RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485513.1

HLA-F-227, Transcript of major histocompatibility complex, class I, F, humanhuman

Gene HLA-F, Length 778 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-F-227ENST00000485513 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64■■■■■ 7.84
HLA-F-227ENST00000485513 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.32■■■■■ 6.77
HLA-F-227ENST00000485513 ABCC9O60706 1549 aa57.04■■■■■ 6.72
HLA-F-227ENST00000485513 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.44■■■■■ 6.31
HLA-F-227ENST00000485513 NACADO15069 1562 aa54.13■■■■■ 6.26
HLA-F-227ENST00000485513 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.92■■■■■ 6.22
HLA-F-227ENST00000485513 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.47■■■■■ 6.15
HLA-F-227ENST00000485513 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.24■■■■■ 6.11
HLA-F-227ENST00000485513 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.2■■■■■ 6.11
HLA-F-227ENST00000485513 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.15■■■■■ 6.1
HLA-F-227ENST00000485513 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.09■■■■■ 6.09
HLA-F-227ENST00000485513 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.89■■■■■ 6.06
HLA-F-227ENST00000485513 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.82■■■■■ 6.05
HLA-F-227ENST00000485513 SCRIBQ14160 1630 aa52.25■■■■■ 5.95
HLA-F-227ENST00000485513 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.16■■■■■ 5.94
HLA-F-227ENST00000485513 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.55■■■■■ 5.84
HLA-F-227ENST00000485513 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.51■■■■■ 5.84
HLA-F-227ENST00000485513 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.36■■■■■ 5.81
HLA-F-227ENST00000485513 NCAPD3P42695 1498 aa49.95■■■■■ 5.59
HLA-F-227ENST00000485513 SMARCA4P51532 1647 aa49.87■■■■■ 5.57
HLA-F-227ENST00000485513 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.84■■■■■ 5.57
HLA-F-227ENST00000485513 SMARCA2P51531 1590 aa49.74■■■■■ 5.55
HLA-F-227ENST00000485513 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.67■■■■■ 5.54
HLA-F-227ENST00000485513 HMGXB3Q12766 1538 aa49.62■■■■■ 5.53
HLA-F-227ENST00000485513 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
HLA-F-227ENST00000485513 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.38■■■■■ 5.5
HLA-F-227ENST00000485513 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.32■■■■■ 5.49
HLA-F-227ENST00000485513 ERCC6Q03468 1493 aa49.25■■■■■ 5.48
HLA-F-227ENST00000485513 NESP48681 1621 aa49.08■■■■■ 5.45
HLA-F-227ENST00000485513 CUX2O14529 1486 aa49.06■■■■■ 5.44
HLA-F-227ENST00000485513 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.8■■■■■ 5.4
HLA-F-227ENST00000485513 WIZO95785 1651 aa48.74■■■■■ 5.39
HLA-F-227ENST00000485513 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.71■■■■■ 5.39
HLA-F-227ENST00000485513 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
HLA-F-227ENST00000485513 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.51■■■■■ 5.36
HLA-F-227ENST00000485513 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.47■■■■■ 5.35
HLA-F-227ENST00000485513 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.46■■■■■ 5.35
HLA-F-227ENST00000485513 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.4■■■■■ 5.34
HLA-F-227ENST00000485513 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
HLA-F-227ENST00000485513 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.07■■■■■ 5.29
HLA-F-227ENST00000485513 CFTRP13569 1480 aa47.96■■■■■ 5.27
HLA-F-227ENST00000485513 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.94■■■■■ 5.26
HLA-F-227ENST00000485513 WDR62O43379 1518 aa47.93■■■■■ 5.26
HLA-F-227ENST00000485513 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.91■■■■■ 5.26
HLA-F-227ENST00000485513 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.59■■■■■ 5.21
HLA-F-227ENST00000485513 PRDM2Q13029 1718 aa47.53■■■■■ 5.2
HLA-F-227ENST00000485513 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
HLA-F-227ENST00000485513 TOPBP1Q92547 1522 aa47.04■■■■■ 5.12
HLA-F-227ENST00000485513 IFT140Q96RY7 1462 aa46.97■■■■■ 5.11
HLA-F-227ENST00000485513 ABCC8Q09428 1581 aa46.97■■■■■ 5.11
HLA-F-227ENST00000485513 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.89■■■■■ 5.1
HLA-F-227ENST00000485513 OSCARQ8IYS5 282 aa46.88■■■■■ 5.1
HLA-F-227ENST00000485513 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.85■■■■■ 5.09
HLA-F-227ENST00000485513 TRIM41Q8WV44 630 aa46.7■■■■■ 5.07
HLA-F-227ENST00000485513 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
HLA-F-227ENST00000485513 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
HLA-F-227ENST00000485513 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.04
HLA-F-227ENST00000485513 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.48■■■■■ 5.03
HLA-F-227ENST00000485513 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.47■■■■■ 5.03
HLA-F-227ENST00000485513 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.38■■■■■ 5.02
HLA-F-227ENST00000485513 SOGA1O94964 1423 aa46.37■■■■■ 5.01
HLA-F-227ENST00000485513 CUX1P39880 1505 aa46.32■■■■■ 5.01
HLA-F-227ENST00000485513 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.31■■■■■ 5
HLA-F-227ENST00000485513 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
HLA-F-227ENST00000485513 CHD1O14646 1710 aa46.23■■■■■ 4.99
HLA-F-227ENST00000485513 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
HLA-F-227ENST00000485513 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
HLA-F-227ENST00000485513 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
HLA-F-227ENST00000485513 WDR97A6NE52 1622 aa46.15■■■■■ 4.98
HLA-F-227ENST00000485513 FBLN2P98095 1184 aa46.13■■■■■ 4.98
HLA-F-227ENST00000485513 ARHGEF11O15085 1522 aa46.11■■■■■ 4.97
HLA-F-227ENST00000485513 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.01■■■■■ 4.96
HLA-F-227ENST00000485513 GRIN2BQ13224 1484 aa45.94■■■■■ 4.95
HLA-F-227ENST00000485513 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
HLA-F-227ENST00000485513 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.84■■■■■ 4.93
HLA-F-227ENST00000485513 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.82■■■■■ 4.92
HLA-F-227ENST00000485513 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.81■■■■■ 4.92
HLA-F-227ENST00000485513 PBRM1Q86U86 1689 aa45.78■■■■■ 4.92
HLA-F-227ENST00000485513 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.76■■■■■ 4.92
HLA-F-227ENST00000485513 SYNJ2O15056 1496 aa45.75■■■■■ 4.91
HLA-F-227ENST00000485513 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.72■■■■■ 4.91
HLA-F-227ENST00000485513 SYNJ1O43426 1573 aa45.71■■■■■ 4.91
HLA-F-227ENST00000485513 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.7■■■■■ 4.91
HLA-F-227ENST00000485513 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.69■■■■■ 4.91
HLA-F-227ENST00000485513 ARAP1Q96P48 1450 aa45.68■■■■■ 4.9
HLA-F-227ENST00000485513 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.66■■■■■ 4.9
HLA-F-227ENST00000485513 TOP2BQ02880 1626 aa45.66■■■■■ 4.9
HLA-F-227ENST00000485513 ADAMTS12P58397 1594 aa45.36■■■■■ 4.85
HLA-F-227ENST00000485513 GRIN2AQ12879 1464 aa45.35■■■■■ 4.85
HLA-F-227ENST00000485513 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.25■■■■■ 4.83
HLA-F-227ENST00000485513 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.25■■■■■ 4.83
HLA-F-227ENST00000485513 NUP160Q12769 1436 aa45.18■■■■■ 4.82
HLA-F-227ENST00000485513 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
HLA-F-227ENST00000485513 CEP170Q5SW79 1584 aa45.16■■■■■ 4.82
HLA-F-227ENST00000485513 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45■■■■■ 4.79
HLA-F-227ENST00000485513 SHROOM2Q13796 1616 aa44.94■■■■■ 4.79
HLA-F-227ENST00000485513 KIF27Q86VH2 1401 aa44.79■■■■■ 4.76
HLA-F-227ENST00000485513 JPH4Q96JJ6 628 aa44.73■■■■■ 4.75
HLA-F-227ENST00000485513 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
HLA-F-227ENST00000485513 IGF1RP08069 1367 aa44.72■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.1 ms