RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.83■■■■■ 4.45
TOP3B-217ENST00000489581 ABCC9O60706 1549 aa38.81■■■■□ 3.8
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.5■■■■□ 3.75
TOP3B-217ENST00000489581 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.78■■■■□ 3.48
TOP3B-217ENST00000489581 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.64■■■■□ 3.46
TOP3B-217ENST00000489581 NACADO15069 1562 aa36.47■■■■□ 3.43
TOP3B-217ENST00000489581 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.38■■■■□ 3.41
TOP3B-217ENST00000489581 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.14■■■■□ 3.38
TOP3B-217ENST00000489581 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.03■■■■□ 3.36
TOP3B-217ENST00000489581 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.84■■■■□ 3.33
TOP3B-217ENST00000489581 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.74■■■■□ 3.31
TOP3B-217ENST00000489581 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
TOP3B-217ENST00000489581 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.32■■■■□ 3.24
TOP3B-217ENST00000489581 SCRIBQ14160 1630 aa35.14■■■■□ 3.22
TOP3B-217ENST00000489581 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.14■■■■□ 3.22
TOP3B-217ENST00000489581 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.03■■■■□ 3.2
TOP3B-217ENST00000489581 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.96■■■■□ 3.19
TOP3B-217ENST00000489581 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
TOP3B-217ENST00000489581 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.77■■■■□ 3
TOP3B-217ENST00000489581 NCAPD3P42695 1498 aa33.68■■■□□ 2.98
TOP3B-217ENST00000489581 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.56■■■□□ 2.96
TOP3B-217ENST00000489581 ERCC6Q03468 1493 aa33.51■■■□□ 2.96
TOP3B-217ENST00000489581 CUX2O14529 1486 aa33.48■■■□□ 2.95
TOP3B-217ENST00000489581 SMARCA4P51532 1647 aa33.47■■■□□ 2.95
TOP3B-217ENST00000489581 SMARCA2P51531 1590 aa33.43■■■□□ 2.94
TOP3B-217ENST00000489581 HMGXB3Q12766 1538 aa33.38■■■□□ 2.93
TOP3B-217ENST00000489581 NESP48681 1621 aa33.28■■■□□ 2.92
TOP3B-217ENST00000489581 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
TOP3B-217ENST00000489581 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
TOP3B-217ENST00000489581 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.1■■■□□ 2.89
TOP3B-217ENST00000489581 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.03■■■□□ 2.88
TOP3B-217ENST00000489581 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.95■■■□□ 2.86
TOP3B-217ENST00000489581 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
TOP3B-217ENST00000489581 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.84■■■□□ 2.85
TOP3B-217ENST00000489581 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.78■■■□□ 2.84
TOP3B-217ENST00000489581 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.66■■■□□ 2.82
TOP3B-217ENST00000489581 WIZO95785 1651 aa32.65■■■□□ 2.82
TOP3B-217ENST00000489581 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.51■■■□□ 2.79
TOP3B-217ENST00000489581 WDR62O43379 1518 aa32.42■■■□□ 2.78
TOP3B-217ENST00000489581 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.35■■■□□ 2.77
TOP3B-217ENST00000489581 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.3■■■□□ 2.76
TOP3B-217ENST00000489581 TRIM41Q8WV44 630 aa32.26■■■□□ 2.75
TOP3B-217ENST00000489581 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
TOP3B-217ENST00000489581 CFTRP13569 1480 aa32.23■■■□□ 2.75
TOP3B-217ENST00000489581 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
TOP3B-217ENST00000489581 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
TOP3B-217ENST00000489581 OSCARQ8IYS5 282 aa31.97■■■□□ 2.71
TOP3B-217ENST00000489581 PRDM2Q13029 1718 aa31.92■■■□□ 2.7
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.84■■■□□ 2.69
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
TOP3B-217ENST00000489581 IFT140Q96RY7 1462 aa31.7■■■□□ 2.66
TOP3B-217ENST00000489581 TOPBP1Q92547 1522 aa31.66■■■□□ 2.66
TOP3B-217ENST00000489581 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
TOP3B-217ENST00000489581 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
TOP3B-217ENST00000489581 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.57■■■□□ 2.64
TOP3B-217ENST00000489581 ABCC8Q09428 1581 aa31.55■■■□□ 2.64
TOP3B-217ENST00000489581 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.51■■■□□ 2.63
TOP3B-217ENST00000489581 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGEF11O15085 1522 aa31.44■■■□□ 2.62
TOP3B-217ENST00000489581 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.4■■■□□ 2.624e-7■■■■□ 23
TOP3B-217ENST00000489581 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
TOP3B-217ENST00000489581 CHD1O14646 1710 aa31.35■■■□□ 2.61
TOP3B-217ENST00000489581 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
TOP3B-217ENST00000489581 FBLN2P98095 1184 aa31.29■■■□□ 2.6
TOP3B-217ENST00000489581 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.28■■■□□ 2.6
TOP3B-217ENST00000489581 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.25■■■□□ 2.59
TOP3B-217ENST00000489581 SOGA1O94964 1423 aa31.2■■■□□ 2.59
TOP3B-217ENST00000489581 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
TOP3B-217ENST00000489581 ARAP1Q96P48 1450 aa31.11■■■□□ 2.57
TOP3B-217ENST00000489581 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.1■■■□□ 2.57
TOP3B-217ENST00000489581 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.05■■■□□ 2.56
TOP3B-217ENST00000489581 CUX1P39880 1505 aa31.03■■■□□ 2.56
TOP3B-217ENST00000489581 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
TOP3B-217ENST00000489581 WDR97A6NE52 1622 aa30.99■■■□□ 2.55
TOP3B-217ENST00000489581 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
TOP3B-217ENST00000489581 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
TOP3B-217ENST00000489581 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.93■■■□□ 2.54
TOP3B-217ENST00000489581 GRIN2BQ13224 1484 aa30.92■■■□□ 2.54
TOP3B-217ENST00000489581 SYNJ1O43426 1573 aa30.9■■■□□ 2.54
TOP3B-217ENST00000489581 SYNJ2O15056 1496 aa30.84■■■□□ 2.53
TOP3B-217ENST00000489581 PBRM1Q86U86 1689 aa30.81■■■□□ 2.52
TOP3B-217ENST00000489581 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.8■■■□□ 2.52
TOP3B-217ENST00000489581 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
TOP3B-217ENST00000489581 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.72■■■□□ 2.51
TOP3B-217ENST00000489581 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.69■■■□□ 2.5
TOP3B-217ENST00000489581 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
TOP3B-217ENST00000489581 GRIN2AQ12879 1464 aa30.52■■■□□ 2.48
TOP3B-217ENST00000489581 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.49■■■□□ 2.47
TOP3B-217ENST00000489581 ADAMTS12P58397 1594 aa30.47■■■□□ 2.47
TOP3B-217ENST00000489581 TOP2BQ02880 1626 aa30.47■■■□□ 2.47
TOP3B-217ENST00000489581 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.47■■■□□ 2.47
TOP3B-217ENST00000489581 CEP170Q5SW79 1584 aa30.45■■■□□ 2.46
TOP3B-217ENST00000489581 NUP160Q12769 1436 aa30.42■■■□□ 2.46
TOP3B-217ENST00000489581 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.39■■■□□ 2.45
TOP3B-217ENST00000489581 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.32■■■□□ 2.44
TOP3B-217ENST00000489581 SHROOM2Q13796 1616 aa30.31■■■□□ 2.44
TOP3B-217ENST00000489581 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
TOP3B-217ENST00000489581 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TOP3B-217ENST00000489581 JPH4Q96JJ6 628 aa30.17■■■□□ 2.42
TOP3B-217ENST00000489581 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.08■■■□□ 2.41
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