RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483974.5

C4A-255, Transcript of complement C4A (Rodgers blood group), humanhuman

TSL 2

Gene C4A, Length 465 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4A-255ENST00000483974 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.15■■■■■ 5.78
C4A-255ENST00000483974 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.94■■■■■ 4.94
C4A-255ENST00000483974 ABCC9O60706 1549 aa45.57■■■■■ 4.88
C4A-255ENST00000483974 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.62■■■■■ 4.57
C4A-255ENST00000483974 NACADO15069 1562 aa43.37■■■■■ 4.53
C4A-255ENST00000483974 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43■■■■■ 4.47
C4A-255ENST00000483974 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.89■■■■■ 4.46
C4A-255ENST00000483974 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.59■■■■■ 4.41
C4A-255ENST00000483974 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.48■■■■■ 4.39
C4A-255ENST00000483974 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
C4A-255ENST00000483974 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.39■■■■■ 4.38
C4A-255ENST00000483974 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.37■■■■■ 4.37
C4A-255ENST00000483974 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.22■■■■■ 4.35
C4A-255ENST00000483974 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.89■■■■■ 4.3
C4A-255ENST00000483974 SCRIBQ14160 1630 aa41.7■■■■■ 4.27
C4A-255ENST00000483974 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.25■■■■■ 4.19
C4A-255ENST00000483974 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
C4A-255ENST00000483974 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.09■■■■■ 4.17
C4A-255ENST00000483974 NCAPD3P42695 1498 aa39.99■■■■□ 3.99
C4A-255ENST00000483974 SMARCA4P51532 1647 aa39.87■■■■□ 3.97
C4A-255ENST00000483974 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.85■■■■□ 3.97
C4A-255ENST00000483974 SMARCA2P51531 1590 aa39.84■■■■□ 3.97
C4A-255ENST00000483974 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.95
C4A-255ENST00000483974 HMGXB3Q12766 1538 aa39.75■■■■□ 3.95
C4A-255ENST00000483974 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.55■■■■□ 3.92
C4A-255ENST00000483974 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
C4A-255ENST00000483974 ERCC6Q03468 1493 aa39.43■■■■□ 3.9
C4A-255ENST00000483974 CUX2O14529 1486 aa39.36■■■■□ 3.89
C4A-255ENST00000483974 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.33■■■■□ 3.89
C4A-255ENST00000483974 NESP48681 1621 aa39.16■■■■□ 3.86
C4A-255ENST00000483974 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.11■■■■□ 3.85
C4A-255ENST00000483974 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.05■■■■□ 3.84
C4A-255ENST00000483974 WIZO95785 1651 aa38.9■■■■□ 3.82
C4A-255ENST00000483974 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.87■■■■□ 3.81
C4A-255ENST00000483974 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
C4A-255ENST00000483974 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.77■■■■□ 3.8
C4A-255ENST00000483974 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.77■■■■□ 3.8
C4A-255ENST00000483974 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
C4A-255ENST00000483974 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
C4A-255ENST00000483974 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.47■■■■□ 3.75
C4A-255ENST00000483974 WDR62O43379 1518 aa38.38■■■■□ 3.73
C4A-255ENST00000483974 CFTRP13569 1480 aa38.36■■■■□ 3.73
C4A-255ENST00000483974 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.36■■■■□ 3.73
C4A-255ENST00000483974 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.3■■■■□ 3.72
C4A-255ENST00000483974 PRDM2Q13029 1718 aa38.12■■■■□ 3.69
C4A-255ENST00000483974 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.99■■■■□ 3.67
C4A-255ENST00000483974 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
C4A-255ENST00000483974 ABCC8Q09428 1581 aa37.68■■■■□ 3.62
C4A-255ENST00000483974 IFT140Q96RY7 1462 aa37.61■■■■□ 3.61
C4A-255ENST00000483974 TOPBP1Q92547 1522 aa37.6■■■■□ 3.61
C4A-255ENST00000483974 OSCARQ8IYS5 282 aa37.55■■■■□ 3.6
C4A-255ENST00000483974 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.51■■■■□ 3.6
C4A-255ENST00000483974 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
C4A-255ENST00000483974 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
C4A-255ENST00000483974 TRIM41Q8WV44 630 aa37.32■■■■□ 3.56
C4A-255ENST00000483974 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
C4A-255ENST00000483974 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
C4A-255ENST00000483974 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
C4A-255ENST00000483974 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.1■■■■□ 3.53
C4A-255ENST00000483974 SOGA1O94964 1423 aa37.06■■■■□ 3.52
C4A-255ENST00000483974 WDR97A6NE52 1622 aa37.05■■■■□ 3.52
C4A-255ENST00000483974 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.01■■■■□ 3.51
C4A-255ENST00000483974 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37■■■■□ 3.51
C4A-255ENST00000483974 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
C4A-255ENST00000483974 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
C4A-255ENST00000483974 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
C4A-255ENST00000483974 CHD1O14646 1710 aa36.99■■■■□ 3.51
C4A-255ENST00000483974 CUX1P39880 1505 aa36.97■■■■□ 3.51
C4A-255ENST00000483974 ARHGEF11O15085 1522 aa36.9■■■■□ 3.5
C4A-255ENST00000483974 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
C4A-255ENST00000483974 FBLN2P98095 1184 aa36.84■■■■□ 3.49
C4A-255ENST00000483974 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
C4A-255ENST00000483974 GRIN2BQ13224 1484 aa36.75■■■■□ 3.47
C4A-255ENST00000483974 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.75■■■■□ 3.47
C4A-255ENST00000483974 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
C4A-255ENST00000483974 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.64■■■■□ 3.46
C4A-255ENST00000483974 PBRM1Q86U86 1689 aa36.64■■■■□ 3.46
C4A-255ENST00000483974 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.63■■■■□ 3.45
C4A-255ENST00000483974 SYNJ1O43426 1573 aa36.62■■■■□ 3.45
C4A-255ENST00000483974 SYNJ2O15056 1496 aa36.62■■■■□ 3.45
C4A-255ENST00000483974 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.57■■■■□ 3.44
C4A-255ENST00000483974 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.56■■■■□ 3.44
C4A-255ENST00000483974 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.55■■■■□ 3.44
C4A-255ENST00000483974 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
C4A-255ENST00000483974 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.52■■■■□ 3.44
C4A-255ENST00000483974 ARAP1Q96P48 1450 aa36.51■■■■□ 3.44
C4A-255ENST00000483974 TOP2BQ02880 1626 aa36.51■■■■□ 3.43
C4A-255ENST00000483974 GRIN2AQ12879 1464 aa36.26■■■■□ 3.4
C4A-255ENST00000483974 ADAMTS12P58397 1594 aa36.26■■■■□ 3.39
C4A-255ENST00000483974 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.23■■■■□ 3.39
C4A-255ENST00000483974 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.19■■■■□ 3.38
C4A-255ENST00000483974 NUP160Q12769 1436 aa36.14■■■■□ 3.38
C4A-255ENST00000483974 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
C4A-255ENST00000483974 CEP170Q5SW79 1584 aa36.07■■■■□ 3.37
C4A-255ENST00000483974 SHROOM2Q13796 1616 aa35.98■■■■□ 3.35
C4A-255ENST00000483974 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.89■■■■□ 3.34
C4A-255ENST00000483974 KIF27Q86VH2 1401 aa35.82■■■■□ 3.32
C4A-255ENST00000483974 CUL7Q14999 1698 aa35.76■■■■□ 3.32
C4A-255ENST00000483974 JPH4Q96JJ6 628 aa35.75■■■■□ 3.31
C4A-255ENST00000483974 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
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