RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486447.1

CRIPT-202, Transcript of CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain, humanhuman

TSL 5

Gene CRIPT, Length 1,724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIPT-202ENST00000486447 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.69■■■■■ 5.22
CRIPT-202ENST00000486447 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.06■■■■■ 4.32
CRIPT-202ENST00000486447 ABCC9O60706 1549 aa41.06■■■■■ 4.16
CRIPT-202ENST00000486447 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.91■■■■□ 3.98
CRIPT-202ENST00000486447 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
CRIPT-202ENST00000486447 NACADO15069 1562 aa39.53■■■■□ 3.92
CRIPT-202ENST00000486447 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.49■■■■□ 3.91
CRIPT-202ENST00000486447 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.38■■■■□ 3.9
CRIPT-202ENST00000486447 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.38■■■■□ 3.89
CRIPT-202ENST00000486447 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.61■■■■□ 3.77
CRIPT-202ENST00000486447 SCRIBQ14160 1630 aa38.59■■■■□ 3.77
CRIPT-202ENST00000486447 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.54■■■■□ 3.76
CRIPT-202ENST00000486447 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.37■■■■□ 3.73
CRIPT-202ENST00000486447 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.1■■■■□ 3.69
CRIPT-202ENST00000486447 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.48■■■■□ 3.59
CRIPT-202ENST00000486447 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
CRIPT-202ENST00000486447 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.22■■■■□ 3.55
CRIPT-202ENST00000486447 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.08■■■■□ 3.53
CRIPT-202ENST00000486447 SMARCA4P51532 1647 aa36.88■■■■□ 3.5
CRIPT-202ENST00000486447 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
CRIPT-202ENST00000486447 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.82■■■■□ 3.49
CRIPT-202ENST00000486447 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.66■■■■□ 3.46
CRIPT-202ENST00000486447 NCAPD3P42695 1498 aa36.55■■■■□ 3.44
CRIPT-202ENST00000486447 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CRIPT-202ENST00000486447 SMARCA2P51531 1590 aa36.53■■■■□ 3.44
CRIPT-202ENST00000486447 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.48■■■■□ 3.43
CRIPT-202ENST00000486447 WIZO95785 1651 aa36.42■■■■□ 3.42
CRIPT-202ENST00000486447 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CRIPT-202ENST00000486447 HMGXB3Q12766 1538 aa36.32■■■■□ 3.41
CRIPT-202ENST00000486447 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
CRIPT-202ENST00000486447 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
CRIPT-202ENST00000486447 NESP48681 1621 aa35.66■■■■□ 3.3
CRIPT-202ENST00000486447 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.66■■■■□ 3.3
CRIPT-202ENST00000486447 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.55■■■■□ 3.28
CRIPT-202ENST00000486447 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.45■■■■□ 3.27
CRIPT-202ENST00000486447 CFTRP13569 1480 aa35.39■■■■□ 3.26
CRIPT-202ENST00000486447 ERCC6Q03468 1493 aa35.29■■■■□ 3.24
CRIPT-202ENST00000486447 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.26■■■■□ 3.24
CRIPT-202ENST00000486447 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.13■■■■□ 3.21
CRIPT-202ENST00000486447 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.11■■■■□ 3.21
CRIPT-202ENST00000486447 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.01■■■■□ 3.19
CRIPT-202ENST00000486447 PRDM2Q13029 1718 aa34.96■■■■□ 3.19
CRIPT-202ENST00000486447 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
CRIPT-202ENST00000486447 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.87■■■■□ 3.17
CRIPT-202ENST00000486447 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
CRIPT-202ENST00000486447 WDR62O43379 1518 aa34.72■■■■□ 3.15
CRIPT-202ENST00000486447 CUX2O14529 1486 aa34.71■■■■□ 3.15
CRIPT-202ENST00000486447 TOPBP1Q92547 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
CRIPT-202ENST00000486447 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.52■■■■□ 3.12
CRIPT-202ENST00000486447 ABCC8Q09428 1581 aa34.52■■■■□ 3.12
CRIPT-202ENST00000486447 CUX1P39880 1505 aa34.5■■■■□ 3.11
CRIPT-202ENST00000486447 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.42■■■■□ 3.1
CRIPT-202ENST00000486447 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
CRIPT-202ENST00000486447 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.31■■■■□ 3.08
CRIPT-202ENST00000486447 SYNJ1O43426 1573 aa34.3■■■■□ 3.08
CRIPT-202ENST00000486447 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.26■■■■□ 3.07
CRIPT-202ENST00000486447 IFT140Q96RY7 1462 aa34.25■■■■□ 3.07
CRIPT-202ENST00000486447 SOGA1O94964 1423 aa34.24■■■■□ 3.07
CRIPT-202ENST00000486447 TOP2BQ02880 1626 aa34.23■■■■□ 3.07
CRIPT-202ENST00000486447 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.19■■■■□ 3.06
CRIPT-202ENST00000486447 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
CRIPT-202ENST00000486447 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CRIPT-202ENST00000486447 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CRIPT-202ENST00000486447 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.05■■■■□ 3.04
CRIPT-202ENST00000486447 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.96■■■■□ 3.03
CRIPT-202ENST00000486447 TRIM41Q8WV44 630 aa33.94■■■■□ 3.02
CRIPT-202ENST00000486447 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
CRIPT-202ENST00000486447 WDR97A6NE52 1622 aa33.9■■■■□ 3.02
CRIPT-202ENST00000486447 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.82■■■■□ 3
CRIPT-202ENST00000486447 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.82■■■■□ 3
CRIPT-202ENST00000486447 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.75■■■□□ 2.99
CRIPT-202ENST00000486447 GRIN2BQ13224 1484 aa33.73■■■□□ 2.99
CRIPT-202ENST00000486447 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.67■■■□□ 2.98
CRIPT-202ENST00000486447 KIF27Q86VH2 1401 aa33.64■■■□□ 2.97
CRIPT-202ENST00000486447 PBRM1Q86U86 1689 aa33.61■■■□□ 2.97
CRIPT-202ENST00000486447 FBLN2P98095 1184 aa33.61■■■□□ 2.97
CRIPT-202ENST00000486447 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.59■■■□□ 2.97
CRIPT-202ENST00000486447 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
CRIPT-202ENST00000486447 IGF1RP08069 1367 aa33.54■■■□□ 2.96
CRIPT-202ENST00000486447 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.53■■■□□ 2.96
CRIPT-202ENST00000486447 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
CRIPT-202ENST00000486447 OSCARQ8IYS5 282 aa33.48■■■□□ 2.95
CRIPT-202ENST00000486447 SYNJ2O15056 1496 aa33.46■■■□□ 2.95
CRIPT-202ENST00000486447 CHD1O14646 1710 aa33.42■■■□□ 2.94
CRIPT-202ENST00000486447 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.42■■■□□ 2.94
CRIPT-202ENST00000486447 ADAMTS12P58397 1594 aa33.41■■■□□ 2.94
CRIPT-202ENST00000486447 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.35■■■□□ 2.93
CRIPT-202ENST00000486447 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
CRIPT-202ENST00000486447 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.33■■■□□ 2.93
CRIPT-202ENST00000486447 GRIN2AQ12879 1464 aa33.31■■■□□ 2.92
CRIPT-202ENST00000486447 CUL7Q14999 1698 aa33.24■■■□□ 2.91
CRIPT-202ENST00000486447 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.24■■■□□ 2.91
CRIPT-202ENST00000486447 EEA1Q15075 1411 aa33.18■■■□□ 2.9
CRIPT-202ENST00000486447 NUP160Q12769 1436 aa33.15■■■□□ 2.9
CRIPT-202ENST00000486447 CEP170Q5SW79 1584 aa33.13■■■□□ 2.89
CRIPT-202ENST00000486447 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.12■■■□□ 2.89
CRIPT-202ENST00000486447 PRXQ9BXM0 1461 aa33.11■■■□□ 2.89
CRIPT-202ENST00000486447 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.08■■■□□ 2.89
CRIPT-202ENST00000486447 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.95■■■□□ 2.87
CRIPT-202ENST00000486447 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.92■■■□□ 2.86
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