RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.3■■■■■ 4.52
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.35■■■■□ 3.73
C7orf49-210ENST00000486115 ABCC9O60706 1549 aa37.09■■■■□ 3.53
C7orf49-210ENST00000486115 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
C7orf49-210ENST00000486115 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.99■■■■□ 3.35
C7orf49-210ENST00000486115 NACADO15069 1562 aa35.97■■■■□ 3.35
C7orf49-210ENST00000486115 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.91■■■■□ 3.34
C7orf49-210ENST00000486115 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.91■■■■□ 3.34
C7orf49-210ENST00000486115 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.89■■■■□ 3.34
C7orf49-210ENST00000486115 SCRIBQ14160 1630 aa34.99■■■■□ 3.19
C7orf49-210ENST00000486115 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.96■■■■□ 3.19
C7orf49-210ENST00000486115 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.72■■■■□ 3.15
C7orf49-210ENST00000486115 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.69■■■■□ 3.14
C7orf49-210ENST00000486115 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.55■■■■□ 3.12
C7orf49-210ENST00000486115 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
C7orf49-210ENST00000486115 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.63■■■□□ 2.97
C7orf49-210ENST00000486115 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
C7orf49-210ENST00000486115 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.57■■■□□ 2.96
C7orf49-210ENST00000486115 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.57■■■□□ 2.96
C7orf49-210ENST00000486115 SMARCA4P51532 1647 aa33.51■■■□□ 2.96
C7orf49-210ENST00000486115 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.34■■■□□ 2.93
C7orf49-210ENST00000486115 SMARCA2P51531 1590 aa33.26■■■□□ 2.92
C7orf49-210ENST00000486115 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.23■■■□□ 2.91
C7orf49-210ENST00000486115 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.19■■■□□ 2.9
C7orf49-210ENST00000486115 NCAPD3P42695 1498 aa33.17■■■□□ 2.9
C7orf49-210ENST00000486115 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
C7orf49-210ENST00000486115 HMGXB3Q12766 1538 aa33.07■■■□□ 2.88
C7orf49-210ENST00000486115 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
C7orf49-210ENST00000486115 WIZO95785 1651 aa32.99■■■□□ 2.87
C7orf49-210ENST00000486115 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
C7orf49-210ENST00000486115 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
C7orf49-210ENST00000486115 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.31■■■□□ 2.76
C7orf49-210ENST00000486115 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.24■■■□□ 2.75
C7orf49-210ENST00000486115 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.22■■■□□ 2.75
C7orf49-210ENST00000486115 NESP48681 1621 aa32.18■■■□□ 2.74
C7orf49-210ENST00000486115 CFTRP13569 1480 aa32.11■■■□□ 2.73
C7orf49-210ENST00000486115 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.04■■■□□ 2.72
C7orf49-210ENST00000486115 ERCC6Q03468 1493 aa32.01■■■□□ 2.71
C7orf49-210ENST00000486115 PRDM2Q13029 1718 aa31.87■■■□□ 2.69
C7orf49-210ENST00000486115 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.85■■■□□ 2.69
C7orf49-210ENST00000486115 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.81■■■□□ 2.68
C7orf49-210ENST00000486115 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.8■■■□□ 2.68
C7orf49-210ENST00000486115 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.67■■■□□ 2.66
C7orf49-210ENST00000486115 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
C7orf49-210ENST00000486115 WDR62O43379 1518 aa31.53■■■□□ 2.64
C7orf49-210ENST00000486115 CUX2O14529 1486 aa31.52■■■□□ 2.64
C7orf49-210ENST00000486115 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
C7orf49-210ENST00000486115 ABCC8Q09428 1581 aa31.46■■■□□ 2.63
C7orf49-210ENST00000486115 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.4■■■□□ 2.62
C7orf49-210ENST00000486115 TOPBP1Q92547 1522 aa31.38■■■□□ 2.61
C7orf49-210ENST00000486115 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
C7orf49-210ENST00000486115 CUX1P39880 1505 aa31.27■■■□□ 2.6
C7orf49-210ENST00000486115 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
C7orf49-210ENST00000486115 TOP2BQ02880 1626 aa31.14■■■□□ 2.58
C7orf49-210ENST00000486115 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.13■■■□□ 2.57
C7orf49-210ENST00000486115 IFT140Q96RY7 1462 aa31.13■■■□□ 2.57
C7orf49-210ENST00000486115 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.12■■■□□ 2.57
C7orf49-210ENST00000486115 SYNJ1O43426 1573 aa31.11■■■□□ 2.57
C7orf49-210ENST00000486115 SOGA1O94964 1423 aa31.03■■■□□ 2.56
C7orf49-210ENST00000486115 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
C7orf49-210ENST00000486115 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.96■■■□□ 2.55
C7orf49-210ENST00000486115 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.87■■■□□ 2.53
C7orf49-210ENST00000486115 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
C7orf49-210ENST00000486115 WDR97A6NE52 1622 aa30.86■■■□□ 2.53
C7orf49-210ENST00000486115 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
C7orf49-210ENST00000486115 TRIM41Q8WV44 630 aa30.8■■■□□ 2.52
C7orf49-210ENST00000486115 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
C7orf49-210ENST00000486115 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.76■■■□□ 2.513e-10■■■■□ 24.7
C7orf49-210ENST00000486115 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.69■■■□□ 2.5
C7orf49-210ENST00000486115 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.69■■■□□ 2.5
C7orf49-210ENST00000486115 GRIN2BQ13224 1484 aa30.65■■■□□ 2.5
C7orf49-210ENST00000486115 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.63■■■□□ 2.49
C7orf49-210ENST00000486115 KIF27Q86VH2 1401 aa30.6■■■□□ 2.49
C7orf49-210ENST00000486115 PBRM1Q86U86 1689 aa30.56■■■□□ 2.48
C7orf49-210ENST00000486115 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
C7orf49-210ENST00000486115 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.52■■■□□ 2.48
C7orf49-210ENST00000486115 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.52■■■□□ 2.48
C7orf49-210ENST00000486115 SYNJ2O15056 1496 aa30.39■■■□□ 2.46
C7orf49-210ENST00000486115 ADAMTS12P58397 1594 aa30.38■■■□□ 2.45
C7orf49-210ENST00000486115 IGF1RP08069 1367 aa30.37■■■□□ 2.45
C7orf49-210ENST00000486115 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.37■■■□□ 2.45
C7orf49-210ENST00000486115 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
C7orf49-210ENST00000486115 FBLN2P98095 1184 aa30.34■■■□□ 2.45
C7orf49-210ENST00000486115 EEA1Q15075 1411 aa30.33■■■□□ 2.45
C7orf49-210ENST00000486115 CUL7Q14999 1698 aa30.33■■■□□ 2.45
C7orf49-210ENST00000486115 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.32■■■□□ 2.44
C7orf49-210ENST00000486115 CHD1O14646 1710 aa30.3■■■□□ 2.44
C7orf49-210ENST00000486115 OSCARQ8IYS5 282 aa30.26■■■□□ 2.43
C7orf49-210ENST00000486115 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.23■■■□□ 2.43
C7orf49-210ENST00000486115 GRIN2AQ12879 1464 aa30.23■■■□□ 2.43
C7orf49-210ENST00000486115 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.15■■■□□ 2.42
C7orf49-210ENST00000486115 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.11■■■□□ 2.41
C7orf49-210ENST00000486115 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
C7orf49-210ENST00000486115 PRXQ9BXM0 1461 aa30.08■■■□□ 2.41
C7orf49-210ENST00000486115 NUP160Q12769 1436 aa30.08■■■□□ 2.41
C7orf49-210ENST00000486115 CEP170Q5SW79 1584 aa30.03■■■□□ 2.4
C7orf49-210ENST00000486115 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.01■■■□□ 2.4
C7orf49-210ENST00000486115 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.01■■■□□ 2.39
C7orf49-210ENST00000486115 KIF21BO75037 1637 aa29.92■■■□□ 2.38
C7orf49-210ENST00000486115 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.91■■■□□ 2.38
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