RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487201.1

RHBDF1-210, Transcript of rhomboid 5 homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene RHBDF1, Length 1,708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1-210ENST00000487201 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.17■■■■■ 6.26
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RHBDF1-210ENST00000487201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.03■■■■■ 4.8
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RHBDF1-210ENST00000487201 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.98■■■■■ 4.79
RHBDF1-210ENST00000487201 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.88■■■■■ 4.77
RHBDF1-210ENST00000487201 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.82■■■■■ 4.77
RHBDF1-210ENST00000487201 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.11■■■■■ 4.65
RHBDF1-210ENST00000487201 SCRIBQ14160 1630 aa43.84■■■■■ 4.61
RHBDF1-210ENST00000487201 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.72■■■■■ 4.59
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RHBDF1-210ENST00000487201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.24■■■■■ 4.35
RHBDF1-210ENST00000487201 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.2■■■■■ 4.35
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RHBDF1-210ENST00000487201 SMARCA2P51531 1590 aa41.57■■■■■ 4.25
RHBDF1-210ENST00000487201 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.57■■■■■ 4.24
RHBDF1-210ENST00000487201 NCAPD3P42695 1498 aa41.56■■■■■ 4.24
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RHBDF1-210ENST00000487201 HMGXB3Q12766 1538 aa41.39■■■■■ 4.22
RHBDF1-210ENST00000487201 WIZO95785 1651 aa41.36■■■■■ 4.21
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RHBDF1-210ENST00000487201 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.42■■■■■ 4.06
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RHBDF1-210ENST00000487201 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.35■■■■■ 4.05
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RHBDF1-210ENST00000487201 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.07■■■■■ 4.01
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RHBDF1-210ENST00000487201 CUX2O14529 1486 aa39.59■■■■□ 3.93
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RHBDF1-210ENST00000487201 ABCC8Q09428 1581 aa39.25■■■■□ 3.87
RHBDF1-210ENST00000487201 CUX1P39880 1505 aa39.18■■■■□ 3.86
RHBDF1-210ENST00000487201 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
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RHBDF1-210ENST00000487201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.95■■■■□ 3.83
RHBDF1-210ENST00000487201 SYNJ1O43426 1573 aa38.95■■■■□ 3.83
RHBDF1-210ENST00000487201 IFT140Q96RY7 1462 aa38.94■■■■□ 3.82
RHBDF1-210ENST00000487201 TOP2BQ02880 1626 aa38.91■■■■□ 3.82
RHBDF1-210ENST00000487201 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.91■■■■□ 3.82
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RHBDF1-210ENST00000487201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.85■■■■□ 3.81
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RHBDF1-210ENST00000487201 WDR97A6NE52 1622 aa38.68■■■■□ 3.78
RHBDF1-210ENST00000487201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
RHBDF1-210ENST00000487201 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.62■■■■□ 3.774e-7■■■■■ 57.7
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RHBDF1-210ENST00000487201 PBRM1Q86U86 1689 aa38.33■■■■□ 3.73
RHBDF1-210ENST00000487201 GRIN2BQ13224 1484 aa38.32■■■■□ 3.72
RHBDF1-210ENST00000487201 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.25■■■■□ 3.71
RHBDF1-210ENST00000487201 TRIM41Q8WV44 630 aa38.24■■■■□ 3.71
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RHBDF1-210ENST00000487201 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.12■■■■□ 3.69
RHBDF1-210ENST00000487201 KIF27Q86VH2 1401 aa38.12■■■■□ 3.69
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RHBDF1-210ENST00000487201 SYNJ2O15056 1496 aa38.05■■■■□ 3.68
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RHBDF1-210ENST00000487201 NUP160Q12769 1436 aa37.68■■■■□ 3.62
RHBDF1-210ENST00000487201 EEA1Q15075 1411 aa37.58■■■■□ 3.61
RHBDF1-210ENST00000487201 PRXQ9BXM0 1461 aa37.54■■■■□ 3.6
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RHBDF1-210ENST00000487201 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.51■■■■□ 3.6
RHBDF1-210ENST00000487201 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
RHBDF1-210ENST00000487201 ARHGEF11O15085 1522 aa37.45■■■■□ 3.59
RHBDF1-210ENST00000487201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.43■■■■□ 3.58
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