RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490974.1

UBE2H-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 H, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2H, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2H-208ENST00000490974 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.67■■■■■ 6.5
UBE2H-208ENST00000490974 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.56■■■■■ 5.52
UBE2H-208ENST00000490974 ABCC9O60706 1549 aa48.95■■■■■ 5.43
UBE2H-208ENST00000490974 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.88■■■■■ 5.1
UBE2H-208ENST00000490974 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.8■■■■■ 5.08
UBE2H-208ENST00000490974 NACADO15069 1562 aa46.62■■■■■ 5.05
UBE2H-208ENST00000490974 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
UBE2H-208ENST00000490974 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.12■■■■■ 4.97
UBE2H-208ENST00000490974 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.91■■■■■ 4.94
UBE2H-208ENST00000490974 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.88■■■■■ 4.94
UBE2H-208ENST00000490974 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.75■■■■■ 4.91
UBE2H-208ENST00000490974 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.45■■■■■ 4.87
UBE2H-208ENST00000490974 SCRIBQ14160 1630 aa45.42■■■■■ 4.86
UBE2H-208ENST00000490974 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.16■■■■■ 4.82
UBE2H-208ENST00000490974 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.68■■■■■ 4.74
UBE2H-208ENST00000490974 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
UBE2H-208ENST00000490974 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.2■■■■■ 4.67
UBE2H-208ENST00000490974 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.91■■■■■ 4.62
UBE2H-208ENST00000490974 SMARCA4P51532 1647 aa43.3■■■■■ 4.52
UBE2H-208ENST00000490974 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
UBE2H-208ENST00000490974 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.08■■■■■ 4.49
UBE2H-208ENST00000490974 NCAPD3P42695 1498 aa43■■■■■ 4.47
UBE2H-208ENST00000490974 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.99■■■■■ 4.47
UBE2H-208ENST00000490974 SMARCA2P51531 1590 aa42.97■■■■■ 4.47
UBE2H-208ENST00000490974 HMGXB3Q12766 1538 aa42.79■■■■■ 4.44
UBE2H-208ENST00000490974 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
UBE2H-208ENST00000490974 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.73■■■■■ 4.43
UBE2H-208ENST00000490974 WIZO95785 1651 aa42.59■■■■■ 4.41
UBE2H-208ENST00000490974 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
UBE2H-208ENST00000490974 NESP48681 1621 aa42.3■■■■■ 4.36
UBE2H-208ENST00000490974 ERCC6Q03468 1493 aa42.16■■■■■ 4.34
UBE2H-208ENST00000490974 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
UBE2H-208ENST00000490974 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.96■■■■■ 4.31
UBE2H-208ENST00000490974 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.8■■■■■ 4.28
UBE2H-208ENST00000490974 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.79■■■■■ 4.28
UBE2H-208ENST00000490974 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.68■■■■■ 4.26
UBE2H-208ENST00000490974 CUX2O14529 1486 aa41.64■■■■■ 4.26
UBE2H-208ENST00000490974 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
UBE2H-208ENST00000490974 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.53■■■■■ 4.24
UBE2H-208ENST00000490974 CFTRP13569 1480 aa41.48■■■■■ 4.23
UBE2H-208ENST00000490974 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.39■■■■■ 4.22
UBE2H-208ENST00000490974 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.34■■■■■ 4.21
UBE2H-208ENST00000490974 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.33■■■■■ 4.21
UBE2H-208ENST00000490974 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
UBE2H-208ENST00000490974 PRDM2Q13029 1718 aa41.24■■■■■ 4.19
UBE2H-208ENST00000490974 WDR62O43379 1518 aa41.17■■■■■ 4.18
UBE2H-208ENST00000490974 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
UBE2H-208ENST00000490974 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.72■■■■■ 4.11
UBE2H-208ENST00000490974 TOPBP1Q92547 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
UBE2H-208ENST00000490974 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.61■■■■■ 4.09
UBE2H-208ENST00000490974 ABCC8Q09428 1581 aa40.52■■■■■ 4.08
UBE2H-208ENST00000490974 IFT140Q96RY7 1462 aa40.44■■■■■ 4.06
UBE2H-208ENST00000490974 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
UBE2H-208ENST00000490974 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
UBE2H-208ENST00000490974 CUX1P39880 1505 aa40.33■■■■■ 4.05
UBE2H-208ENST00000490974 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
UBE2H-208ENST00000490974 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.26■■■■■ 4.04
UBE2H-208ENST00000490974 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.24■■■■■ 4.03
UBE2H-208ENST00000490974 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
UBE2H-208ENST00000490974 SOGA1O94964 1423 aa40.16■■■■■ 4.02
UBE2H-208ENST00000490974 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.15■■■■■ 4.022e-7■■■□□ 15.2
UBE2H-208ENST00000490974 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
UBE2H-208ENST00000490974 SYNJ1O43426 1573 aa39.94■■■■□ 3.98
UBE2H-208ENST00000490974 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.98
UBE2H-208ENST00000490974 OSCARQ8IYS5 282 aa39.94■■■■□ 3.98
UBE2H-208ENST00000490974 WDR97A6NE52 1622 aa39.9■■■■□ 3.98
UBE2H-208ENST00000490974 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.87■■■■□ 3.97
UBE2H-208ENST00000490974 TOP2BQ02880 1626 aa39.87■■■■□ 3.97
UBE2H-208ENST00000490974 CHD1O14646 1710 aa39.83■■■■□ 3.97
UBE2H-208ENST00000490974 FBLN2P98095 1184 aa39.81■■■■□ 3.96
UBE2H-208ENST00000490974 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.76■■■■□ 3.96
UBE2H-208ENST00000490974 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.74■■■■□ 3.95
UBE2H-208ENST00000490974 PBRM1Q86U86 1689 aa39.71■■■■□ 3.95
UBE2H-208ENST00000490974 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.69■■■■□ 3.94
UBE2H-208ENST00000490974 GRIN2BQ13224 1484 aa39.68■■■■□ 3.94
UBE2H-208ENST00000490974 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.66■■■■□ 3.94
UBE2H-208ENST00000490974 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
UBE2H-208ENST00000490974 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
UBE2H-208ENST00000490974 TRIM41Q8WV44 630 aa39.52■■■■□ 3.92
UBE2H-208ENST00000490974 SYNJ2O15056 1496 aa39.45■■■■□ 3.91
UBE2H-208ENST00000490974 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
UBE2H-208ENST00000490974 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
UBE2H-208ENST00000490974 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
UBE2H-208ENST00000490974 ARHGEF11O15085 1522 aa39.35■■■■□ 3.89
UBE2H-208ENST00000490974 ADAMTS12P58397 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
UBE2H-208ENST00000490974 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.26■■■■□ 3.88
UBE2H-208ENST00000490974 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.24■■■■□ 3.87
UBE2H-208ENST00000490974 GRIN2AQ12879 1464 aa39.2■■■■□ 3.87
UBE2H-208ENST00000490974 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.17■■■■□ 3.86
UBE2H-208ENST00000490974 CEP170Q5SW79 1584 aa39.08■■■■□ 3.85
UBE2H-208ENST00000490974 KIF27Q86VH2 1401 aa39.08■■■■□ 3.85
UBE2H-208ENST00000490974 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.07■■■■□ 3.85
UBE2H-208ENST00000490974 ARAP1Q96P48 1450 aa39.04■■■■□ 3.84
UBE2H-208ENST00000490974 NUP160Q12769 1436 aa38.98■■■■□ 3.83
UBE2H-208ENST00000490974 IGF1RP08069 1367 aa38.97■■■■□ 3.83
UBE2H-208ENST00000490974 CUL7Q14999 1698 aa38.88■■■■□ 3.81
UBE2H-208ENST00000490974 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.86■■■■□ 3.81
UBE2H-208ENST00000490974 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.85■■■■□ 3.81
UBE2H-208ENST00000490974 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.76■■■■□ 3.8
UBE2H-208ENST00000490974 SHROOM2Q13796 1616 aa38.74■■■■□ 3.79
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