RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491804.1

MFSD1-218, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene MFSD1, Length 312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-218ENST00000491804 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.08■■■■■ 5.29
MFSD1-218ENST00000491804 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.09■■■■■ 4.49
MFSD1-218ENST00000491804 ABCC9O60706 1549 aa43.07■■■■■ 4.49
MFSD1-218ENST00000491804 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.02■■■■■ 4.16
MFSD1-218ENST00000491804 NACADO15069 1562 aa40.75■■■■■ 4.11
MFSD1-218ENST00000491804 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.6■■■■■ 4.09
MFSD1-218ENST00000491804 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.42■■■■■ 4.06
MFSD1-218ENST00000491804 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.22■■■■■ 4.03
MFSD1-218ENST00000491804 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.02
MFSD1-218ENST00000491804 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.07■■■■■ 4
MFSD1-218ENST00000491804 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
MFSD1-218ENST00000491804 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.82■■■■□ 3.97
MFSD1-218ENST00000491804 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.72■■■■□ 3.95
MFSD1-218ENST00000491804 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.3■■■■□ 3.88
MFSD1-218ENST00000491804 SCRIBQ14160 1630 aa39.25■■■■□ 3.87
MFSD1-218ENST00000491804 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.9■■■■□ 3.82
MFSD1-218ENST00000491804 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
MFSD1-218ENST00000491804 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.8■■■■□ 3.8
MFSD1-218ENST00000491804 NCAPD3P42695 1498 aa37.64■■■■□ 3.62
MFSD1-218ENST00000491804 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.52■■■■□ 3.6
MFSD1-218ENST00000491804 SMARCA4P51532 1647 aa37.47■■■■□ 3.59
MFSD1-218ENST00000491804 SMARCA2P51531 1590 aa37.41■■■■□ 3.58
MFSD1-218ENST00000491804 HMGXB3Q12766 1538 aa37.33■■■■□ 3.57
MFSD1-218ENST00000491804 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
MFSD1-218ENST00000491804 ERCC6Q03468 1493 aa37.18■■■■□ 3.54
MFSD1-218ENST00000491804 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
MFSD1-218ENST00000491804 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.12■■■■□ 3.53
MFSD1-218ENST00000491804 CUX2O14529 1486 aa37.1■■■■□ 3.53
MFSD1-218ENST00000491804 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.09■■■■□ 3.53
MFSD1-218ENST00000491804 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.04■■■■□ 3.52
MFSD1-218ENST00000491804 NESP48681 1621 aa37.02■■■■□ 3.52
MFSD1-218ENST00000491804 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.77■■■■□ 3.48
MFSD1-218ENST00000491804 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
MFSD1-218ENST00000491804 WIZO95785 1651 aa36.59■■■■□ 3.45
MFSD1-218ENST00000491804 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.57■■■■□ 3.44
MFSD1-218ENST00000491804 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.51■■■■□ 3.44
MFSD1-218ENST00000491804 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.51■■■■□ 3.43
MFSD1-218ENST00000491804 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
MFSD1-218ENST00000491804 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.23■■■■□ 3.39
MFSD1-218ENST00000491804 WDR62O43379 1518 aa36.13■■■■□ 3.38
MFSD1-218ENST00000491804 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
MFSD1-218ENST00000491804 CFTRP13569 1480 aa36.09■■■■□ 3.37
MFSD1-218ENST00000491804 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.09■■■■□ 3.37
MFSD1-218ENST00000491804 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.07■■■■□ 3.37
MFSD1-218ENST00000491804 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
MFSD1-218ENST00000491804 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.74■■■■□ 3.31
MFSD1-218ENST00000491804 PRDM2Q13029 1718 aa35.68■■■■□ 3.3
MFSD1-218ENST00000491804 OSCARQ8IYS5 282 aa35.48■■■■□ 3.27
MFSD1-218ENST00000491804 TRIM41Q8WV44 630 aa35.44■■■■□ 3.26
MFSD1-218ENST00000491804 TOPBP1Q92547 1522 aa35.39■■■■□ 3.26
MFSD1-218ENST00000491804 IFT140Q96RY7 1462 aa35.39■■■■□ 3.26
MFSD1-218ENST00000491804 ABCC8Q09428 1581 aa35.34■■■■□ 3.25
MFSD1-218ENST00000491804 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
MFSD1-218ENST00000491804 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.25■■■■□ 3.23
MFSD1-218ENST00000491804 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
MFSD1-218ENST00000491804 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
MFSD1-218ENST00000491804 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
MFSD1-218ENST00000491804 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.02■■■■□ 3.2
MFSD1-218ENST00000491804 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.95■■■■□ 3.18
MFSD1-218ENST00000491804 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.95■■■■□ 3.18
MFSD1-218ENST00000491804 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.95■■■■□ 3.18
MFSD1-218ENST00000491804 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.9■■■■□ 3.18
MFSD1-218ENST00000491804 SOGA1O94964 1423 aa34.9■■■■□ 3.18
MFSD1-218ENST00000491804 ARHGEF11O15085 1522 aa34.85■■■■□ 3.17
MFSD1-218ENST00000491804 CHD1O14646 1710 aa34.84■■■■□ 3.17
MFSD1-218ENST00000491804 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
MFSD1-218ENST00000491804 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.82■■■■□ 3.16
MFSD1-218ENST00000491804 FBLN2P98095 1184 aa34.8■■■■□ 3.16
MFSD1-218ENST00000491804 CUX1P39880 1505 aa34.79■■■■□ 3.16
MFSD1-218ENST00000491804 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
MFSD1-218ENST00000491804 WDR97A6NE52 1622 aa34.7■■■■□ 3.15
MFSD1-218ENST00000491804 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.64■■■■□ 3.14
MFSD1-218ENST00000491804 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.63■■■■□ 3.13
MFSD1-218ENST00000491804 GRIN2BQ13224 1484 aa34.58■■■■□ 3.13
MFSD1-218ENST00000491804 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
MFSD1-218ENST00000491804 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
MFSD1-218ENST00000491804 ARAP1Q96P48 1450 aa34.5■■■■□ 3.11
MFSD1-218ENST00000491804 SYNJ2O15056 1496 aa34.46■■■■□ 3.11
MFSD1-218ENST00000491804 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.46■■■■□ 3.11
MFSD1-218ENST00000491804 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.45■■■■□ 3.1
MFSD1-218ENST00000491804 SYNJ1O43426 1573 aa34.44■■■■□ 3.1
MFSD1-218ENST00000491804 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.43■■■■□ 3.1
MFSD1-218ENST00000491804 PBRM1Q86U86 1689 aa34.4■■■■□ 3.1
MFSD1-218ENST00000491804 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.35■■■■□ 3.09
MFSD1-218ENST00000491804 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.31■■■■□ 3.08
MFSD1-218ENST00000491804 TOP2BQ02880 1626 aa34.25■■■■□ 3.07
MFSD1-218ENST00000491804 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.24■■■■□ 3.07
MFSD1-218ENST00000491804 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
MFSD1-218ENST00000491804 GRIN2AQ12879 1464 aa34.12■■■■□ 3.05
MFSD1-218ENST00000491804 ADAMTS12P58397 1594 aa34.08■■■■□ 3.05
MFSD1-218ENST00000491804 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.03■■■■□ 3.04
MFSD1-218ENST00000491804 NUP160Q12769 1436 aa34.01■■■■□ 3.03
MFSD1-218ENST00000491804 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.99■■■■□ 3.03
MFSD1-218ENST00000491804 CEP170Q5SW79 1584 aa33.98■■■■□ 3.03
MFSD1-218ENST00000491804 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.92■■■■□ 3.02
MFSD1-218ENST00000491804 SHROOM2Q13796 1616 aa33.85■■■■□ 3.01
MFSD1-218ENST00000491804 JPH4Q96JJ6 628 aa33.71■■■□□ 2.99
MFSD1-218ENST00000491804 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.98
MFSD1-218ENST00000491804 IGF1RP08069 1367 aa33.61■■■□□ 2.97
MFSD1-218ENST00000491804 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.6■■■□□ 2.97
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