 2.26
ABCB6-210ENST00000492953 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.19■■■□□ 2.26
ABCB6-210ENST00000492953 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ABCB6-210ENST00000492953 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.253e-7■■■□□ 17.4
ABCB6-210ENST00000492953 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
ABCB6-210ENST00000492953 ARHGEF11O15085 1522 aa29.09■■■□□ 2.25
ABCB6-210ENST00000492953 CHD1O14646 1710 aa29.03■■■□□ 2.24
ABCB6-210ENST00000492953 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29■■■□□ 2.23
ABCB6-210ENST00000492953 SOGA1O94964 1423 aa28.94■■■□□ 2.22
ABCB6-210ENST00000492953 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
ABCB6-210ENST00000492953 FBLN2P98095 1184 aa28.92■■■□□ 2.22
ABCB6-210ENST00000492953 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.9■■■□□ 2.22
ABCB6-210ENST00000492953 CUX1P39880 1505 aa28.87■■■□□ 2.21
ABCB6-210ENST00000492953 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.86■■■□□ 2.21
ABCB6-210ENST00000492953 WDR97A6NE52 1622 aa28.82■■■□□ 2.2
ABCB6-210ENST00000492953 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.81■■■□□ 2.2
ABCB6-210ENST00000492953 ARAP1Q96P48 1450 aa28.8■■■□□ 2.2
ABCB6-210ENST00000492953 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ABCB6-210ENST00000492953 GRIN2BQ13224 1484 aa28.71■■■□□ 2.19
ABCB6-210ENST00000492953 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.69■■■□□ 2.18
ABCB6-210ENST00000492953 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
ABCB6-210ENST00000492953 SYNJ1O43426 1573 aa28.64■■■□□ 2.18
ABCB6-210ENST00000492953 SYNJ2O15056 1496 aa28.63■■■□□ 2.17
ABCB6-210ENST00000492953 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ABCB6-210ENST00000492953 PBRM1Q86U86 1689 aa28.6■■■□□ 2.17
ABCB6-210ENST00000492953 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.59■■■□□ 2.17
ABCB6-210ENST00000492953 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ABCB6-210ENST00000492953 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.56■■■□□ 2.16
ABCB6-210ENST00000492953 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.53■■■□□ 2.16
ABCB6-210ENST00000492953 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
ABCB6-210ENST00000492953 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.37■■■□□ 2.13
ABCB6-210ENST00000492953 TOP2BQ02880 1626 aa28.36■■■□□ 2.13
ABCB6-210ENST00000492953 GRIN2AQ12879 1464 aa28.35■■■□□ 2.13
ABCB6-210ENST00000492953 ADAMTS12P58397 1594 aa28.33■■■□□ 2.12
ABCB6-210ENST00000492953 NUP160Q12769 1436 aa28.26■■■□□ 2.12
ABCB6-210ENST00000492953 CEP170Q5SW79 1584 aa28.26■■■□□ 2.11
ABCB6-210ENST00000492953 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.26■■■□□ 2.11
ABCB6-210ENST00000492953 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.23■■■□□ 2.11
ABCB6-210ENST00000492953 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.19■■■□□ 2.1
ABCB6-210ENST00000492953 SHROOM2Q13796 1616 aa28.15■■■□□ 2.1
ABCB6-210ENST00000492953 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
ABCB6-210ENST00000492953 JPH4Q96JJ6 628 aa27.96■■■□□ 2.07
ABCB6-210ENST00000492953 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.93■■■□□ 2.06
ABCB6-210ENST00000492953 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.83■■■□□ 2.05
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