RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484354.1

ACSS2-216, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 2, human

TSL 5

Gene ACSS2, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS2-216	ENST00000484354	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.34	■■■■■ 6.61
ACSS2-216	ENST00000484354	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.36	■■■■■ 5.65
ACSS2-216	ENST00000484354	ABCC9	O60706	1549 aa		50.11	■■■■■ 5.61
ACSS2-216	ENST00000484354	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.81	■■■■■ 5.24
ACSS2-216	ENST00000484354	NACAD	O15069	1562 aa		47.55	■■■■■ 5.2
ACSS2-216	ENST00000484354	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.52	■■■■■ 5.2
ACSS2-216	ENST00000484354	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.99	■■■■■ 5.11
ACSS2-216	ENST00000484354	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.77	■■■■■ 5.08
ACSS2-216	ENST00000484354	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.73	■■■■■ 5.07	1e-5	■□□□□ 8.6
ACSS2-216	ENST00000484354	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.65	■■■■■ 5.06
ACSS2-216	ENST00000484354	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.64	■■■■■ 5.06
ACSS2-216	ENST00000484354	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.53	■■■■■ 5.04
ACSS2-216	ENST00000484354	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.37	■■■■■ 5.01
ACSS2-216	ENST00000484354	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.99	■■■■■ 4.95
ACSS2-216	ENST00000484354	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.79	■■■■■ 4.92
ACSS2-216	ENST00000484354	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.24	■■■■■ 4.83
ACSS2-216	ENST00000484354	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.23	■■■■■ 4.83
ACSS2-216	ENST00000484354	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.09	■■■■■ 4.81
ACSS2-216	ENST00000484354	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.9	■■■■■ 4.62
ACSS2-216	ENST00000484354	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.87	■■■■■ 4.61
ACSS2-216	ENST00000484354	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.83	■■■■■ 4.61
ACSS2-216	ENST00000484354	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.74	■■■■■ 4.59
ACSS2-216	ENST00000484354	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.71	■■■■■ 4.59
ACSS2-216	ENST00000484354	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.61	■■■■■ 4.57
ACSS2-216	ENST00000484354	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.46	■■■■■ 4.55
ACSS2-216	ENST00000484354	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.43	■■■■■ 4.54
ACSS2-216	ENST00000484354	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.41	■■■■■ 4.54
ACSS2-216	ENST00000484354	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.26	■■■■■ 4.52
ACSS2-216	ENST00000484354	NES	P48681	1621 aa		43.13	■■■■■ 4.49
ACSS2-216	ENST00000484354	CUX2	O14529	1486 aa		43	■■■■■ 4.47
ACSS2-216	ENST00000484354	WIZ	O95785	1651 aa		42.91	■■■■■ 4.46
ACSS2-216	ENST00000484354	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.86	■■■■■ 4.45
ACSS2-216	ENST00000484354	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
ACSS2-216	ENST00000484354	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.63	■■■■■ 4.42
ACSS2-216	ENST00000484354	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.62	■■■■■ 4.41
ACSS2-216	ENST00000484354	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
ACSS2-216	ENST00000484354	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.57	■■■■■ 4.41
ACSS2-216	ENST00000484354	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ACSS2-216	ENST00000484354	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
ACSS2-216	ENST00000484354	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.24	■■■■■ 4.35
ACSS2-216	ENST00000484354	CFTR	P13569	1480 aa		42.19	■■■■■ 4.34
ACSS2-216	ENST00000484354	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.16	■■■■■ 4.34
ACSS2-216	ENST00000484354	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ACSS2-216	ENST00000484354	WDR62	O43379	1518 aa		42.1	■■■■■ 4.33
ACSS2-216	ENST00000484354	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.93	■■■■■ 4.3
ACSS2-216	ENST00000484354	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.75	■■■■■ 4.27
ACSS2-216	ENST00000484354	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.72	■■■■■ 4.27
ACSS2-216	ENST00000484354	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.37	■■■■■ 4.21
ACSS2-216	ENST00000484354	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.29	■■■■■ 4.2
ACSS2-216	ENST00000484354	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.29	■■■■■ 4.2
ACSS2-216	ENST00000484354	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.25	■■■■■ 4.19
ACSS2-216	ENST00000484354	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.19	■■■■■ 4.18
ACSS2-216	ENST00000484354	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.15	■■■■■ 4.18
ACSS2-216	ENST00000484354	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.13	■■■■■ 4.17
ACSS2-216	ENST00000484354	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.97	■■■■■ 4.15
ACSS2-216	ENST00000484354	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.97	■■■■■ 4.15
ACSS2-216	ENST00000484354	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.95	■■■■■ 4.15
ACSS2-216	ENST00000484354	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.93	■■■■■ 4.14
ACSS2-216	ENST00000484354	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.88	■■■■■ 4.13	1e-7	■■■□□ 17
ACSS2-216	ENST00000484354	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.83	■■■■■ 4.13
ACSS2-216	ENST00000484354	SOGA1	O94964	1423 aa		40.81	■■■■■ 4.12
ACSS2-216	ENST00000484354	CUX1	P39880	1505 aa		40.78	■■■■■ 4.12
ACSS2-216	ENST00000484354	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.78	■■■■■ 4.12
ACSS2-216	ENST00000484354	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
ACSS2-216	ENST00000484354	FBLN2	P98095	1184 aa		40.6	■■■■■ 4.09
ACSS2-216	ENST00000484354	CHD1	O14646	1710 aa		40.56	■■■■■ 4.08
ACSS2-216	ENST00000484354	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.54	■■■■■ 4.08
ACSS2-216	ENST00000484354	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ACSS2-216	ENST00000484354	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ACSS2-216	ENST00000484354	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.52	■■■■■ 4.08
ACSS2-216	ENST00000484354	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.48	■■■■■ 4.07
ACSS2-216	ENST00000484354	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.45	■■■■■ 4.07
ACSS2-216	ENST00000484354	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.41	■■■■■ 4.06
ACSS2-216	ENST00000484354	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
ACSS2-216	ENST00000484354	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
ACSS2-216	ENST00000484354	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.32	■■■■■ 4.05
ACSS2-216	ENST00000484354	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.32	■■■■■ 4.04
ACSS2-216	ENST00000484354	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.28	■■■■■ 4.04
ACSS2-216	ENST00000484354	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ACSS2-216	ENST00000484354	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ACSS2-216	ENST00000484354	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.21	■■■■■ 4.03
ACSS2-216	ENST00000484354	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.2	■■■■■ 4.03
ACSS2-216	ENST00000484354	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.2	■■■■■ 4.03
ACSS2-216	ENST00000484354	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.18	■■■■■ 4.02
ACSS2-216	ENST00000484354	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.18	■■■■■ 4.02
ACSS2-216	ENST00000484354	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.12	■■■■■ 4.01
ACSS2-216	ENST00000484354	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.08	■■■■■ 4.01
ACSS2-216	ENST00000484354	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.9	■■■■□ 3.98
ACSS2-216	ENST00000484354	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.88	■■■■□ 3.98
ACSS2-216	ENST00000484354	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.82	■■■■□ 3.97
ACSS2-216	ENST00000484354	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.81	■■■■□ 3.96
ACSS2-216	ENST00000484354	NUP160	Q12769	1436 aa		39.73	■■■■□ 3.95
ACSS2-216	ENST00000484354	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.71	■■■■□ 3.95
ACSS2-216	ENST00000484354	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.65	■■■■□ 3.94
ACSS2-216	ENST00000484354	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.55	■■■■□ 3.92
ACSS2-216	ENST00000484354	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.49	■■■■□ 3.91
ACSS2-216	ENST00000484354	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.47	■■■■□ 3.91
ACSS2-216	ENST00000484354	IGF1R	P08069	1367 aa		39.4	■■■■□ 3.9
ACSS2-216	ENST00000484354	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.35	■■■■□ 3.89
ACSS2-216	ENST00000484354	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.35	■■■■□ 3.89

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