RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488949.1

RAB22A-202, Transcript of RAB22A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3

Gene RAB22A, Length 1,032 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB22A-202ENST00000488949 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.82■■■■■ 7.33
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RAB22A-202ENST00000488949 SCRIBQ14160 1630 aa49.52■■■■■ 5.52
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RAB22A-202ENST00000488949 SMARCA2P51531 1590 aa46.97■■■■■ 5.11
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RAB22A-202ENST00000488949 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.52■■■■■ 4.88
RAB22A-202ENST00000488949 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.5■■■■■ 4.88
RAB22A-202ENST00000488949 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
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RAB22A-202ENST00000488949 CFTRP13569 1480 aa45.34■■■■■ 4.85
RAB22A-202ENST00000488949 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.18■■■■■ 4.82
RAB22A-202ENST00000488949 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.15■■■■■ 4.82
RAB22A-202ENST00000488949 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.12■■■■■ 4.81
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RAB22A-202ENST00000488949 WDR62O43379 1518 aa44.97■■■■■ 4.79
RAB22A-202ENST00000488949 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
RAB22A-202ENST00000488949 TOPBP1Q92547 1522 aa44.44■■■■■ 4.7
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RAB22A-202ENST00000488949 ABCC8Q09428 1581 aa44.31■■■■■ 4.68
RAB22A-202ENST00000488949 IFT140Q96RY7 1462 aa44.18■■■■■ 4.66
RAB22A-202ENST00000488949 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
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RAB22A-202ENST00000488949 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.89■■■■■ 4.62
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RAB22A-202ENST00000488949 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
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RAB22A-202ENST00000488949 SYNJ1O43426 1573 aa43.6■■■■■ 4.57
RAB22A-202ENST00000488949 WDR97A6NE52 1622 aa43.56■■■■■ 4.56
RAB22A-202ENST00000488949 TOP2BQ02880 1626 aa43.56■■■■■ 4.56
RAB22A-202ENST00000488949 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.56■■■■■ 4.56
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RAB22A-202ENST00000488949 CHD1O14646 1710 aa43.36■■■■■ 4.53
RAB22A-202ENST00000488949 GRIN2BQ13224 1484 aa43.35■■■■■ 4.53
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RAB22A-202ENST00000488949 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.32■■■■■ 4.53
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RAB22A-202ENST00000488949 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.28■■■■■ 4.52
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RAB22A-202ENST00000488949 CEP170Q5SW79 1584 aa42.64■■■■■ 4.42
RAB22A-202ENST00000488949 NUP160Q12769 1436 aa42.61■■■■■ 4.41
RAB22A-202ENST00000488949 IGF1RP08069 1367 aa42.56■■■■■ 4.4
RAB22A-202ENST00000488949 CUL7Q14999 1698 aa42.49■■■■■ 4.39
RAB22A-202ENST00000488949 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
RAB22A-202ENST00000488949 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.35■■■■■ 4.37
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RAB22A-202ENST00000488949 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.32■■■■■ 4.37
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