RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486218.1

MYH9-210, Transcript of myosin heavy chain 9, humanhuman

TSL 3

Gene MYH9, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH9-210ENST00000486218 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.51■■■■■ 5.2
MYH9-210ENST00000486218 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.57■■■■■ 4.4
MYH9-210ENST00000486218 ABCC9O60706 1549 aa42.37■■■■■ 4.37
MYH9-210ENST00000486218 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.49■■■■■ 4.07
MYH9-210ENST00000486218 NACADO15069 1562 aa40.29■■■■■ 4.04
MYH9-210ENST00000486218 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.99■■■■□ 3.99
MYH9-210ENST00000486218 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.87■■■■□ 3.97
MYH9-210ENST00000486218 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.64■■■■□ 3.94
MYH9-210ENST00000486218 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.48■■■■□ 3.91
MYH9-210ENST00000486218 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
MYH9-210ENST00000486218 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.36■■■■□ 3.89
MYH9-210ENST00000486218 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.34■■■■□ 3.89
MYH9-210ENST00000486218 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.21■■■■□ 3.87
MYH9-210ENST00000486218 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.95■■■■□ 3.83
MYH9-210ENST00000486218 SCRIBQ14160 1630 aa38.67■■■■□ 3.78
MYH9-210ENST00000486218 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.3■■■■□ 3.72
MYH9-210ENST00000486218 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
MYH9-210ENST00000486218 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.24■■■■□ 3.71
MYH9-210ENST00000486218 NCAPD3P42695 1498 aa37.22■■■■□ 3.55
MYH9-210ENST00000486218 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.07■■■■□ 3.52
MYH9-210ENST00000486218 SMARCA2P51531 1590 aa37■■■■□ 3.51
MYH9-210ENST00000486218 SMARCA4P51532 1647 aa36.98■■■■□ 3.51
MYH9-210ENST00000486218 HMGXB3Q12766 1538 aa36.91■■■■□ 3.5
MYH9-210ENST00000486218 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
MYH9-210ENST00000486218 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.72■■■■□ 3.47
MYH9-210ENST00000486218 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
MYH9-210ENST00000486218 ERCC6Q03468 1493 aa36.65■■■■□ 3.46
MYH9-210ENST00000486218 CUX2O14529 1486 aa36.62■■■■□ 3.45
MYH9-210ENST00000486218 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.53■■■■□ 3.44
MYH9-210ENST00000486218 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.46■■■■□ 3.43
MYH9-210ENST00000486218 NESP48681 1621 aa36.4■■■■□ 3.42
MYH9-210ENST00000486218 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.31■■■■□ 3.4
MYH9-210ENST00000486218 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.17■■■■□ 3.38
MYH9-210ENST00000486218 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.09■■■■□ 3.37
MYH9-210ENST00000486218 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
MYH9-210ENST00000486218 WIZO95785 1651 aa36.03■■■■□ 3.36
MYH9-210ENST00000486218 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
MYH9-210ENST00000486218 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.89■■■■□ 3.34
MYH9-210ENST00000486218 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.77■■■■□ 3.32
MYH9-210ENST00000486218 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
MYH9-210ENST00000486218 CFTRP13569 1480 aa35.68■■■■□ 3.3
MYH9-210ENST00000486218 WDR62O43379 1518 aa35.66■■■■□ 3.3
MYH9-210ENST00000486218 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.65■■■■□ 3.3
MYH9-210ENST00000486218 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.6■■■■□ 3.29
MYH9-210ENST00000486218 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.3■■■■□ 3.24
MYH9-210ENST00000486218 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
MYH9-210ENST00000486218 PRDM2Q13029 1718 aa35.16■■■■□ 3.22
MYH9-210ENST00000486218 ABCC8Q09428 1581 aa35■■■■□ 3.19
MYH9-210ENST00000486218 OSCARQ8IYS5 282 aa34.99■■■■□ 3.19
MYH9-210ENST00000486218 IFT140Q96RY7 1462 aa34.97■■■■□ 3.19
MYH9-210ENST00000486218 TOPBP1Q92547 1522 aa34.93■■■■□ 3.18
MYH9-210ENST00000486218 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.82■■■■□ 3.16
MYH9-210ENST00000486218 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
MYH9-210ENST00000486218 TRIM41Q8WV44 630 aa34.78■■■■□ 3.16
MYH9-210ENST00000486218 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
MYH9-210ENST00000486218 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
MYH9-210ENST00000486218 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
MYH9-210ENST00000486218 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.51■■■■□ 3.118e-7■■■■□ 22.2
MYH9-210ENST00000486218 SOGA1O94964 1423 aa34.47■■■■□ 3.11
MYH9-210ENST00000486218 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.39■■■■□ 3.1
MYH9-210ENST00000486218 WDR97A6NE52 1622 aa34.38■■■■□ 3.09
MYH9-210ENST00000486218 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.36■■■■□ 3.09
MYH9-210ENST00000486218 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
MYH9-210ENST00000486218 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
MYH9-210ENST00000486218 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
MYH9-210ENST00000486218 CUX1P39880 1505 aa34.33■■■■□ 3.09
MYH9-210ENST00000486218 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
MYH9-210ENST00000486218 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
MYH9-210ENST00000486218 ARHGEF11O15085 1522 aa34.31■■■■□ 3.08
MYH9-210ENST00000486218 FBLN2P98095 1184 aa34.27■■■■□ 3.08
MYH9-210ENST00000486218 CHD1O14646 1710 aa34.22■■■■□ 3.07
MYH9-210ENST00000486218 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
MYH9-210ENST00000486218 GRIN2BQ13224 1484 aa34.17■■■■□ 3.06
MYH9-210ENST00000486218 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.16■■■■□ 3.06
MYH9-210ENST00000486218 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
MYH9-210ENST00000486218 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.08■■■■□ 3.05
MYH9-210ENST00000486218 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.05■■■■□ 3.04
MYH9-210ENST00000486218 SYNJ2O15056 1496 aa34.04■■■■□ 3.04
MYH9-210ENST00000486218 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.04■■■■□ 3.04
MYH9-210ENST00000486218 SYNJ1O43426 1573 aa33.99■■■■□ 3.03
MYH9-210ENST00000486218 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.97■■■■□ 3.03
MYH9-210ENST00000486218 ARAP1Q96P48 1450 aa33.97■■■■□ 3.03
MYH9-210ENST00000486218 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.97■■■■□ 3.03
MYH9-210ENST00000486218 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.9■■■■□ 3.02
MYH9-210ENST00000486218 PBRM1Q86U86 1689 aa33.87■■■■□ 3.01
MYH9-210ENST00000486218 TOP2BQ02880 1626 aa33.85■■■■□ 3.01
MYH9-210ENST00000486218 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.82■■■■□ 3
MYH9-210ENST00000486218 GRIN2AQ12879 1464 aa33.69■■■□□ 2.98
MYH9-210ENST00000486218 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.66■■■□□ 2.98
MYH9-210ENST00000486218 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
MYH9-210ENST00000486218 ADAMTS12P58397 1594 aa33.64■■■□□ 2.98
MYH9-210ENST00000486218 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.63■■■□□ 2.97
MYH9-210ENST00000486218 NUP160Q12769 1436 aa33.62■■■□□ 2.97
MYH9-210ENST00000486218 CEP170Q5SW79 1584 aa33.48■■■□□ 2.95
MYH9-210ENST00000486218 SHROOM2Q13796 1616 aa33.38■■■□□ 2.93
MYH9-210ENST00000486218 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.34■■■□□ 2.93
MYH9-210ENST00000486218 JPH4Q96JJ6 628 aa33.29■■■□□ 2.92
MYH9-210ENST00000486218 KIF27Q86VH2 1401 aa33.28■■■□□ 2.92
MYH9-210ENST00000486218 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
MYH9-210ENST00000486218 IGF1RP08069 1367 aa33.23■■■□□ 2.91
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