RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488610.5

MRPS2-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S2, human

TSL 3

Gene MRPS2, Length 928 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS2-208	ENST00000488610	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.6	■■■■■ 4.73
MRPS2-208	ENST00000488610	ABCC9	O60706	1549 aa		40.47	■■■■■ 4.07
MRPS2-208	ENST00000488610	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.05	■■■■■ 4
MRPS2-208	ENST00000488610	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38.29	■■■■□ 3.72
MRPS2-208	ENST00000488610	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.28	■■■■□ 3.72
MRPS2-208	ENST00000488610	NACAD	O15069	1562 aa		37.95	■■■■□ 3.67
MRPS2-208	ENST00000488610	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.83	■■■■□ 3.65
MRPS2-208	ENST00000488610	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.68	■■■■□ 3.62
MRPS2-208	ENST00000488610	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.49	■■■■□ 3.59
MRPS2-208	ENST00000488610	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.29	■■■■□ 3.56
MRPS2-208	ENST00000488610	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.29	■■■■□ 3.56
MRPS2-208	ENST00000488610	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.92	■■■■□ 3.5
MRPS2-208	ENST00000488610	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.75	■■■■□ 3.47
MRPS2-208	ENST00000488610	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.62	■■■■□ 3.45
MRPS2-208	ENST00000488610	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.56	■■■■□ 3.44
MRPS2-208	ENST00000488610	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.5	■■■■□ 3.43
MRPS2-208	ENST00000488610	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.43	■■■■□ 3.42
MRPS2-208	ENST00000488610	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.35	■■■■□ 3.41
MRPS2-208	ENST00000488610	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		35.22	■■■■□ 3.23
MRPS2-208	ENST00000488610	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.08	■■■■□ 3.21
MRPS2-208	ENST00000488610	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.97	■■■■□ 3.19
MRPS2-208	ENST00000488610	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.89	■■■■□ 3.18
MRPS2-208	ENST00000488610	CUX2	O14529	1486 aa		34.87	■■■■□ 3.17
MRPS2-208	ENST00000488610	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.85	■■■■□ 3.17
MRPS2-208	ENST00000488610	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.78	■■■■□ 3.16
MRPS2-208	ENST00000488610	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.76	■■■■□ 3.16
MRPS2-208	ENST00000488610	NES	P48681	1621 aa		34.73	■■■■□ 3.15
MRPS2-208	ENST00000488610	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.59	■■■■□ 3.13
MRPS2-208	ENST00000488610	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.58	■■■■□ 3.13
MRPS2-208	ENST00000488610	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.47	■■■■□ 3.11
MRPS2-208	ENST00000488610	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.43	■■■■□ 3.1
MRPS2-208	ENST00000488610	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.36	■■■■□ 3.09
MRPS2-208	ENST00000488610	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.29	■■■■□ 3.08
MRPS2-208	ENST00000488610	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.2	■■■■□ 3.07
MRPS2-208	ENST00000488610	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.1	■■■■□ 3.05
MRPS2-208	ENST00000488610	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34	■■■■□ 3.03
MRPS2-208	ENST00000488610	WIZ	O95785	1651 aa		34	■■■■□ 3.03
MRPS2-208	ENST00000488610	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.87	■■■■□ 3.01
MRPS2-208	ENST00000488610	WDR62	O43379	1518 aa		33.8	■■■■□ 3
MRPS2-208	ENST00000488610	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MRPS2-208	ENST00000488610	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.64	■■■□□ 2.98
MRPS2-208	ENST00000488610	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.63	■■■□□ 2.97
MRPS2-208	ENST00000488610	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
MRPS2-208	ENST00000488610	CFTR	P13569	1480 aa		33.56	■■■□□ 2.96
MRPS2-208	ENST00000488610	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
MRPS2-208	ENST00000488610	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
MRPS2-208	ENST00000488610	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.26	■■■□□ 2.91
MRPS2-208	ENST00000488610	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.16	■■■□□ 2.9
MRPS2-208	ENST00000488610	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.14	■■■□□ 2.89
MRPS2-208	ENST00000488610	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
MRPS2-208	ENST00000488610	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.99	■■■□□ 2.87
MRPS2-208	ENST00000488610	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.98	■■■□□ 2.87
MRPS2-208	ENST00000488610	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MRPS2-208	ENST00000488610	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MRPS2-208	ENST00000488610	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MRPS2-208	ENST00000488610	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
MRPS2-208	ENST00000488610	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MRPS2-208	ENST00000488610	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MRPS2-208	ENST00000488610	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MRPS2-208	ENST00000488610	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.74	■■■□□ 2.83	2e-7	■■■■■ 60.8
MRPS2-208	ENST00000488610	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
MRPS2-208	ENST00000488610	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
MRPS2-208	ENST00000488610	CHD1	O14646	1710 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MRPS2-208	ENST00000488610	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MRPS2-208	ENST00000488610	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MRPS2-208	ENST00000488610	FBLN2	P98095	1184 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MRPS2-208	ENST00000488610	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
MRPS2-208	ENST00000488610	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MRPS2-208	ENST00000488610	SOGA1	O94964	1423 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MRPS2-208	ENST00000488610	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MRPS2-208	ENST00000488610	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MRPS2-208	ENST00000488610	CUX1	P39880	1505 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MRPS2-208	ENST00000488610	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
MRPS2-208	ENST00000488610	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.26	■■■□□ 2.75
MRPS2-208	ENST00000488610	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MRPS2-208	ENST00000488610	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
MRPS2-208	ENST00000488610	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
MRPS2-208	ENST00000488610	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MRPS2-208	ENST00000488610	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.15	■■■□□ 2.74
MRPS2-208	ENST00000488610	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.11	■■■□□ 2.73
MRPS2-208	ENST00000488610	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MRPS2-208	ENST00000488610	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MRPS2-208	ENST00000488610	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MRPS2-208	ENST00000488610	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MRPS2-208	ENST00000488610	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
MRPS2-208	ENST00000488610	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.82	■■■□□ 2.68
MRPS2-208	ENST00000488610	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MRPS2-208	ENST00000488610	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.77	■■■□□ 2.68
MRPS2-208	ENST00000488610	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MRPS2-208	ENST00000488610	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.74	■■■□□ 2.67
MRPS2-208	ENST00000488610	NUP160	Q12769	1436 aa		31.7	■■■□□ 2.67
MRPS2-208	ENST00000488610	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.7	■■■□□ 2.66
MRPS2-208	ENST00000488610	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.7	■■■□□ 2.66
MRPS2-208	ENST00000488610	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.62	■■■□□ 2.65
MRPS2-208	ENST00000488610	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.57	■■■□□ 2.64
MRPS2-208	ENST00000488610	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.54	■■■□□ 2.64
MRPS2-208	ENST00000488610	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
MRPS2-208	ENST00000488610	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
MRPS2-208	ENST00000488610	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MRPS2-208	ENST00000488610	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.31	■■■□□ 2.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms