RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487380.5

ABCB6-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 6 (Langereis blood group), humanhuman

TSL 2

Gene ABCB6, Length 768 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6-208ENST00000487380 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.06■■■□□ 2.4
ABCB6-208ENST00000487380 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.71■■□□□ 1.87
ABCB6-208ENST00000487380 ABCC9O60706 1549 aa26.24■■□□□ 1.79
ABCB6-208ENST00000487380 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.23■■□□□ 1.63
ABCB6-208ENST00000487380 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.14■■□□□ 1.61
ABCB6-208ENST00000487380 NACADO15069 1562 aa25.07■■□□□ 1.6
ABCB6-208ENST00000487380 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ABCB6-208ENST00000487380 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
ABCB6-208ENST00000487380 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.76■■□□□ 1.55
ABCB6-208ENST00000487380 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.7■■□□□ 1.54
ABCB6-208ENST00000487380 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.521e-6■■■□□ 17.1
ABCB6-208ENST00000487380 SCRIBQ14160 1630 aa24.5■■□□□ 1.51
ABCB6-208ENST00000487380 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.42■■□□□ 1.5
ABCB6-208ENST00000487380 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCB6-208ENST00000487380 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.97■■□□□ 1.43
ABCB6-208ENST00000487380 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ABCB6-208ENST00000487380 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.7■■□□□ 1.38
ABCB6-208ENST00000487380 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.5■■□□□ 1.35
ABCB6-208ENST00000487380 SMARCA4P51532 1647 aa23.36■■□□□ 1.33
ABCB6-208ENST00000487380 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ABCB6-208ENST00000487380 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.23■■□□□ 1.31
ABCB6-208ENST00000487380 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.18■■□□□ 1.3
ABCB6-208ENST00000487380 SMARCA2P51531 1590 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCB6-208ENST00000487380 NCAPD3P42695 1498 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCB6-208ENST00000487380 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.03■■□□□ 1.28
ABCB6-208ENST00000487380 WIZO95785 1651 aa23.03■■□□□ 1.28
ABCB6-208ENST00000487380 HMGXB3Q12766 1538 aa23.03■■□□□ 1.28
ABCB6-208ENST00000487380 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ABCB6-208ENST00000487380 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ABCB6-208ENST00000487380 NESP48681 1621 aa22.71■■□□□ 1.23
ABCB6-208ENST00000487380 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ABCB6-208ENST00000487380 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.57■■□□□ 1.2
ABCB6-208ENST00000487380 ERCC6Q03468 1493 aa22.56■■□□□ 1.2
ABCB6-208ENST00000487380 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.54■■□□□ 1.2
ABCB6-208ENST00000487380 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.46■■□□□ 1.19
ABCB6-208ENST00000487380 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ABCB6-208ENST00000487380 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.46■■□□□ 1.19
ABCB6-208ENST00000487380 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.44■■□□□ 1.18
ABCB6-208ENST00000487380 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.36■■□□□ 1.17
ABCB6-208ENST00000487380 CFTRP13569 1480 aa22.34■■□□□ 1.17
ABCB6-208ENST00000487380 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ABCB6-208ENST00000487380 PRDM2Q13029 1718 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCB6-208ENST00000487380 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCB6-208ENST00000487380 CUX2O14529 1486 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCB6-208ENST00000487380 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCB6-208ENST00000487380 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCB6-208ENST00000487380 WDR62O43379 1518 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCB6-208ENST00000487380 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ABCB6-208ENST00000487380 TOPBP1Q92547 1522 aa21.91■■□□□ 1.1
ABCB6-208ENST00000487380 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCB6-208ENST00000487380 ABCC8Q09428 1581 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCB6-208ENST00000487380 CUX1P39880 1505 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCB6-208ENST00000487380 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ABCB6-208ENST00000487380 IFT140Q96RY7 1462 aa21.72■■□□□ 1.07
ABCB6-208ENST00000487380 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ABCB6-208ENST00000487380 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.71■■□□□ 1.07
ABCB6-208ENST00000487380 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.69■■□□□ 1.06
ABCB6-208ENST00000487380 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
ABCB6-208ENST00000487380 SYNJ1O43426 1573 aa21.63■■□□□ 1.05
ABCB6-208ENST00000487380 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ABCB6-208ENST00000487380 SOGA1O94964 1423 aa21.62■■□□□ 1.05
ABCB6-208ENST00000487380 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
ABCB6-208ENST00000487380 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.056e-7■■□□□ 13.3
ABCB6-208ENST00000487380 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.58■■□□□ 1.04
ABCB6-208ENST00000487380 TOP2BQ02880 1626 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCB6-208ENST00000487380 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ABCB6-208ENST00000487380 WDR97A6NE52 1622 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCB6-208ENST00000487380 PBRM1Q86U86 1689 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCB6-208ENST00000487380 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCB6-208ENST00000487380 CHD1O14646 1710 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCB6-208ENST00000487380 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCB6-208ENST00000487380 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCB6-208ENST00000487380 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCB6-208ENST00000487380 GRIN2BQ13224 1484 aa21.35■■□□□ 1.01
ABCB6-208ENST00000487380 FBLN2P98095 1184 aa21.35■■□□□ 1.01
ABCB6-208ENST00000487380 OSCARQ8IYS5 282 aa21.32■■□□□ 1
ABCB6-208ENST00000487380 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
ABCB6-208ENST00000487380 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
ABCB6-208ENST00000487380 SYNJ2O15056 1496 aa21.2■□□□□ 0.98
ABCB6-208ENST00000487380 ADAMTS12P58397 1594 aa21.2■□□□□ 0.98
ABCB6-208ENST00000487380 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.15■□□□□ 0.98
ABCB6-208ENST00000487380 KIF27Q86VH2 1401 aa21.12■□□□□ 0.97
ABCB6-208ENST00000487380 TRIM41Q8WV44 630 aa21.12■□□□□ 0.97
ABCB6-208ENST00000487380 GRIN2AQ12879 1464 aa21.1■□□□□ 0.97
ABCB6-208ENST00000487380 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.1■□□□□ 0.97
ABCB6-208ENST00000487380 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.09■□□□□ 0.97
ABCB6-208ENST00000487380 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.09■□□□□ 0.97
ABCB6-208ENST00000487380 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.09■□□□□ 0.97
ABCB6-208ENST00000487380 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.08■□□□□ 0.96
ABCB6-208ENST00000487380 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.08■□□□□ 0.96
ABCB6-208ENST00000487380 CEP170Q5SW79 1584 aa21.05■□□□□ 0.96
ABCB6-208ENST00000487380 ARHGEF11O15085 1522 aa21.04■□□□□ 0.96
ABCB6-208ENST00000487380 IGF1RP08069 1367 aa21.04■□□□□ 0.96
ABCB6-208ENST00000487380 CUL7Q14999 1698 aa21.01■□□□□ 0.95
ABCB6-208ENST00000487380 NUP160Q12769 1436 aa20.97■□□□□ 0.95
ABCB6-208ENST00000487380 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.93■□□□□ 0.94
ABCB6-208ENST00000487380 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.89■□□□□ 0.94
ABCB6-208ENST00000487380 ARAP1Q96P48 1450 aa20.89■□□□□ 0.94
ABCB6-208ENST00000487380 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.89■□□□□ 0.93
ABCB6-208ENST00000487380 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.87■□□□□ 0.93
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