RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491270.1

COMTD1-206, Transcript of catechol-O-methyltransferase domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene COMTD1, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTD1-206ENST00000491270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.25■■■■■ 6.92
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COMTD1-206ENST00000491270 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.06■■■■■ 5.44
COMTD1-206ENST00000491270 NACADO15069 1562 aa48.91■■■■■ 5.42
COMTD1-206ENST00000491270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.81■■■■■ 5.4
COMTD1-206ENST00000491270 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.5■■■■■ 5.35
COMTD1-206ENST00000491270 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.45■■■■■ 5.35
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COMTD1-206ENST00000491270 SCRIBQ14160 1630 aa47.38■■■■■ 5.17
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COMTD1-206ENST00000491270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.25■■■■■ 4.99
COMTD1-206ENST00000491270 CECR2Q9BXF3 1484 aa46■■■■■ 4.95
COMTD1-206ENST00000491270 SMARCA4P51532 1647 aa45.27■■■■■ 4.84
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COMTD1-206ENST00000491270 NCAPD3P42695 1498 aa45.14■■■■■ 4.82
COMTD1-206ENST00000491270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.11■■■■■ 4.81
COMTD1-206ENST00000491270 SMARCA2P51531 1590 aa45.05■■■■■ 4.8
COMTD1-206ENST00000491270 HMGXB3Q12766 1538 aa44.89■■■■■ 4.78
COMTD1-206ENST00000491270 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.89■■■■■ 4.78
COMTD1-206ENST00000491270 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.83■■■■■ 4.77
COMTD1-206ENST00000491270 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
COMTD1-206ENST00000491270 WIZO95785 1651 aa44.39■■■■■ 4.7
COMTD1-206ENST00000491270 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
COMTD1-206ENST00000491270 NESP48681 1621 aa44.17■■■■■ 4.66
COMTD1-206ENST00000491270 ERCC6Q03468 1493 aa44.13■■■■■ 4.65
COMTD1-206ENST00000491270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.01■■■■■ 4.64
COMTD1-206ENST00000491270 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
COMTD1-206ENST00000491270 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.8■■■■■ 4.6
COMTD1-206ENST00000491270 CUX2O14529 1486 aa43.77■■■■■ 4.6
COMTD1-206ENST00000491270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.73■■■■■ 4.59
COMTD1-206ENST00000491270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.63■■■■■ 4.58
COMTD1-206ENST00000491270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
COMTD1-206ENST00000491270 CFTRP13569 1480 aa43.47■■■■■ 4.55
COMTD1-206ENST00000491270 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.38■■■■■ 4.54
COMTD1-206ENST00000491270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.32■■■■■ 4.52
COMTD1-206ENST00000491270 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.3■■■■■ 4.52
COMTD1-206ENST00000491270 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.29■■■■■ 4.52
COMTD1-206ENST00000491270 WDR62O43379 1518 aa43.16■■■■■ 4.5
COMTD1-206ENST00000491270 PRDM2Q13029 1718 aa43.11■■■■■ 4.49
COMTD1-206ENST00000491270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
COMTD1-206ENST00000491270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
COMTD1-206ENST00000491270 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.83■■■■■ 4.45
COMTD1-206ENST00000491270 TOPBP1Q92547 1522 aa42.58■■■■■ 4.41
COMTD1-206ENST00000491270 ABCC8Q09428 1581 aa42.55■■■■■ 4.4
COMTD1-206ENST00000491270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.5■■■■■ 4.39
COMTD1-206ENST00000491270 IFT140Q96RY7 1462 aa42.39■■■■■ 4.38
COMTD1-206ENST00000491270 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
COMTD1-206ENST00000491270 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
COMTD1-206ENST00000491270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
COMTD1-206ENST00000491270 CUX1P39880 1505 aa42.14■■■■■ 4.34
COMTD1-206ENST00000491270 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
COMTD1-206ENST00000491270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
COMTD1-206ENST00000491270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.02■■■■■ 4.32
COMTD1-206ENST00000491270 SOGA1O94964 1423 aa42.02■■■■■ 4.32
COMTD1-206ENST00000491270 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.96■■■■■ 4.314e-8■■■■□ 21.1
COMTD1-206ENST00000491270 OSCARQ8IYS5 282 aa41.9■■■■■ 4.3
COMTD1-206ENST00000491270 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
COMTD1-206ENST00000491270 WDR97A6NE52 1622 aa41.78■■■■■ 4.28
COMTD1-206ENST00000491270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.74■■■■■ 4.27
COMTD1-206ENST00000491270 TOP2BQ02880 1626 aa41.68■■■■■ 4.26
COMTD1-206ENST00000491270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.67■■■■■ 4.26
COMTD1-206ENST00000491270 SYNJ1O43426 1573 aa41.66■■■■■ 4.26
COMTD1-206ENST00000491270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.62■■■■■ 4.25
COMTD1-206ENST00000491270 CHD1O14646 1710 aa41.59■■■■■ 4.25
COMTD1-206ENST00000491270 GRIN2BQ13224 1484 aa41.57■■■■■ 4.25
COMTD1-206ENST00000491270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.56■■■■■ 4.24
COMTD1-206ENST00000491270 FBLN2P98095 1184 aa41.53■■■■■ 4.24
COMTD1-206ENST00000491270 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.53■■■■■ 4.24
COMTD1-206ENST00000491270 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
COMTD1-206ENST00000491270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.48■■■■■ 4.23
COMTD1-206ENST00000491270 PBRM1Q86U86 1689 aa41.45■■■■■ 4.23
COMTD1-206ENST00000491270 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
COMTD1-206ENST00000491270 SYNJ2O15056 1496 aa41.34■■■■■ 4.21
COMTD1-206ENST00000491270 TRIM41Q8WV44 630 aa41.29■■■■■ 4.2
COMTD1-206ENST00000491270 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
COMTD1-206ENST00000491270 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
COMTD1-206ENST00000491270 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.27■■■■■ 4.2
COMTD1-206ENST00000491270 ARHGEF11O15085 1522 aa41.23■■■■■ 4.19
COMTD1-206ENST00000491270 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.13■■■■■ 4.18
COMTD1-206ENST00000491270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.12■■■■■ 4.17
COMTD1-206ENST00000491270 ADAMTS12P58397 1594 aa41.12■■■■■ 4.17
COMTD1-206ENST00000491270 GRIN2AQ12879 1464 aa41.03■■■■■ 4.16
COMTD1-206ENST00000491270 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
COMTD1-206ENST00000491270 KIF27Q86VH2 1401 aa40.89■■■■■ 4.14
COMTD1-206ENST00000491270 ARAP1Q96P48 1450 aa40.88■■■■■ 4.13
COMTD1-206ENST00000491270 NUP160Q12769 1436 aa40.86■■■■■ 4.13
COMTD1-206ENST00000491270 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.86■■■■■ 4.13
COMTD1-206ENST00000491270 CEP170Q5SW79 1584 aa40.85■■■■■ 4.13
COMTD1-206ENST00000491270 IGF1RP08069 1367 aa40.76■■■■■ 4.12
COMTD1-206ENST00000491270 CUL7Q14999 1698 aa40.68■■■■■ 4.1
COMTD1-206ENST00000491270 SHROOM2Q13796 1616 aa40.6■■■■■ 4.09
COMTD1-206ENST00000491270 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.55■■■■■ 4.08
COMTD1-206ENST00000491270 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.52■■■■■ 4.08
COMTD1-206ENST00000491270 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.52■■■■■ 4.08
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