RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484515.1

SMOX-208, Transcript of spermine oxidase, humanhuman

TSL 3

Gene SMOX, Length 900 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOX-208ENST00000484515 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.83■■■■■ 7.17
SMOX-208ENST00000484515 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.38■■■■■ 6.14
SMOX-208ENST00000484515 ABCC9O60706 1549 aa52.58■■■■■ 6.01
SMOX-208ENST00000484515 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.4■■■■■ 5.66
SMOX-208ENST00000484515 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.31■■■■■ 5.64
SMOX-208ENST00000484515 NACADO15069 1562 aa50.21■■■■■ 5.63
SMOX-208ENST00000484515 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.76■■■■■ 5.56
SMOX-208ENST00000484515 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.7■■■■■ 5.55
SMOX-208ENST00000484515 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.4■■■■■ 5.5
SMOX-208ENST00000484515 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.4■■■■■ 5.5
SMOX-208ENST00000484515 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.08■■■■■ 5.45
SMOX-208ENST00000484515 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.85■■■■■ 5.41
SMOX-208ENST00000484515 SCRIBQ14160 1630 aa48.78■■■■■ 5.4
SMOX-208ENST00000484515 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.46■■■■■ 5.35
SMOX-208ENST00000484515 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.19■■■■■ 5.31
SMOX-208ENST00000484515 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
SMOX-208ENST00000484515 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.54■■■■■ 5.2
SMOX-208ENST00000484515 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.23■■■■■ 5.15
SMOX-208ENST00000484515 SMARCA4P51532 1647 aa46.55■■■■■ 5.04
SMOX-208ENST00000484515 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.42■■■■■ 5.02
SMOX-208ENST00000484515 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.31■■■■■ 5
SMOX-208ENST00000484515 NCAPD3P42695 1498 aa46.27■■■■■ 5
SMOX-208ENST00000484515 SMARCA2P51531 1590 aa46.26■■■■■ 5
SMOX-208ENST00000484515 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.15■■■■■ 4.98
SMOX-208ENST00000484515 HMGXB3Q12766 1538 aa46.07■■■■■ 4.97
SMOX-208ENST00000484515 PEG3Q9GZU2 1588 aa46■■■■■ 4.95
SMOX-208ENST00000484515 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
SMOX-208ENST00000484515 WIZO95785 1651 aa45.72■■■■■ 4.91
SMOX-208ENST00000484515 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
SMOX-208ENST00000484515 NESP48681 1621 aa45.41■■■■■ 4.86
SMOX-208ENST00000484515 ERCC6Q03468 1493 aa45.36■■■■■ 4.85
SMOX-208ENST00000484515 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.2■■■■■ 4.83
SMOX-208ENST00000484515 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
SMOX-208ENST00000484515 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.95■■■■■ 4.79
SMOX-208ENST00000484515 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.94■■■■■ 4.78
SMOX-208ENST00000484515 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.88■■■■■ 4.78
SMOX-208ENST00000484515 CUX2O14529 1486 aa44.87■■■■■ 4.77
SMOX-208ENST00000484515 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
SMOX-208ENST00000484515 CFTRP13569 1480 aa44.6■■■■■ 4.73
SMOX-208ENST00000484515 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.59■■■■■ 4.73
SMOX-208ENST00000484515 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.5■■■■■ 4.71
SMOX-208ENST00000484515 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.48■■■■■ 4.71
SMOX-208ENST00000484515 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.46■■■■■ 4.71
SMOX-208ENST00000484515 PRDM2Q13029 1718 aa44.44■■■■■ 4.71
SMOX-208ENST00000484515 WDR62O43379 1518 aa44.29■■■■■ 4.68
SMOX-208ENST00000484515 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
SMOX-208ENST00000484515 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
SMOX-208ENST00000484515 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.86■■■■■ 4.61
SMOX-208ENST00000484515 TOPBP1Q92547 1522 aa43.75■■■■■ 4.59
SMOX-208ENST00000484515 ABCC8Q09428 1581 aa43.68■■■■■ 4.58
SMOX-208ENST00000484515 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.68■■■■■ 4.58
SMOX-208ENST00000484515 IFT140Q96RY7 1462 aa43.51■■■■■ 4.56
SMOX-208ENST00000484515 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
SMOX-208ENST00000484515 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
SMOX-208ENST00000484515 CUX1P39880 1505 aa43.31■■■■■ 4.52
SMOX-208ENST00000484515 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
SMOX-208ENST00000484515 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
SMOX-208ENST00000484515 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.23■■■■■ 4.51
SMOX-208ENST00000484515 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.2■■■■■ 4.51
SMOX-208ENST00000484515 SOGA1O94964 1423 aa43.17■■■■■ 4.5
SMOX-208ENST00000484515 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.12■■■■■ 4.49
SMOX-208ENST00000484515 OSCARQ8IYS5 282 aa43■■■■■ 4.47
SMOX-208ENST00000484515 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
SMOX-208ENST00000484515 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.46
SMOX-208ENST00000484515 WDR97A6NE52 1622 aa42.91■■■■■ 4.46
SMOX-208ENST00000484515 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.88■■■■■ 4.45
SMOX-208ENST00000484515 SYNJ1O43426 1573 aa42.87■■■■■ 4.45
SMOX-208ENST00000484515 TOP2BQ02880 1626 aa42.86■■■■■ 4.45
SMOX-208ENST00000484515 CHD1O14646 1710 aa42.85■■■■■ 4.45
SMOX-208ENST00000484515 FBLN2P98095 1184 aa42.76■■■■■ 4.44
SMOX-208ENST00000484515 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.73■■■■■ 4.43
SMOX-208ENST00000484515 PBRM1Q86U86 1689 aa42.73■■■■■ 4.43
SMOX-208ENST00000484515 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.72■■■■■ 4.43
SMOX-208ENST00000484515 GRIN2BQ13224 1484 aa42.68■■■■■ 4.42
SMOX-208ENST00000484515 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.68■■■■■ 4.42
SMOX-208ENST00000484515 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.64■■■■■ 4.42
SMOX-208ENST00000484515 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
SMOX-208ENST00000484515 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
SMOX-208ENST00000484515 TRIM41Q8WV44 630 aa42.46■■■■■ 4.39
SMOX-208ENST00000484515 SYNJ2O15056 1496 aa42.44■■■■■ 4.38
SMOX-208ENST00000484515 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
SMOX-208ENST00000484515 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
SMOX-208ENST00000484515 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
SMOX-208ENST00000484515 ARHGEF11O15085 1522 aa42.33■■■■■ 4.37
SMOX-208ENST00000484515 ADAMTS12P58397 1594 aa42.27■■■■■ 4.36
SMOX-208ENST00000484515 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.23■■■■■ 4.35
SMOX-208ENST00000484515 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.23■■■■■ 4.35
SMOX-208ENST00000484515 GRIN2AQ12879 1464 aa42.15■■■■■ 4.34
SMOX-208ENST00000484515 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.13■■■■■ 4.34
SMOX-208ENST00000484515 KIF27Q86VH2 1401 aa42.03■■■■■ 4.32
SMOX-208ENST00000484515 CEP170Q5SW79 1584 aa41.99■■■■■ 4.31
SMOX-208ENST00000484515 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.99■■■■■ 4.31
SMOX-208ENST00000484515 ARAP1Q96P48 1450 aa41.96■■■■■ 4.31
SMOX-208ENST00000484515 NUP160Q12769 1436 aa41.92■■■■■ 4.3
SMOX-208ENST00000484515 CUL7Q14999 1698 aa41.86■■■■■ 4.29
SMOX-208ENST00000484515 IGF1RP08069 1367 aa41.86■■■■■ 4.29
SMOX-208ENST00000484515 SHROOM2Q13796 1616 aa41.69■■■■■ 4.27
SMOX-208ENST00000484515 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.69■■■■■ 4.26
SMOX-208ENST00000484515 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.65■■■■■ 4.26
SMOX-208ENST00000484515 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.64■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms