RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484847.5

IKZF1-214, Transcript of IKAROS family zinc finger 1, humanhuman

TSL 2

Gene IKZF1, Length 638 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1-214ENST00000484847 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.85■■■■■ 6.37
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IKZF1-214ENST00000484847 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.27■■■■■ 5
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IKZF1-214ENST00000484847 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.96■■■■■ 4.95
IKZF1-214ENST00000484847 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.72■■■■■ 4.91
IKZF1-214ENST00000484847 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
IKZF1-214ENST00000484847 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.37■■■■■ 4.85
IKZF1-214ENST00000484847 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.17■■■■■ 4.82
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IKZF1-214ENST00000484847 SCRIBQ14160 1630 aa44.64■■■■■ 4.74
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IKZF1-214ENST00000484847 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.41■■■■■ 4.7
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IKZF1-214ENST00000484847 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.65■■■■■ 4.58
IKZF1-214ENST00000484847 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.44■■■■■ 4.54
IKZF1-214ENST00000484847 SMARCA4P51532 1647 aa42.66■■■■■ 4.42
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IKZF1-214ENST00000484847 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.52■■■■■ 4.4
IKZF1-214ENST00000484847 SMARCA2P51531 1590 aa42.47■■■■■ 4.39
IKZF1-214ENST00000484847 HMGXB3Q12766 1538 aa42.33■■■■■ 4.37
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IKZF1-214ENST00000484847 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.24■■■■■ 4.35
IKZF1-214ENST00000484847 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
IKZF1-214ENST00000484847 WIZO95785 1651 aa41.77■■■■■ 4.28
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IKZF1-214ENST00000484847 NESP48681 1621 aa41.66■■■■■ 4.26
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IKZF1-214ENST00000484847 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.5■■■■■ 4.23
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IKZF1-214ENST00000484847 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.83■■■■■ 4.13
IKZF1-214ENST00000484847 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.83■■■■■ 4.13
IKZF1-214ENST00000484847 WDR62O43379 1518 aa40.73■■■■■ 4.11
IKZF1-214ENST00000484847 PRDM2Q13029 1718 aa40.6■■■■■ 4.09
IKZF1-214ENST00000484847 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.53■■■■■ 4.08
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IKZF1-214ENST00000484847 TOPBP1Q92547 1522 aa40.13■■■■■ 4.01
IKZF1-214ENST00000484847 ABCC8Q09428 1581 aa40.1■■■■■ 4.01
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IKZF1-214ENST00000484847 WDR97A6NE52 1622 aa39.4■■■■□ 3.9
IKZF1-214ENST00000484847 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.88
IKZF1-214ENST00000484847 TOP2BQ02880 1626 aa39.23■■■■□ 3.87
IKZF1-214ENST00000484847 CHD1O14646 1710 aa39.23■■■■□ 3.87
IKZF1-214ENST00000484847 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.22■■■■□ 3.87
IKZF1-214ENST00000484847 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.21■■■■□ 3.87
IKZF1-214ENST00000484847 SYNJ1O43426 1573 aa39.21■■■■□ 3.87
IKZF1-214ENST00000484847 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.2■■■■□ 3.87
IKZF1-214ENST00000484847 GRIN2BQ13224 1484 aa39.19■■■■□ 3.86
IKZF1-214ENST00000484847 FBLN2P98095 1184 aa39.15■■■■□ 3.86
IKZF1-214ENST00000484847 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
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IKZF1-214ENST00000484847 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.1■■■■□ 3.85
IKZF1-214ENST00000484847 PBRM1Q86U86 1689 aa39.06■■■■□ 3.84
IKZF1-214ENST00000484847 TRIM41Q8WV44 630 aa39.05■■■■□ 3.84
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IKZF1-214ENST00000484847 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
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IKZF1-214ENST00000484847 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.97■■■■□ 3.83
IKZF1-214ENST00000484847 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.97■■■■□ 3.83
IKZF1-214ENST00000484847 ARHGEF11O15085 1522 aa38.94■■■■□ 3.82
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IKZF1-214ENST00000484847 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.73■■■■□ 3.79
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IKZF1-214ENST00000484847 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.57■■■■□ 3.76
IKZF1-214ENST00000484847 NUP160Q12769 1436 aa38.54■■■■□ 3.76
IKZF1-214ENST00000484847 CEP170Q5SW79 1584 aa38.5■■■■□ 3.75
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IKZF1-214ENST00000484847 IGF1RP08069 1367 aa38.36■■■■□ 3.73
IKZF1-214ENST00000484847 CUL7Q14999 1698 aa38.31■■■■□ 3.72
IKZF1-214ENST00000484847 SHROOM2Q13796 1616 aa38.27■■■■□ 3.72
IKZF1-214ENST00000484847 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.23■■■■□ 3.71
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IKZF1-214ENST00000484847 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.14■■■■□ 3.7
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