RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491990.5

NUP188-209, Transcript of nucleoporin 188, humanhuman

TSL 5

Gene NUP188, Length 381 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188-209ENST00000491990 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.44■■■■■ 6.79
NUP188-209ENST00000491990 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.44■■■■■ 5.83
NUP188-209ENST00000491990 ABCC9O60706 1549 aa51.08■■■■■ 5.77
NUP188-209ENST00000491990 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.81■■■■■ 5.4
NUP188-209ENST00000491990 NACADO15069 1562 aa48.56■■■■■ 5.36
NUP188-209ENST00000491990 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.33■■■■■ 5.33
NUP188-209ENST00000491990 MYO15BQ96JP2 1530 aa48■■■■■ 5.27
NUP188-209ENST00000491990 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.68■■■■■ 5.22
NUP188-209ENST00000491990 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
NUP188-209ENST00000491990 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.59■■■■■ 5.21
NUP188-209ENST00000491990 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.59■■■■■ 5.21
NUP188-209ENST00000491990 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.5■■■■■ 5.19
NUP188-209ENST00000491990 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.33■■■■■ 5.17
NUP188-209ENST00000491990 SCRIBQ14160 1630 aa46.84■■■■■ 5.09
NUP188-209ENST00000491990 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.8■■■■■ 5.08
NUP188-209ENST00000491990 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.17■■■■■ 4.98
NUP188-209ENST00000491990 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
NUP188-209ENST00000491990 CECR2Q9BXF3 1484 aa46■■■■■ 4.95
NUP188-209ENST00000491990 NCAPD3P42695 1498 aa44.8■■■■■ 4.76
NUP188-209ENST00000491990 SMARCA4P51532 1647 aa44.74■■■■■ 4.75
NUP188-209ENST00000491990 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.7■■■■■ 4.75
NUP188-209ENST00000491990 SMARCA2P51531 1590 aa44.63■■■■■ 4.73
NUP188-209ENST00000491990 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.59■■■■■ 4.73
NUP188-209ENST00000491990 HMGXB3Q12766 1538 aa44.51■■■■■ 4.72
NUP188-209ENST00000491990 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.31■■■■■ 4.68
NUP188-209ENST00000491990 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
NUP188-209ENST00000491990 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.23■■■■■ 4.67
NUP188-209ENST00000491990 ERCC6Q03468 1493 aa44.12■■■■■ 4.65
NUP188-209ENST00000491990 NESP48681 1621 aa43.95■■■■■ 4.63
NUP188-209ENST00000491990 CUX2O14529 1486 aa43.95■■■■■ 4.63
NUP188-209ENST00000491990 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.76■■■■■ 4.6
NUP188-209ENST00000491990 WIZO95785 1651 aa43.73■■■■■ 4.59
NUP188-209ENST00000491990 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.54■■■■■ 4.56
NUP188-209ENST00000491990 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.51■■■■■ 4.56
NUP188-209ENST00000491990 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
NUP188-209ENST00000491990 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.46■■■■■ 4.55
NUP188-209ENST00000491990 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
NUP188-209ENST00000491990 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.43■■■■■ 4.54
NUP188-209ENST00000491990 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
NUP188-209ENST00000491990 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.09■■■■■ 4.49
NUP188-209ENST00000491990 CFTRP13569 1480 aa43.02■■■■■ 4.48
NUP188-209ENST00000491990 CEP164Q9UPV0 1460 aa43■■■■■ 4.47
NUP188-209ENST00000491990 WDR62O43379 1518 aa42.97■■■■■ 4.47
NUP188-209ENST00000491990 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.96■■■■■ 4.47
NUP188-209ENST00000491990 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.71■■■■■ 4.43
NUP188-209ENST00000491990 PRDM2Q13029 1718 aa42.66■■■■■ 4.42
NUP188-209ENST00000491990 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
NUP188-209ENST00000491990 TOPBP1Q92547 1522 aa42.18■■■■■ 4.34
NUP188-209ENST00000491990 ABCC8Q09428 1581 aa42.16■■■■■ 4.34
NUP188-209ENST00000491990 IFT140Q96RY7 1462 aa42.12■■■■■ 4.33
NUP188-209ENST00000491990 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.07■■■■■ 4.33
NUP188-209ENST00000491990 OSCARQ8IYS5 282 aa41.99■■■■■ 4.31
NUP188-209ENST00000491990 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
NUP188-209ENST00000491990 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
NUP188-209ENST00000491990 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
NUP188-209ENST00000491990 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
NUP188-209ENST00000491990 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
NUP188-209ENST00000491990 TRIM41Q8WV44 630 aa41.75■■■■■ 4.27
NUP188-209ENST00000491990 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.263e-7■■■■■ 34.8
NUP188-209ENST00000491990 SOGA1O94964 1423 aa41.59■■■■■ 4.25
NUP188-209ENST00000491990 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.59■■■■■ 4.25
NUP188-209ENST00000491990 CUX1P39880 1505 aa41.55■■■■■ 4.24
NUP188-209ENST00000491990 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.54■■■■■ 4.24
NUP188-209ENST00000491990 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
NUP188-209ENST00000491990 WDR97A6NE52 1622 aa41.44■■■■■ 4.22
NUP188-209ENST00000491990 CHD1O14646 1710 aa41.43■■■■■ 4.22
NUP188-209ENST00000491990 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.38■■■■■ 4.21
NUP188-209ENST00000491990 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.38■■■■■ 4.21
NUP188-209ENST00000491990 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.38■■■■■ 4.21
NUP188-209ENST00000491990 FBLN2P98095 1184 aa41.33■■■■■ 4.21
NUP188-209ENST00000491990 ARHGEF11O15085 1522 aa41.29■■■■■ 4.2
NUP188-209ENST00000491990 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.25■■■■■ 4.19
NUP188-209ENST00000491990 GRIN2BQ13224 1484 aa41.21■■■■■ 4.19
NUP188-209ENST00000491990 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
NUP188-209ENST00000491990 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.11■■■■■ 4.17
NUP188-209ENST00000491990 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.1■■■■■ 4.17
NUP188-209ENST00000491990 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
NUP188-209ENST00000491990 PBRM1Q86U86 1689 aa41.07■■■■■ 4.16
NUP188-209ENST00000491990 SYNJ2O15056 1496 aa41.03■■■■■ 4.16
NUP188-209ENST00000491990 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.16
NUP188-209ENST00000491990 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.01■■■■■ 4.16
NUP188-209ENST00000491990 TOP2BQ02880 1626 aa41■■■■■ 4.15
NUP188-209ENST00000491990 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41■■■■■ 4.15
NUP188-209ENST00000491990 SYNJ1O43426 1573 aa40.99■■■■■ 4.15
NUP188-209ENST00000491990 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.96■■■■■ 4.15
NUP188-209ENST00000491990 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.95■■■■■ 4.15
NUP188-209ENST00000491990 ARAP1Q96P48 1450 aa40.9■■■■■ 4.14
NUP188-209ENST00000491990 ADAMTS12P58397 1594 aa40.68■■■■■ 4.1
NUP188-209ENST00000491990 GRIN2AQ12879 1464 aa40.67■■■■■ 4.1
NUP188-209ENST00000491990 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.62■■■■■ 4.09
NUP188-209ENST00000491990 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.59■■■■■ 4.09
NUP188-209ENST00000491990 NUP160Q12769 1436 aa40.51■■■■■ 4.08
NUP188-209ENST00000491990 CEP170Q5SW79 1584 aa40.48■■■■■ 4.07
NUP188-209ENST00000491990 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
NUP188-209ENST00000491990 SHROOM2Q13796 1616 aa40.31■■■■■ 4.04
NUP188-209ENST00000491990 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.3■■■■■ 4.04
NUP188-209ENST00000491990 KIF27Q86VH2 1401 aa40.22■■■■■ 4.03
NUP188-209ENST00000491990 IGF1RP08069 1367 aa40.13■■■■■ 4.02
NUP188-209ENST00000491990 JPH4Q96JJ6 628 aa40.11■■■■■ 4.01
NUP188-209ENST00000491990 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms