RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483561.2

DENND4B-209, Transcript of DENN domain containing 4B, humanhuman

TSL 4

Gene DENND4B, Length 499 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4B-209ENST00000483561 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.95■■■■■ 6.71
DENND4B-209ENST00000483561 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.85■■■■■ 5.73
DENND4B-209ENST00000483561 ABCC9O60706 1549 aa50.31■■■■■ 5.64
DENND4B-209ENST00000483561 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.09■■■■■ 5.29
DENND4B-209ENST00000483561 NACADO15069 1562 aa47.88■■■■■ 5.26
DENND4B-209ENST00000483561 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.85■■■■■ 5.25
DENND4B-209ENST00000483561 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.36■■■■■ 5.17
DENND4B-209ENST00000483561 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
DENND4B-209ENST00000483561 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.18■■■■■ 5.14
DENND4B-209ENST00000483561 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.01■■■■■ 5.12
DENND4B-209ENST00000483561 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.93■■■■■ 5.1
DENND4B-209ENST00000483561 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.73■■■■■ 5.07
DENND4B-209ENST00000483561 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.65■■■■■ 5.06
DENND4B-209ENST00000483561 SCRIBQ14160 1630 aa46.46■■■■■ 5.03
DENND4B-209ENST00000483561 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.99■■■■■ 4.95
DENND4B-209ENST00000483561 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
DENND4B-209ENST00000483561 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.48■■■■■ 4.87
DENND4B-209ENST00000483561 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.2■■■■■ 4.83
DENND4B-209ENST00000483561 SMARCA4P51532 1647 aa44.34■■■■■ 4.69
DENND4B-209ENST00000483561 NCAPD3P42695 1498 aa44.18■■■■■ 4.66
DENND4B-209ENST00000483561 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.18■■■■■ 4.66
DENND4B-209ENST00000483561 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
DENND4B-209ENST00000483561 SMARCA2P51531 1590 aa44.06■■■■■ 4.64
DENND4B-209ENST00000483561 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.94■■■■■ 4.62
DENND4B-209ENST00000483561 HMGXB3Q12766 1538 aa43.93■■■■■ 4.62
DENND4B-209ENST00000483561 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.84■■■■■ 4.61
DENND4B-209ENST00000483561 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
DENND4B-209ENST00000483561 WIZO95785 1651 aa43.5■■■■■ 4.55
DENND4B-209ENST00000483561 NESP48681 1621 aa43.41■■■■■ 4.54
DENND4B-209ENST00000483561 ERCC6Q03468 1493 aa43.32■■■■■ 4.53
DENND4B-209ENST00000483561 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
DENND4B-209ENST00000483561 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.12■■■■■ 4.49
DENND4B-209ENST00000483561 CUX2O14529 1486 aa43■■■■■ 4.47
DENND4B-209ENST00000483561 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.92■■■■■ 4.46
DENND4B-209ENST00000483561 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
DENND4B-209ENST00000483561 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.88■■■■■ 4.45
DENND4B-209ENST00000483561 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
DENND4B-209ENST00000483561 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.8■■■■■ 4.44
DENND4B-209ENST00000483561 CFTRP13569 1480 aa42.52■■■■■ 4.4
DENND4B-209ENST00000483561 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.45■■■■■ 4.39
DENND4B-209ENST00000483561 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.43■■■■■ 4.38
DENND4B-209ENST00000483561 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.43■■■■■ 4.38
DENND4B-209ENST00000483561 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.41■■■■■ 4.38
DENND4B-209ENST00000483561 WDR62O43379 1518 aa42.33■■■■■ 4.37
DENND4B-209ENST00000483561 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.3■■■■■ 4.36
DENND4B-209ENST00000483561 PRDM2Q13029 1718 aa42.29■■■■■ 4.36
DENND4B-209ENST00000483561 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
DENND4B-209ENST00000483561 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
DENND4B-209ENST00000483561 TOPBP1Q92547 1522 aa41.71■■■■■ 4.27
DENND4B-209ENST00000483561 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.61■■■■■ 4.25
DENND4B-209ENST00000483561 ABCC8Q09428 1581 aa41.57■■■■■ 4.25
DENND4B-209ENST00000483561 IFT140Q96RY7 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
DENND4B-209ENST00000483561 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
DENND4B-209ENST00000483561 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
DENND4B-209ENST00000483561 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
DENND4B-209ENST00000483561 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
DENND4B-209ENST00000483561 CUX1P39880 1505 aa41.24■■■■■ 4.19
DENND4B-209ENST00000483561 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.2■■■■■ 4.19
DENND4B-209ENST00000483561 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.16■■■■■ 4.18
DENND4B-209ENST00000483561 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.186e-10■■■□□ 16.3
DENND4B-209ENST00000483561 OSCARQ8IYS5 282 aa41.14■■■■■ 4.18
DENND4B-209ENST00000483561 SOGA1O94964 1423 aa41.12■■■■■ 4.17
DENND4B-209ENST00000483561 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
DENND4B-209ENST00000483561 CHD1O14646 1710 aa40.93■■■■■ 4.14
DENND4B-209ENST00000483561 WDR97A6NE52 1622 aa40.89■■■■■ 4.14
DENND4B-209ENST00000483561 TRIM41Q8WV44 630 aa40.77■■■■■ 4.12
DENND4B-209ENST00000483561 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.75■■■■■ 4.11
DENND4B-209ENST00000483561 SYNJ1O43426 1573 aa40.75■■■■■ 4.11
DENND4B-209ENST00000483561 FBLN2P98095 1184 aa40.75■■■■■ 4.11
DENND4B-209ENST00000483561 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.75■■■■■ 4.11
DENND4B-209ENST00000483561 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
DENND4B-209ENST00000483561 TOP2BQ02880 1626 aa40.73■■■■■ 4.11
DENND4B-209ENST00000483561 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.69■■■■■ 4.1
DENND4B-209ENST00000483561 PBRM1Q86U86 1689 aa40.69■■■■■ 4.1
DENND4B-209ENST00000483561 GRIN2BQ13224 1484 aa40.68■■■■■ 4.1
DENND4B-209ENST00000483561 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
DENND4B-209ENST00000483561 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
DENND4B-209ENST00000483561 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.65■■■■■ 4.1
DENND4B-209ENST00000483561 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.64■■■■■ 4.1
DENND4B-209ENST00000483561 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.63■■■■■ 4.09
DENND4B-209ENST00000483561 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
DENND4B-209ENST00000483561 ARHGEF11O15085 1522 aa40.54■■■■■ 4.08
DENND4B-209ENST00000483561 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
DENND4B-209ENST00000483561 SYNJ2O15056 1496 aa40.47■■■■■ 4.07
DENND4B-209ENST00000483561 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.37■■■■■ 4.05
DENND4B-209ENST00000483561 ADAMTS12P58397 1594 aa40.27■■■■■ 4.04
DENND4B-209ENST00000483561 ARAP1Q96P48 1450 aa40.2■■■■■ 4.03
DENND4B-209ENST00000483561 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.2■■■■■ 4.03
DENND4B-209ENST00000483561 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.18■■■■■ 4.02
DENND4B-209ENST00000483561 GRIN2AQ12879 1464 aa40.18■■■■■ 4.02
DENND4B-209ENST00000483561 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.12■■■■■ 4.01
DENND4B-209ENST00000483561 CEP170Q5SW79 1584 aa40.06■■■■■ 4
DENND4B-209ENST00000483561 NUP160Q12769 1436 aa40■■■■□ 3.99
DENND4B-209ENST00000483561 KIF27Q86VH2 1401 aa39.9■■■■□ 3.98
DENND4B-209ENST00000483561 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.87■■■■□ 3.97
DENND4B-209ENST00000483561 IGF1RP08069 1367 aa39.83■■■■□ 3.97
DENND4B-209ENST00000483561 SHROOM2Q13796 1616 aa39.8■■■■□ 3.96
DENND4B-209ENST00000483561 CUL7Q14999 1698 aa39.76■■■■□ 3.96
DENND4B-209ENST00000483561 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.69■■■■□ 3.94
DENND4B-209ENST00000483561 JPH4Q96JJ6 628 aa39.6■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms