RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483857.5

ABTB1-212, Transcript of ankyrin repeat and BTB domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ABTB1, Length 1,027 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABTB1-212ENST00000483857 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.05■■■■■ 5.28
ABTB1-212ENST00000483857 ABCC9O60706 1549 aa43.76■■■■■ 4.6
ABTB1-212ENST00000483857 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.31■■■■■ 4.52
ABTB1-212ENST00000483857 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.46■■■■■ 4.23
ABTB1-212ENST00000483857 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.39■■■■■ 4.22
ABTB1-212ENST00000483857 NACADO15069 1562 aa41.07■■■■■ 4.16
ABTB1-212ENST00000483857 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.79■■■■■ 4.12
ABTB1-212ENST00000483857 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.1
ABTB1-212ENST00000483857 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.44■■■■■ 4.06
ABTB1-212ENST00000483857 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.35■■■■■ 4.05
ABTB1-212ENST00000483857 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.23■■■■■ 4.03
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ABTB1-212ENST00000483857 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.71■■■■□ 3.95
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ABTB1-212ENST00000483857 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.49■■■■□ 3.91
ABTB1-212ENST00000483857 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.48■■■■□ 3.91
ABTB1-212ENST00000483857 SCRIBQ14160 1630 aa39.45■■■■□ 3.91
ABTB1-212ENST00000483857 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
ABTB1-212ENST00000483857 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.37■■■■□ 3.73
ABTB1-212ENST00000483857 CUX2O14529 1486 aa37.92■■■■□ 3.66
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ABTB1-212ENST00000483857 ERCC6Q03468 1493 aa37.86■■■■□ 3.65
ABTB1-212ENST00000483857 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.73■■■■□ 3.63
ABTB1-212ENST00000483857 SMARCA2P51531 1590 aa37.63■■■■□ 3.61
ABTB1-212ENST00000483857 HMGXB3Q12766 1538 aa37.6■■■■□ 3.61
ABTB1-212ENST00000483857 SMARCA4P51532 1647 aa37.58■■■■□ 3.61
ABTB1-212ENST00000483857 NESP48681 1621 aa37.44■■■■□ 3.58
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ABTB1-212ENST00000483857 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.21■■■■□ 3.55
ABTB1-212ENST00000483857 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
ABTB1-212ENST00000483857 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.14■■■■□ 3.54
ABTB1-212ENST00000483857 MROH2BQ7Z745 1585 aa37■■■■□ 3.51
ABTB1-212ENST00000483857 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.97■■■■□ 3.51
ABTB1-212ENST00000483857 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.93■■■■□ 3.5
ABTB1-212ENST00000483857 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.75■■■■□ 3.47
ABTB1-212ENST00000483857 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.66■■■■□ 3.46
ABTB1-212ENST00000483857 WDR62O43379 1518 aa36.57■■■■□ 3.44
ABTB1-212ENST00000483857 TRIM41Q8WV44 630 aa36.55■■■■□ 3.44
ABTB1-212ENST00000483857 WIZO95785 1651 aa36.53■■■■□ 3.44
ABTB1-212ENST00000483857 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.43■■■■□ 3.42
ABTB1-212ENST00000483857 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.34■■■■□ 3.41
ABTB1-212ENST00000483857 CFTRP13569 1480 aa36.23■■■■□ 3.39
ABTB1-212ENST00000483857 OSCARQ8IYS5 282 aa36.11■■■■□ 3.37
ABTB1-212ENST00000483857 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
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ABTB1-212ENST00000483857 PRDM2Q13029 1718 aa35.79■■■■□ 3.32
ABTB1-212ENST00000483857 IFT140Q96RY7 1462 aa35.72■■■■□ 3.31
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ABTB1-212ENST00000483857 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.66■■■■□ 3.3
ABTB1-212ENST00000483857 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.66■■■■□ 3.3
ABTB1-212ENST00000483857 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.66■■■■□ 3.3
ABTB1-212ENST00000483857 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.66■■■■□ 3.3
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ABTB1-212ENST00000483857 ARHGEF11O15085 1522 aa35.52■■■■□ 3.28
ABTB1-212ENST00000483857 ABCC8Q09428 1581 aa35.51■■■■□ 3.27
ABTB1-212ENST00000483857 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
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ABTB1-212ENST00000483857 CHD1O14646 1710 aa35.26■■■■□ 3.23
ABTB1-212ENST00000483857 FBLN2P98095 1184 aa35.21■■■■□ 3.23
ABTB1-212ENST00000483857 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
ABTB1-212ENST00000483857 ARAP1Q96P48 1450 aa35.14■■■■□ 3.22
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ABTB1-212ENST00000483857 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.08■■■■□ 3.21
ABTB1-212ENST00000483857 SOGA1O94964 1423 aa35.04■■■■□ 3.2
ABTB1-212ENST00000483857 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
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ABTB1-212ENST00000483857 WDR97A6NE52 1622 aa34.94■■■■□ 3.18
ABTB1-212ENST00000483857 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.92■■■■□ 3.18
ABTB1-212ENST00000483857 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.87■■■■□ 3.17
ABTB1-212ENST00000483857 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
ABTB1-212ENST00000483857 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
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ABTB1-212ENST00000483857 CUX1P39880 1505 aa34.81■■■■□ 3.16
ABTB1-212ENST00000483857 GRIN2BQ13224 1484 aa34.8■■■■□ 3.16
ABTB1-212ENST00000483857 SYNJ2O15056 1496 aa34.73■■■■□ 3.15
ABTB1-212ENST00000483857 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.61■■■■□ 3.13
ABTB1-212ENST00000483857 PBRM1Q86U86 1689 aa34.59■■■■□ 3.13
ABTB1-212ENST00000483857 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.5■■■■□ 3.11
ABTB1-212ENST00000483857 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.47■■■■□ 3.11
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ABTB1-212ENST00000483857 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.28■■■■□ 3.08
ABTB1-212ENST00000483857 ADAMTS12P58397 1594 aa34.27■■■■□ 3.08
ABTB1-212ENST00000483857 NUP160Q12769 1436 aa34.24■■■■□ 3.07
ABTB1-212ENST00000483857 CEP170Q5SW79 1584 aa34.22■■■■□ 3.07
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ABTB1-212ENST00000483857 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.16■■■■□ 3.06
ABTB1-212ENST00000483857 TOP2BQ02880 1626 aa34.13■■■■□ 3.05
ABTB1-212ENST00000483857 SHROOM2Q13796 1616 aa34.12■■■■□ 3.05
ABTB1-212ENST00000483857 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.12■■■■□ 3.05
ABTB1-212ENST00000483857 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.06■■■■□ 3.04
ABTB1-212ENST00000483857 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
ABTB1-212ENST00000483857 JPH4Q96JJ6 628 aa33.89■■■■□ 3.02
ABTB1-212ENST00000483857 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.86■■■■□ 3.01
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